seq1 = pF1KE0397.tfa, 267 bp
seq2 = pF1KE0397/gi568815587f_65903251.tfa (gi568815587f:65903251_66103769), 200519 bp

>pF1KE0397 267
>gi568815587f:65903251_66103769 (Chr11)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-267  (100376-100519)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAACCTCCCAAAAGCACCGAGACTTCGTGGCAGAGCCCATGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAACCTCCCAAAAGCACCGAGACTTCGTGGCAGAGCCCATGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCCAGTGGGGAGCCTGGCTGGGATTGGTGAAGTCCTGGGCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCCAGTGGGGAGCCTGGCTGGGATTGGTGAAGTCCTGGGCAAGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGGAAAGGGGTTTTGACAAG         GCCTATGTTGTCCTTGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 TGGAGGAAAGGGGTTTTGACAAGGTG...CAGGCCTATGTTGTCCTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGTTTCTGGTGCTAAAGAAAGATGAAGACCTCTTCCGGGAATGGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100394 CAGTTTCTGGTGCTAAAGAAAGATGAAGACCTCTTCCGGGAATGGCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGACACTTGTGGCGCCAACGCCAAGCAGTCCCGGGACTGCTTCGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100444 AGACACTTGTGGCGCCAACGCCAAGCAGTCCCGGGACTGCTTCGGATGCC

    250     .    :    .    :    .
    242 TTCGAGAGTGGTGCGACGCCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 100494 TTCGAGAGTGGTGCGACGCCTTCTTG