seq1 = pF1KE0394.tfa, 3360 bp
seq2 = pF1KE0394/gi568815583r_82030376.tfa (gi568815583r:82030376_82361778), 331403 bp

>pF1KE0394 3360
>gi568815583r:82030376_82361778 (Chr15)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-159  (102624-102691)   100% ->
160-244  (109004-109088)   100% ->
245-378  (120376-120509)   100% ->
379-516  (121224-121361)   100% ->
517-731  (123258-123472)   100% ->
732-855  (130808-130931)   100% ->
856-932  (132669-132745)   100% ->
933-1069  (133452-133588)   100% ->
1070-1192  (134207-134329)   100% ->
1193-1292  (136515-136614)   100% ->
1293-1444  (141550-141701)   100% ->
1445-1611  (141961-142127)   100% ->
1612-1750  (146924-147062)   100% ->
1751-1882  (197795-197926)   100% ->
1883-2030  (203919-204066)   100% ->
2031-2989  (209356-210314)   100% ->
2990-3174  (222937-223121)   100% ->
3175-3360  (231218-231403)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCTCAACAGTTTGGATAAGATGATTCAACTCCAGAAAAACACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCTCAACAGTTTGGATAAGATGATTCAACTCCAGAAAAACACTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACATCAGGAATATTTGTGTTTTGGCTCATGTTGACCATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 CAACATCAGGAATATTTGTGTTTTGGCTCATGTTGACCATGGTA...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAAACTACTCTGGCTGACTGTCTTATATCTAGCAATGGAATCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 GAAAAACTACTCTGGCTGACTGTCTTATATCTAGCAATGGAATCATCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCCGCCTAGCAGGCAAG         TTAAGGTACATGGACAGCAGAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102674 AGCCGCCTAGCAGGCAAGGTA...CAGTTAAGGTACATGGACAGCAGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGATGAACAGATCCGAGGGATCACTATGAAATCCAGTGCCATTTCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109027 AGATGAACAGATCCGAGGGATCACTATGAAATCCAGTGCCATTTCCCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTATGCAACAG         GTAATGAGGAGTACCTGATCAATCTGATA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109077 ATTATGCAACAGGTA...TAGGTAATGAGGAGTACCTGATCAATCTGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACTCTCCAGGACACGTGGACTTTTCCTCAGAAGTATCAACCGCTGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120405 GACTCTCCAGGACACGTGGACTTTTCCTCAGAAGTATCAACCGCTGTTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATTTGTGATGGATGCATCATTGTGGTAGATGCTGTGGAAGGAGTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120455 CATTTGTGATGGATGCATCATTGTGGTAGATGCTGTGGAAGGAGTCTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACAG         ACACAGGCAGTTCTGCGACAAGCTTGGCTTGAAAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120505 CACAGGTA...CAGACACAGGCAGTTCTGCGACAAGCTTGGCTTGAAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCCGTCCGGTTTTAGTGATTAATAAGATTGATCGCTTGATAGTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121260 ATCCGTCCGGTTTTAGTGATTAATAAGATTGATCGCTTGATAGTGGAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAATTCACCCCACAAGAGGCCTATTCTCACCTCAAGAATATTTTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121310 GAAATTCACCCCACAAGAGGCCTATTCTCACCTCAAGAATATTTTAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AG         ATTAATGCGCTCACAGGGACTCTTTTTACTTCTAAAGTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121360 AGGTA...TAGATTAATGCGCTCACAGGGACTCTTTTTACTTCTAAAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTAGAAGAAAGAGCAGAGAGGGAGACTGAATCCCAAGTGAATCCAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123297 CTAGAAGAAAGAGCAGAGAGGGAGACTGAATCCCAAGTGAATCCAAATTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAACAAGGAGAGCAAGTATATGACTGGAGCACTGGCTTGGAGGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123347 TGAACAAGGAGAGCAAGTATATGACTGGAGCACTGGCTTGGAGGACACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGATTCTCACCTTTACTTCTCTCCAGAACAGGGAAATGTGGTGTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123397 