seq1 = pF1KE0401.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KE0401/gi568815581f_5388863.tfa (gi568815581f:5388863_5589477), 200615 bp

>pF1KE0401 615
>gi568815581f:5388863_5589477 (Chr17)

1-615  (100001-100615)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTGGATCCAATGACCTACGAGGCCCAGTTCTTTGGCTTCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTGGATCCAATGACCTACGAGGCCCAGTTCTTTGGCTTCACGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAAACGTGCATGCTTCGGATCTACATTGCATTTCAAGACTACCTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAAACGTGCATGCTTCGGATCTACATTGCATTTCAAGACTACCTATTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGATGCAGGCCGTTGAACAGGTTATTCTGAAGAAGCTGGATGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTGATGCAGGCCGTTGAACAGGTTATTCTGAAGAAGCTGGATGGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGACTGTGACATTAGCCCAGTGCAGATTCGCAAATGCACAGAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAGACTGTGACATTAGCCCAGTGCAGATTCGCAAATGCACAGAGAAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTTTGCTTCATGAAAGGACATTTTGATAACCTTTTTAGCAAAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTTTGCTTCATGAAAGGACATTTTGATAACCTTTTTAGCAAAATGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACTGTTTTTGCAGCTGATTTTACGTATTCCCTCAAACATCTTGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACTGTTTTTGCAGCTGATTTTACGTATTCCCTCAAACATCTTGCTTCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAGATAAATGTAAGGAGACACCTTATAGTGAGGAAGATTTTCAGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAGATAAATGTAAGGAGACACCTTATAGTGAGGAAGATTTTCAGCATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGAAAGAAATTGAACAGTTACAGGAGAAGTACAAGACTGAATTATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGAAAGAAATTGAACAGTTACAGGAGAAGTACAAGACTGAATTATGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTAAGCAGGCCCTTCTTGCAGAATTAGAAGAGCAAAAAATTGTTCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTAAGCAGGCCCTTCTTGCAGAATTAGAAGAGCAAAAAATTGTTCAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAACTCAAACAGACGTTGACTTTCTTTGATGAGCTTCATAATGTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAACTCAAACAGACGTTGACTTTCTTTGATGAGCTTCATAATGTTGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGATCATGGGACTAGTGATTTTAGGGAGAGTTTAGTATCCCTGGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGATCATGGGACTAGTGATTTTAGGGAGAGTTTAGTATCCCTGGTTCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTCCAGAAAACTACAGAACATTAGAGACAATGTGGAAAAGGAATCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTCCAGAAAACTACAGAACATTAGAGACAATGTGGAAAAGGAATCGAAA

    600     .    :    .
    601 CGACTGAAAATATCT
        |||||||||||||||
 100601 CGACTGAAAATATCT