seq1 = pF1KE0405.tfa, 894 bp
seq2 = pF1KE0405/gi568815589r_92285623.tfa (gi568815589r:92285623_92503407), 217785 bp

>pF1KE0405 894
>gi568815589r:92285623_92503407 (Chr9)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-268  (102223-102316)   100% ->
269-427  (110164-110322)   100% ->
428-630  (113352-113554)   100% ->
631-726  (117112-117207)   100% ->
727-894  (117618-117785)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACTCTGCAGTCTACACTTCTCCTGTTACTGCTTGTGCCTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGACTCTGCAGTCTACACTTCTCCTGTTACTGCTTGTGCCTCTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGCCAGCACCACCAACCCAGCAGGACTCACGCATTATCTATGATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGCCAGCACCACCAACCCAGCAGGACTCACGCATTATCTATGATTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAACAGATAATTTTGAAGAATCCATATTTAGCCAAGATTATGAGGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAACAGATAATTTTGAAGAATCCATATTTAGCCAAGATTATGAGGATAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCTGGATGGAAAAAATATTAAG         GAAAAAGAAACTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 TACCTGGATGGAAAAAATATTAAGGTA...TAGGAAAAAGAAACTGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATACCCAATGAGAAAAGTCTTCAATTACAAAAAGATGAGGCAATAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102240 AATACCCAATGAGAAAAGTCTTCAATTACAAAAAGATGAGGCAATAACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTACCTCCCAAGAAAGAAAATGATG         AAATGCCCACGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102290 CATTACCTCCCAAGAAAGAAAATGATGGTA...TAGAAATGCCCACGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCTGTGTGTTTGTTTAAGTGGCTCTGTATACTGTGAAGAAGTTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110178 CTGCTGTGTGTTTGTTTAAGTGGCTCTGTATACTGTGAAGAAGTTGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATGCTGTACCACCCTTACCAAAGGAATCAGCCTATCTTTACGCACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110228 TGATGCTGTACCACCCTTACCAAAGGAATCAGCCTATCTTTACGCACGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAACAAAATTAAAAAGCTGACTGCCAAAGATTTTGCAGACATAC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 110278 TCAACAAAATTAAAAAGCTGACTGCCAAAGATTTTGCAGACATACGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428     CTAACTTAAGAAGACTCGATTTTACAGGAAATTTGATAGAAGATAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110328 .TAGCTAACTTAAGAAGACTCGATTTTACAGGAAATTTGATAGAAGATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAAGATGGTACTTTTTCAAAACTTTCTCTGTTAGAAGAACTTTCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113398 AGAAGATGGTACTTTTTCAAAACTTTCTCTGTTAGAAGAACTTTCACTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAAAATCAACTACTAAAACTTCCAGTTCTTCCTCCCAAGCTCACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113448 CTGAAAATCAACTACTAAAACTTCCAGTTCTTCCTCCCAAGCTCACTTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTTAATGCAAAATACAACAAAATCAAGAGTAGGGGAATCAAAGCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113498 TTTAATGCAAAATACAACAAAATCAAGAGTAGGGGAATCAAAGCAAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATTCAAA         AAACTGAATAACCTCACCTTCCTCTACTTGGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113548 ATTCAAAGTA...CAGAAACTGAATAACCTCACCTTCCTCTACTTGGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATAATGCCCTGGAATCCGTGCCTCTTAATTTACCAGAAAGTCTACGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117146 ATAATGCCCTGGAATCCGTGCCTCTTAATTTACCAGAAAGTCTACGTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATTCATCTTCAG         TTCAACAACATAGCTTCAATTACAGATGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 117196 ATTCATCTTCAGGTA...CAGTTCAACAACATAGCTTCAATTACAGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACATTCTGCAAGGCTAATGACACCAGTTACATCCGGGACCGCATTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117647 CACATTCTGCAAGGCTAATGACACCAGTTACATCCGGGACCGCATTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGATACGCCTGGAGGGCAATCCAATCGTCCTGGGAAAGCATCCAAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117697 AGATACGCCTGGAGGGCAATCCAATCGTCCTGGGAAAGCATCCAAACAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    856 TTTATTTGCTTAAAAAGATTACCGATAGGGTCATACTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117747 TTTATTTGCTTAAAAAGATTACCGATAGGGTCATACTTT