ATGATTCTCACCTTTACTTCTCTCCAGAACAGGGAAATGTGGTGTTTACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGTGCAATAGATGGGTGGGGCTTTGG         AATTGAGCACTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 123447 AGTGCAATAGATGGGTGGGGCTTTGGGTA...CAGAATTGAGCACTTCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAGAATCTACAGTCAAAAAATTGGCATCAAAAAGGAAGTTCTTATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130823 CAGAATCTACAGTCAAAAAATTGGCATCAAAAAGGAAGTTCTTATGAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCTTGTGGGGAGATTACTATATAAATATGAAGGCTAAAAAGATCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130873 CCTTGTGGGGAGATTACTATATAAATATGAAGGCTAAAAAGATCATGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGTGATCAG         GCCAAAGGAAAGAAACCTTTATTTGTACAGTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 130923 GGTGATCAGGTA...CAGGCCAAAGGAAAGAAACCTTTATTTGTACAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GATCCTGGAAAATATATGGAGTTTGTATGATGCTGTTTTGAAAAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132701 GATCCTGGAAAATATATGGAGTTTGTATGATGCTGTTTTGAAAAAGTA..

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933     GGACAAAGACAAAATTGATAAAATAGTGACTTCTTTAGGATTAAAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132751 .CAGGGACAAAGACAAAATTGATAAAATAGTGACTTCTTTAGGATTAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATTGGAGCCCGGGAGGCACGACATTCAGACCCTAAAGTTCAGATCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133498 ATTGGAGCCCGGGAGGCACGACATTCAGACCCTAAAGTTCAGATCAACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CATTTGCAGTCAGTGGCTACCCATATCCCATGCTGTTCTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 133548 CATTTGCAGTCAGTGGCTACCCATATCCCATGCTGTTCTTGGTA...CAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTATGGTGTGTCAGAAACTTCCTAGTCCCCTTGATATTACAGCTGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134207 CTATGGTGTGTCAGAAACTTCCTAGTCCCCTTGATATTACAGCTGAGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTGGAGAGACTGATGTGCACAGGATCACAAACTTTTGACTCTTTTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134257 GTGGAGAGACTGATGTGCACAGGATCACAAACTTTTGACTCTTTTCCACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGAAACTCAAGCACTGAAAGCAG         CTTTTATGAAATGTGGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 134307 AGAAACTCAAGCACTGAAAGCAGGTG...TAGCTTTTATGAAATGTGGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GTGAGGACACTGCTCCAGTTATTATATTTGTTTCCAAAATGTTTGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136533 GTGAGGACACTGCTCCAGTTATTATATTTGTTTCCAAAATGTTTGCAGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GATGCTAAGGCCTTGCCTCAGAATAAGCCAAG         GCCTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 136583 GATGCTAAGGCCTTGCCTCAGAATAAGCCAAGGTA...TAGGCCTCTCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TCAAGAAGAAATTGCTCAGAGACGTGAGCGTGCAAGACAAAGGCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141559 TCAAGAAGAAATTGCTCAGAGACGTGAGCGTGCAAGACAAAGGCATGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGAAGCTTGCAGCAGCACAGGGACAGGCACCCTTGGAGCCCACCCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141609 AGAAGCTTGCAGCAGCACAGGGACAGGCACCCTTGGAGCCCACCCAAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGGAGTGCCATTGAAACATGTCCAAAAGGAGAGGAGCCAAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 141659 GGGAGTGCCATTGAAACATGTCCAAAAGGAGAGGAGCCAAGAGGTA...C

