seq1 = pF1KE0407.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KE0407/gi568815587r_83161914.tfa (gi568815587r:83161914_83385972), 224059 bp

>pF1KE0407 762
>gi568815587r:83161914_83385972 (Chr11)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-220  (105713-105832)   100% ->
221-324  (107144-107247)   100% ->
325-426  (111233-111334)   100% ->
427-468  (111981-112022)   100% ->
469-540  (112109-112180)   100% ->
541-594  (112273-112326)   100% ->
595-709  (119994-120108)   100% ->
710-762  (124007-124059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATAGTCGCCAGGCTTGGCGGCTCTTTCTCTCCCAAGGCAGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATAGTCGCCAGGCTTGGCGGCTCTTTCTCTCCCAAGGCAGAGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGTTGGGTTTCAAGGCCCCGCGGGCATTTCTCGCCGGCCCTGCGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGTTGGGTTTCAAGGCCCCGCGGGCATTTCTCGCCGGCCCTGCGGAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          AGTTCTTCACTACCACAACCAAGGAGGGATATGATAGGCGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...CAGAGTTCTTCACTACCACAACCAAGGAGGGATATGATAGGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAGTGGATATAACTCCTTTAGAACAAAGGAAATTAACTTTTGATACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105754 CCAGTGGATATAACTCCTTTAGAACAAAGGAAATTAACTTTTGATACCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCATTGGTTCAGGACTTGGAAACTCATG         GATTTGACAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105804 TGCATTGGTTCAGGACTTGGAAACTCATGGTG...CAGGATTTGACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACAAGCAGAAACAATTGTATCAGCGTTAACTGCTTTATCAAATGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107156 CACAAGCAGAAACAATTGTATCAGCGTTAACTGCTTTATCAAATGTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGATACTATCTATAAAGAGATGGTCACTCAAGCTCAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107206 CTGGATACTATCTATAAAGAGATGGTCACTCAAGCTCAACAGGTA...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  GAAATAACAGTACAACAGCTAATGGCTCATTTGGATGCTATCAGGAAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111232 GGAAATAACAGTACAACAGCTAATGGCTCATTTGGATGCTATCAGGAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATGGTCATCCTAGAGAAAAGTGAATTTGCAAATCTGAGAGCAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111282 ACATGGTCATCCTAGAGAAAAGTGAATTTGCAAATCTGAGAGCAGAGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAG         AAAATGAAAATTGAATTAGACCAAGTTAAGCAACAACT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111332 GAGGTG...TAGAAAATGAAAATTGAATTAGACCAAGTTAAGCAACAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AATG         CATGAAACCAGTCGAATCAGAGCAGATAATAAACTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112019 AATGGTA...AAGCATGAAACCAGTCGAATCAGAGCAGATAATAAACTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATATCAACTTAGAAAGGAGCAGAGTAACAGATATG         TTTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 112146 ATATCAACTTAGAAAGGAGCAGAGTAACAGATATGGTA...TAGTTTACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GATCAAGAAAAGCAACTTATGGAAACAACTACAGAATTTACAAAAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112279 GATCAAGAAAAGCAACTTATGGAAACAACTACAGAATTTACAAAAAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595        GATACTCAAACCAAAAGTATTATTTCAGAGACCAGTAATAAAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112329 A...CAGGATACTCAAACCAAAAGTATTATTTCAGAGACCAGTAATAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTGACGCTGAAATTGCTTCCTTAAAAACACTGATGGAATCTAACAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120037 TTGACGCTGAAATTGCTTCCTTAAAAACACTGATGGAATCTAACAAACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAGACAATTCGTTATCTTGCAG         CTTCGGTGTTTACTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 120087 GAGACAATTCGTTATCTTGCAGGTA...CAGCTTCGGTGTTTACTTGCCT

    800     .    :    .    :    .    :
    729 GGCAATAGCATTGGGATTTTATAGATTCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124026 GGCAATAGCATTGGGATTTTATAGATTCTGGAAG