seq1 = pF1KE0403.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KE0403/gi568815582r_8695955.tfa (gi568815582r:8695955_8896591), 200637 bp

>pF1KE0403 639
>gi568815582r:8695955_8896591 (Chr16)

(complement)

1-639  (100000-100637)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCCTTCTCCGAGCTGTGCGTAGGTTTCGGGGAAAAGCTGTGTG
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGCTGCCCTTCTCCGAGCTGTGCGTAGGTTTCGGGGAAAAGCTGTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGGGCCTCTCCATGGGCTGTGGTGCTGCAGTGGGCAGGAGGATCCTA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GGAAAGGCCTCTCCATGGGCTGTGGTGCTGCAGTGGGCAGGAGGATCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGGTGGGTGGGCAGCAGTTCACCCATCTCGAAGGAGAAACTACCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 AGAGGTGGGTGGGCAGCAGTTCACCCATCTCGAAGGAGAAACTACCAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGAGACTGAGAAATTCTGGATGTTTTACCGTTTTGATGCCATCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GCAGAGACTGAGAAATTCTGGATGTTTTACCGTTTTGATGCCATCAGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCGGGTTCCTGTCACGACTGAAGTTGGCACAGACTGCCCTGACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100199 CTTCGGGTTCCTGTCACGACTGAAGTTGGCACAGACTGCCCTGACAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGCTTTGCCACCAGGCTATTACTTGTACTCCCAGGGCCTCCTCACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 TAGCTTTGCCACCAGGCTATTACTTGTACTCCCAGGGCCTCCTCACTCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACACCGTGTGCCTCATGAGTGGGATATCGGGCTTTGCCCTGACCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 AACACCGTGTGCCTCATGAGTGGGATATCGGGCTTTGCCCTGACCATGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCTGGATGAGCTATTTCTTACGGAGACTGGTTGGTATCCTGTATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 GTGCTGGATGAGCTATTTCTTACGGAGACTGGTTGGTATCCTGTATCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGAGTCTGGCACCATGCTGCGGGTGGCCCATCTGAACTTCTGGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 ATGAGTCTGGCACCATGCTGCGGGTGGCCCATCTGAACTTCTGGGGCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGCAGGACACATACTGTCCCATGGCAGATGTGATTCCCCTGACAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 CGGCAGGACACATACTGTCCCATGGCAGATGTGATTCCCCTGACAGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAGGACCGGCCTCAGGAGATGTTTGTGCGTATCCAGCGGTACAGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 CAAGGACCGGCCTCAGGAGATGTTTGTGCGTATCCAGCGGTACAGTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACAGACCTTCTACGTCACCCTGCGCTATGGACGCATCCTGGACAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 AACAGACCTTCTACGTCACCCTGCGCTATGGACGCATCCTGGACAGAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .
    601 CGTTTCACACAGGTGTTTGGGGTACATCAGATGCTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100599 CGTTTCACACAGGTGTTTGGGGTACATCAGATGCTCAAG