Result of SIM4 for
pF1KE0395
seq1 = pF1KE0395.tfa, 3564 bp
seq2 = pF1KE0395/gi568815588f_61802156.tfa (gi568815588f:61802156_62193027), 390872 bp
>pF1KE0395 3564
>gi568815588f:61802156_62193027 (Chr10)
1-21 (99555-99575) 100% ->
22-276 (100004-100258) 100% ->
277-502 (138028-138253) 100% ->
503-733 (197936-198166) 100% ->
734-846 (248733-248845) 100% ->
847-1048 (254962-255163) 100% ->
1049-1101 (257088-257140) 100% ->
1102-1199 (267545-267642) 100% ->
1200-1398 (283547-283745) 100% ->
1399-3564 (288707-290872) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGCCCAACTCACTCCAG TGGGTCGGCTCACCGTGTGG
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
99555 ATGGAGCCCAACTCACTCCAGGTA...CAGTGGGTCGGCTCACCGTGTGG
50 . : . : . : . : . :
42 CTTGCACGGACCTTACATTTTCTACAAGGCTTTTCAATTCCACCTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100024 CTTGCACGGACCTTACATTTTCTACAAGGCTTTTCAATTCCACCTTGAAG
100 . : . : . : . : . :
92 GCAAACCAAGAATTTTGTCCCTTGGCGACTTTTTCTTTGTAAGATGTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100074 GCAAACCAAGAATTTTGTCCCTTGGCGACTTTTTCTTTGTAAGATGTACG
150 . : . : . : . : . :
142 CCAAAGGATCCGATTTGCATAGCGGAGCTCCAGCTGTTGTGGGAAGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100124 CCAAAGGATCCGATTTGCATAGCGGAGCTCCAGCTGTTGTGGGAAGAGAG
200 . : . : . : . : . :
192 GACCAGCCGGCAACTTTTATCCAGCTCTAAACTTTATTTCCTCCCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100174 GACCAGCCGGCAACTTTTATCCAGCTCTAAACTTTATTTCCTCCCAGAAG
250 . : . : . : . : . :
242 ACACTCCCCAGGGCAGAAATAGCGACCATGGCGAG GATGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
100224 ACACTCCCCAGGGCAGAAATAGCGACCATGGCGAGGTG...TAGGATGAA
300 . : . : . : . : . :
283 GTCATTGCTGTTTCCGAAAAGGTGATTGTGAAGCTTGAAGACCTGGTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138034 GTCATTGCTGTTTCCGAAAAGGTGATTGTGAAGCTTGAAGACCTGGTCAA
350 . : . : . : . : . :
333 GTGGGTACATTCTGATTTCTCCAAGTGGAGATGTGGCTTCCACGCTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138084 GTGGGTACATTCTGATTTCTCCAAGTGGAGATGTGGCTTCCACGCTGGAC
400 . : . : . : . : . :
383 CAGTGAAAACTGAGGCCTTGGGAAGGAATGGACAGAAGGAAGCTCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138134 CAGTGAAAACTGAGGCCTTGGGAAGGAATGGACAGAAGGAAGCTCTGCTG
450 . : . : . : . : . :
433 AAGTACAGGCAGTCAACCCTAAACAGTGGACTCAACTTCAAAGACGTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138184 AAGTACAGGCAGTCAACCCTAAACAGTGGACTCAACTTCAAAGACGTTCT
500 . : . : . : . : . :
483 CAAGGAGAAGGCAGACCTGG GGGAGGACGAGGAAGAAACGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
138234 CAAGGAGAAGGCAGACCTGGGTA...TAGGGGAGGACGAGGAAGAAACGA
550 . : . : . : . : . :
524 ACGTGATAGTTCTCAGCTACCCCCAGTACTGCCGGTACCGCTCGATGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197957 ACGTGATAGTTCTCAGCTACCCCCAGTACTGCCGGTACCGCTCGATGCTG
600 . : . : . : . : . :