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1445   GTGACGAGCAACAGGTGGAAAGTATGACCCCTAAACCTGTGCTCCAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141959 AGGTGACGAGCAACAGGTGGAAAGTATGACCCCTAAACCTGTGCTCCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAGAAAACAACCAAGAGTCTTTTATTGCATTTGCTCGGGTGTTCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142009 AAGAAAACAACCAAGAGTCTTTTATTGCATTTGCTCGGGTGTTCAGTGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTGGCTCGAAGAGGAAAGAAAATTTTTGTCTTGGGGCCCAAATACAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142059 GTGGCTCGAAGAGGAAAGAAAATTTTTGTCTTGGGGCCCAAATACAGTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TCTTGAGTTTTTACGAAGG         GTACCATTAGGCTTCTCAGCTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 142109 TCTTGAGTTTTTACGAAGGGTA...CAGGTACCATTAGGCTTCTCAGCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CACCAGATGGCCTCCCCCAAGTCCCCCACATGGCATACTGTGCTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146946 CACCAGATGGCCTCCCCCAAGTCCCCCACATGGCATACTGTGCTCTGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AACCTGTATCTTCTGATGGGAAGGGAACTGGAATATCTAGAGGAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146996 AACCTGTATCTTCTGATGGGAAGGGAACTGGAATATCTAGAGGAGGTACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCCAGGAAATGTGCTAG         GAATAGGAGGCCTTCAAGATTTTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 147046 TCCAGGAAATGTGCTAGGTA...CAGGAATAGGAGGCCTTCAAGATTTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGCTGAAATCTGCAACACTGTGTAGCCTGCCATCCTGCCCACCATTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197819 TGCTGAAATCTGCAACACTGTGTAGCCTGCCATCCTGCCCACCATTTATA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CCACTCAACTTCGAAGCCACTCCTATTGTGAGAGTTGCTGTTGAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197869 CCACTCAACTTCGAAGCCACTCCTATTGTGAGAGTTGCTGTTGAACCAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 ACATCCAA         GTGAAATGCCTCAGCTCGTAAAAGGAATGAAAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 197919 ACATCCAAGTA...TAGGTGAAATGCCTCAGCTCGTAAAAGGAATGAAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TGTTAAACCAGGCTGATCCCTGTGTCCAGATTTTAATTCAGGAAACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203952 TGTTAAACCAGGCTGATCCCTGTGTCCAGATTTTAATTCAGGAAACGGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GAGCACGTTTTAGTCACAGCAGGAGAAGTCCACCTTCAGCGATGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204002 GAGCACGTTTTAGTCACAGCAGGAGAAGTCCACCTTCAGCGATGCCTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TGACTTAAAAGAAAG         GTTTGCAAAGATTCATATCAGTGTAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 204052 TGACTTAAAAGAAAGGTT...TAGGTTTGCAAAGATTCATATCAGTGTAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CTGAACCTATTATTCCATTCAGAGAAACAATCACAAAACCCCCAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209382 CTGAACCTATTATTCCATTCAGAGAAACAATCACAAAACCCCCAAAAGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GACATGGTCAATGAAGAAATAGGCAAACAGCAAAAAGTTGCAGTCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209432 GACATGGTCAATGAAGAAATAGGCAAACAGCAAAAAGTTGCAGTCATACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CCAAATGAAAGAAGATCAAAGCAAAATCCCTGAAGGAATCCAAGTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209482 CCAAATGAAAGAAGATCAAAGCAAAATCCCTGAAGGAATCCAAGTTGACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 CTGACGGGCTAATCACCATAACAACTCCCAATAAACTTGCCACGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209532 CTGACGGGCTAATCACCATAACAACTCCCAATAAACTTGCCACGCTCAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 GTTCGAGCCATGCCCCTTCCAGAAGAAGTCACCCAGATTCTGGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209582 GTTCGAGCCATGCCCCTTCCAGAAGAAGTCACCCAGATTCTGGAAGAAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TAGTGATTTGATTCGTTCTATGGAGCAGTTGACATCCTCTTTGAATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209632 TAGTGATTTGATTCGTTCTATGGAGCAGTTGACATCCTCTTTGAATGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 GTGAAAATACTCACATGATTCATCAGAAGACCCAAGAGAAAATTTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209682 