seq1 = pF1KE0417.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KE0417/gi568815582r_57054293.tfa (gi568815582r:57054293_57273854), 219562 bp

>pF1KE0417 762
>gi568815582r:57054293_57273854 (Chr16)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-226  (100981-101079)   100% ->
227-350  (101483-101606)   99% ->
351-482  (106631-106762)   100% ->
483-547  (109790-109854)   100% ->
548-762  (119348-119562)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGGAGGGGATGATGGTAACCTTATTATCAAAAAGAGGTTTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGGAGGGGATGATGGTAACCTTATTATCAAAAAGAGGTTTGTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGGCAGAACTAGATGAACGGCGCAAAAGGAGGCAAGAAGAATGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGGCAGAACTAGATGAACGGCGCAAAAGGAGGCAAGAAGAATGGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTTCGAAAACCTGAAGATCCAGAAG         AATGTCCAGAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 AAGTTCGAAAACCTGAAGATCCAGAAGGTA...CAGAATGTCCAGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTTATGACCCTCGATCTCTATATGAAAGGCTACAGGAACAGAAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100995 GTTTATGACCCTCGATCTCTATATGAAAGGCTACAGGAACAGAAGGACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCAGCAGGAGTACGAGGAACAGTTCAAATTCA         AAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101045 GAAGCAGCAGGAGTACGAGGAACAGTTCAAATTCAGTA...CAGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTAAGAGGCTTAGATGAAGATGAGACCAACTTCCTTGATGAGGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101489 TGGTAAGAGGCTTAGATGAAGATGAGACCAACTTCCTTGATGAGGTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGACAGCAGGAACTAATAGAAAAGCAACGAAGAGAAGAAGAACTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101539 CGACAGCAGGAACTAATAGAAAAGCAACGAAGAGAAGAAGAACTGAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGAAGGAATACAGAAA         TAACCTCAAGAAGGTTGGAATTT
        ||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101589 ACTGAAGGAATACAGAATATC...CAATAACCTCAAGAAGGTTGGAATTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCAAGAGAACAAGAAGGAAGTGGAAAAGAAACTGACTGTGAAGCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106654 CTCAAGAGAACAAGAAGGAAGTGGAAAAGAAACTGACTGTGAAGCCTATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAACCAAGAACAAGTTCTCCCAGGCGAAGCTGTTGGCAGGAGCTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106704 GAAACCAAGAACAAGTTCTCCCAGGCGAAGCTGTTGGCAGGAGCTGTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCATAAGAG         CTCAGAGAGTGGCAACAGTGTGAAAAGACTGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106754 GCATAAGAGGTT...CAGCTCAGAGAGTGGCAACAGTGTGAAAAGACTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AACCGGACCCTGAGCCAGATGACAAGAATCAAG         AGCCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109822 AACCGGACCCTGAGCCAGATGACAAGAATCAAGGTG...CAGAGCCCTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCCTGCAAGTCTCTCGGAAACACCTCCCTGAGTGGCCCCTCCATCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119356 TCCTGCAAGTCTCTCGGAAACACCTCCCTGAGTGGCCCCTCCATCCACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCCCTCTGCTGCAGTATGTATCGGCATCCTCCCAGGCCTGGGTGCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119406 CCCCTCTGCTGCAGTATGTATCGGCATCCTCCCAGGCCTGGGTGCCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGGGAGCAGCGACTCCGAGTCCAGCTCAGACAGCGAAGGCACCATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119456 CTGGGAGCAGCGACTCCGAGTCCAGCTCAGACAGCGAAGGCACCATCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCACCGGAAAGATTGTCTCCTCCATCTTCCGAACCAACACCTTCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119506 GCCACCGGAAAGATTGTCTCCTCCATCTTCCGAACCAACACCTTCCTCGA

    800     .
    756 GGCCCCC
        |||||||
 119556 GGCCCCC