574 AAACGCATCCAGGATAAGCCATCTTCCATTCTAACGGACCAGTTTGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198007 AAACGCATCCAGGATAAGCCATCTTCCATTCTAACGGACCAGTTTGCATT
650 . : . : . : . : . :
624 GGCCCTGGGGGGCATTGCAGTGGTCAGCAGGAACCCTCAGATCCTGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198057 GGCCCTGGGGGGCATTGCAGTGGTCAGCAGGAACCCTCAGATCCTGTACT
700 . : . : . : . : . :
674 GTCGGGACACCTTTGACCACCCGACTCTCATAGAAAACGAGAGTATATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198107 GTCGGGACACCTTTGACCACCCGACTCTCATAGAAAACGAGAGTATATGC
750 . : . : . : . : . :
724 GATGAGTTTG CGCCAAATCTTAAAGGCAGACCACGCAAAAA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
198157 GATGAGTTTGGTG...CAGCGCCAAATCTTAAAGGCAGACCACGCAAAAA
800 . : . : . : . : . :
765 GAAACCATGCCCACAAAGAAGAGATTCATTCAGTGGTGTTAAGGATTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
248764 GAAACCATGCCCACAAAGAAGAGATTCATTCAGTGGTGTTAAGGATTCCA
850 . : . : . : . : . :
815 ACAACAATTCCGATGGCAAAGCCGTTGCCAAG GTGAAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
248814 ACAACAATTCCGATGGCAAAGCCGTTGCCAAGGTA...CAGGTGAAATGT
900 . : . : . : . : . :
856 GAGGCCAGGTCAGCCTTGACCAAGCCGAAGAATAACCATAACTGTAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
254971 GAGGCCAGGTCAGCCTTGACCAAGCCGAAGAATAACCATAACTGTAAAAA
950 . : . : . : . : . :
906 AGTCTCAAATGAAGAAAAACCAAAGGTTGCCATTGGTGAAGAGTGCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
255021 AGTCTCAAATGAAGAAAAACCAAAGGTTGCCATTGGTGAAGAGTGCAGGG
1000 . : . : . : . : . :
956 CAGATGAACAAGCCTTCTTGGTGGCACTTTATAAATACATGAAAGAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
255071 CAGATGAACAAGCCTTCTTGGTGGCACTTTATAAATACATGAAAGAAAGG
1050 . : . : . : . : . :
1006 AAAACGCCGATAGAACGAATACCCTATTTAGGTTTTAAACAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
255121 AAAACGCCGATAGAACGAATACCCTATTTAGGTTTTAAACAGAGTG...C
1100 . : . : . : . : . :
1049 TTAACCTTTGGACTATGTTTCAAGCTGCTCAAAAACTGGGAGGATATG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
257086 AGTTAACCTTTGGACTATGTTTCAAGCTGCTCAAAAACTGGGAGGATATG
1150 . : . : . : . : . :
1097 AAACA ATAACAGCCCGCCGTCAGTGGAAACATATTTATGAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
257136 AAACAGTA...CAGATAACAGCCCGCCGTCAGTGGAAACATATTTATGAT
1200 . : . : . : . : . :
1138 GAATTAGGCGGTAATCCTGGGAGCACCAGCGCTGCCACTTGTACCCGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
267581 GAATTAGGCGGTAATCCTGGGAGCACCAGCGCTGCCACTTGTACCCGCAG
1250 . : . : . : . : . :
1188 ACATTATGAAAG ATTAATCCTACCATATGAAAGATTTATTA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
267631 ACATTATGAAAGGTA...TAGATTAATCCTACCATATGAAAGATTTATTA
1300 . : . : . : . : . :
1229 AAGGAGAAGAAGATAAGCCCCTGCCTCCAATCAAACCTCGGAAACAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283576 AAGGAGAAGAAGATAAGCCCCTGCCTCCAATCAAACCTCGGAAACAGGAG
1350 . : . : . : . : . :
1279 AACAGTTCACAGGAAAATGAGAACAAAACAAAAGTATCTGGAACCAAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283626 AACAGTTCACAGGAAAATGAGAACAAAACAAAAGTATCTGGAACCAAACG
1400 . : . : . : . : . :
1329 CATCAAACATGAAATACCTAAAAGCAAGAAAGAAAAAGAAAATGCCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283676 CATCAAACATGAAATACCTAAAAGCAAGAAAGAAAAAGAAAATGCCCCAA
1450 . : . : . : . : . :
1379 AGCCCCAGGATGCAGCAGAG GTTTCATCAGAGCAAGAAAAA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
283726 AGCCCCAGGATGCAGCAGAGGTG...CAGGTTTCATCAGAGCAAGAAAAA
1500 . : . : . : . : . :
1420 GAACAAGAGACTTTAATAAGCCAGAAAAGCATCCCTGAGCCTCTCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288728 GAACAAGAGACTTTAATAAGCCAGAAAAGCATCCCTGAGCCTCTCCCAGC
1550 . : . : . : . : . :
1470 AGCAGACATGAAGAAAAAAATAGAAGGGTATCAGGAATTTTCAGCGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288778 AGCAGACATGAAGAAAAAAATAGAAGGGTATCAGGAATTTTCAGCGAAGC
1600 . : . : . : . : . :
1520 CCCTGGCATCCAGAGTAGACCCAGAGAAGGACAACGAAACAGACCAAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288828 CCCTGGCATCCAGAGTAGACCCAGAGAAGGACAACGAAACAGACCAAGGT
1650 . : . : . : . : . :
1570 TCCAACAGTGAGAAGGTGGCAGAGGAGGCGGGAGAGAAGGGGCCCACACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288878 TCCAACAGTGAGAAGGTGGCAGAGGAGGCGGGAGAGAAGGGGCCCACACC
1700 . : . : . : . : . :
1620 TCCACTCCCAAGTGCTCCTCTGGCCCCAGAAAAAGATTCAGCCTTGGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288928 TCCACTCCCAAGTGCTCCTCTGGCCCCAGAAAAAGATTCAGCCTTGGTCC
1750 . : . : . : . : . :
1670 CTGGGGCCAGCAAACAGCCACTCACCTCTCCTAGTGCCCTGGTGGACTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288978 CTGGGGCCAGCAAACAGCCACTCACCTCTCCTAGTGCCCTGGTGGACTCA
1800 . : . : . : . : . :
1720 AAACAAGAATCCAAACTGTGCTGTTTTACAGAGAGCCCTGAAAGTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289028 AAACAAGAATCCAAACTGTGCTGTTTTACAGAGAGCCCTGAAAGTGAACC
1850 . : . : . : . : . :
1770 CCAAGAAGCATCCTTCCCCAGCTTCCCCACCACACAGCCACCGCTGGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289078 CCAAGAAGCATCCTTCCCCAGCTTCCCCACCACACAGCCACCGCTGGCAA
1900 . : . : . : . : . :
1820 ACCAGAATGAGACGGAGGATGACAAACTGCCCGCCATGGCAGATTACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289128 ACCAGAATGAGACGGAGGATGACAAACTGCCCGCCATGGCAGATTACATT
1950 . : . : . : . : . :
1870 GCCAACTGCACCGTGAAGGTGGACCAGCTGGGCAGTGACGACATCCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289178 GCCAACTGCACCGTGAAGGTGGACCAGCTGGGCAGTGACGACATCCACAA
2000 . : . : . : . : . :
1920 TGCGCTCAAGCAGACCCCAAAGGTCCTTGTGGTCCAGTCGTTTGACATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289228 TGCGCTCAAGCAGACCCCAAAGGTCCTTGTGGTCCAGTCGTTTGACATGT
2050 . : . : . : . : . :
1970 TCAAAGACAAAGACCTGACTGGGCCCATGAACGAGAACCATGGACTTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289278 TCAAAGACAAAGACCTGACTGGGCCCATGAACGAGAACCATGGACTTAAT
2100 . : . : . : . : . :
2020 TACACGCCCCTGCTCTACTCTAGGGGCAACCCAGGCATCATGTCCCCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289328 TACACGCCCCTGCTCTACTCTAGGGGCAACCCAGGCATCATGTCCCCACT
2150 . : . : . : . : . :
2070 GGCCAAGAAAAAGCTTTTGTCCCAAGTGAGTGGGGCCAGCCTCTCCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289378 GGCCAAGAAAAAGCTTTTGTCCCAAGTGAGTGGGGCCAGCCTCTCCAGCA
2200 . : . : . : . : . :
2120 GCTACCCTTATGGCTCCCCACCCCCTTTGATCAGCAAAAAGAAACTGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289428 GCTACCCTTATGGCTCCCCACCCCCTTTGATCAGCAAAAAGAAACTGATT
2250 . : . : . : . : . :
2170 GCTAGGGATGACTTGTGTTCCAGTTTGTCCCAGACCCACCATGGCCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289478 GCTAGGGATGACTTGTGTTCCAGTTTGTCCCAGACCCACCATGGCCAAAG
2300 . : . : . : . : . :
2220 CACTGACCATATGGCGGTCAGCCGGCCATCAGTGATTCAGCACGTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289528 CACTGACCATATGGCGGTCAGCCGGCCATCAGTGATTCAGCACGTCCAGA
2350 . : . : . : . : . :
2270 GTTTCAGAAGCAAGCCCTCGGAAGAGAGAAAGACCATCAATGACATCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289578 GTTTCAGAAGCAAGCCCTCGGAAGAGAGAAAGACCATCAATGACATCTTT
2400 . : . : . : . : . :
2320 AAGCATGAGAAACTGAGTCGATCAGATCCCCACCGCTGCAGCTTCTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289628 AAGCATGAGAAACTGAGTCGATCAGATCCCCACCGCTGCAGCTTCTCCAA
2450 . : . : . : . : . :
2370 GCATCACCTTAACCCCCTTGCTGACTCCTACGTCCTGAAGCAAGAAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289678 GCATCACCTTAACCCCCTTGCTGACTCCTACGTCCTGAAGCAAGAAATTC
2500 . : . : . : . : . :
2420 AGGAGGGCAAGGATAAACTCTTAGAGAAAAGGGCCCTCCCCCATTCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289728 AGGAGGGCAAGGATAAACTCTTAGAGAAAAGGGCCCTCCCCCATTCCCAC
2550 . : . : . : . : . :
2470 ATGCCTAGCTTCCTGGCTGACTTCTACTCGTCCCCTCATCTCCATAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289778 ATGCCTAGCTTCCTGGCTGACTTCTACTCGTCCCCTCATCTCCATAGCCT
2600 . : . : . : . : . :
2520 CTACAGACACACCGAGCACCATCTTCATAATGAACAGACATCCAAATACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289828 CTACAGACACACCGAGCACCATCTTCATAATGAACAGACATCCAAATACC
2650 . : . : . : . : . :
2570 CTTCCAGGGACATGTACAGGGAATCGGAAAACAGTTCTTTTCCTTCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289878 CTTCCAGGGACATGTACAGGGAATCGGAAAACAGTTCTTTTCCTTCCCAC
2700 . : . : . : . : . :
2620 AGACACCAAGAAAAGCTCCATGTAAATTATCTCACGTCCCTGCACCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289928 AGACACCAAGAAAAGCTCCATGTAAATTATCTCACGTCCCTGCACCTGCA
2750 . : . : . : . : . :
2670 AGACAAAAAGTCGGCGGCAGCAGAAGCCCCTACGGATGATCAGCCTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289978 AGACAAAAAGTCGGCGGCAGCAGAAGCCCCTACGGATGATCAGCCTACAG
2800 . : . : . : . : . :
2720 ATCTGAGCCTTCCCAAGAACCCGCACAAACCTACCGGCAAGGTCCTGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290028 ATCTGAGCCTTCCCAAGAACCCGCACAAACCTACCGGCAAGGTCCTGGGC
2850 . : . : . : . : . :
2770 CTGGCTCATTCCACCACAGGGCCCCAGGAGAGCAAAGGCATCTCCCAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290078 CTGGCTCATTCCACCACAGGGCCCCAGGAGAGCAAAGGCATCTCCCAGTT
2900 . : . : . : . : . :
2820 CCAGGTCTTAGGCAGCCAGAGTCGAGACTGTCACCCCAAAGCCTGTCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290128 CCAGGTCTTAGGCAGCCAGAGTCGAGACTGTCACCCCAAAGCCTGTCGGG
2950 . : . : . : . : . :
2870 TATCACCCATGACCATGTCAGGCCCTAAAAAATACCCTGAATCGCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290178 TATCACCCATGACCATGTCAGGCCCTAAAAAATACCCTGAATCGCTTTCA
3000 . : . : . : . : . :
2920 AGATCAGGAAAACCTCACCATGTGAGACTGGAGAATTTCAGGAAGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290228 AGATCAGGAAAACCTCACCATGTGAGACTGGAGAATTTCAGGAAGATGGA
3050 . : . : . : . : . :
2970 AGGCATGGTCCACCCAATCCTGCACCGGAAAATGAGCCCGCAGAACATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290278 AGGCATGGTCCACCCAATCCTGCACCGGAAAATGAGCCCGCAGAACATTG
3100 . : . : . : . : . :
3020 GGGCGGCGCGGCCGATCAAGCGCAGCCTGGAGGATTTGGACCTTGTGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290328 GGGCGGCGCGGCCGATCAAGCGCAGCCTGGAGGATTTGGACCTTGTGATT
3150 . : . : . : . : . :
3070 GCAGGGAAAAAGGCCCGGGCAGTGTCTCCCTTAGACCCATCCAAGGAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290378 GCAGGGAAAAAGGCCCGGGCAGTGTCTCCCTTAGACCCATCCAAGGAGGT
3200 . : . : . : . : . :
3120 CTCTGGGAAGGAGAAGGCCTCTGAGCAGGAGAGTGAAGGCAGCAAAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290428 CTCTGGGAAGGAGAAGGCCTCTGAGCAGGAGAGTGAAGGCAGCAAAGCAG
3250 . : . : . : . : . :
3170 CGCACGGTGGGCATTCCGGGGGCGGATCAGAAGGCCACAAGCTTCCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290478 CGCACGGTGGGCATTCCGGGGGCGGATCAGAAGGCCACAAGCTTCCCCTC
3300 . : . : . : . : . :
3220 TCCTCCCCTATCTTCCCAGGTCTGTATTCCGGGAGCCTGTGTAACTCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290528 TCCTCCCCTATCTTCCCAGGTCTGTATTCCGGGAGCCTGTGTAACTCGGG
3350 . : . : . : . : . :
3270 CCTCAACTCCAGGCTCCCGGCTGGGTATTCTCATTCTCTGCAGTACTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290578 CCTCAACTCCAGGCTCCCGGCTGGGTATTCTCATTCTCTGCAGTACTTGA
3400 . : . : . : . : . :
3320 AAAACCAGACTGTGCTTTCTCCACTCATGCAGCCCCTGGCTTTCCACTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290628 AAAACCAGACTGTGCTTTCTCCACTCATGCAGCCCCTGGCTTTCCACTCG
3450 . : . : . : . : . :
3370 CTTGTGATGCAAAGAGGAATTTTTACATCACCGACAAATTCTCAGCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290678 CTTGTGATGCAAAGAGGAATTTTTACATCACCGACAAATTCTCAGCAGCT
3500 . : . : . : . : . :
3420 GTACAGACACTTGGCTGCGGCTACACCTGTAGGAAGTTCATATGGGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290728 GTACAGACACTTGGCTGCGGCTACACCTGTAGGAAGTTCATATGGGGACC
3550 . : . : . : . : . :
3470 TTTTGCATAACAGCATTTACCCTTTAGCTGCTATAAATCCTCAAGCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290778 TTTTGCATAACAGCATTTACCCTTTAGCTGCTATAAATCCTCAAGCTGCC
3600 . : . : . : . : .
3520 TTTCCATCTTCCCAGCTGTCATCCGTGCACCCCAGTACAAAACTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290828 TTTCCATCTTCCCAGCTGTCATCCGTGCACCCCAGTACAAAACTG