GTGAAAATACTCACATGATTCATCAGAAGACCCAAGAGAAAATTTGGGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TTCAAAGGAAAACTGGAGCAACACCTAACAGGGAGAAGATGGAGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209732 TTCAAAGGAAAACTGGAGCAACACCTAACAGGGAGAAGATGGAGGAACAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TGTTGACCAAATCTGGTCATTTGGCCCAAGAAAATGTGGGCCCAACATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209782 TGTTGACCAAATCTGGTCATTTGGCCCAAGAAAATGTGGGCCCAACATAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TAGTCAATAAAAGTGAAGATTTTCAGAACTCAGTATGGACAGGTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209832 TAGTCAATAAAAGTGAAGATTTTCAGAACTCAGTATGGACAGGTCCAGCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GACAAAGCTTCAAAAGAAGCCAGTAGATACCGAGATTTGGGCAATAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209882 GACAAAGCTTCAAAAGAAGCCAGTAGATACCGAGATTTGGGCAATAGCAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 TGTGAGTGGCTTCCAACTAGCAACCCTCTCTGGCCCCATGTGTGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209932 TGTGAGTGGCTTCCAACTAGCAACCCTCTCTGGCCCCATGTGTGAGGAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 CTCTCATGGGTGTCTGTTTTGTTCTGGAAAAATGGGACCTAAGTAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209982 CTCTCATGGGTGTCTGTTTTGTTCTGGAAAAATGGGACCTAAGTAAATTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 GAGGAACAAGGAGCAAGTGATCTGGCAAAAGAGGGACAGGAGGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210032 GAGGAACAAGGAGCAAGTGATCTGGCAAAAGAGGGACAGGAGGAAAATGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 AACCTGTTCTGGTGGAAATGAAAACCAAGAGCTACAAGATGGCTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210082 AACCTGTTCTGGTGGAAATGAAAACCAAGAGCTACAAGATGGCTGCTCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 AGGCCTTTGAGAAGAGGACATCACAGAAAGGAGAATCTCCACTCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210132 AGGCCTTTGAGAAGAGGACATCACAGAAAGGAGAATCTCCACTCACTGAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 TGCTATGGACCTTTCTCAGGACAGCTAATTGCCACCATGAAAGAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210182 TGCTATGGACCTTTCTCAGGACAGCTAATTGCCACCATGAAAGAAGCATG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 TCGCTATGCACTGCAAGTGAAACCTCAGCGCCTGATGGCAGCTATGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210232 TCGCTATGCACTGCAAGTGAAACCTCAGCGCCTGATGGCAGCTATGTACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 CATGTGACATCATGGCCACTGGTGATGTTCTCG         GTCGAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 210282 CATGTGACATCATGGCCACTGGTGATGTTCTCGGTA...CAGGTCGAGTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 TATGCTGTCTTGTCAAAGAGAGAAGGTCGGGTACTTCAAGAAGAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222945 TATGCTGTCTTGTCAAAGAGAGAAGGTCGGGTACTTCAAGAAGAAATGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 AGAAGGGACAGACATGTTCATCATCAAGGCTGTGCTGCCTGTTGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222995 AGAAGGGACAGACATGTTCATCATCAAGGCTGTGCTGCCTGTTGCTGAAA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 GCTTTGGTTTTGCTGATGAAATCAGGAAGAGGACAAGTGGCCTGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223045 GCTTTGGTTTTGCTGATGAAATCAGGAAGAGGACAAGTGGCCTGGCCAGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 CCACAACTAGTATTCAGCCATTGGGAG         ATCATTCCCAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 223095 CCACAACTAGTATTCAGCCATTGGGAGGTA...AAGATCATTCCCAGTGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 CCCCTTCTGGGTGCCAACTACTGAGGAGGAATACTTGCACTTTGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231232 CCCCTTCTGGGTGCCAACTACTGAGGAGGAATACTTGCACTTTGGGGAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 AGGCTGACTCTGAGAACCAAGCCCGGAAGTACATGAACGCAGTACGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231282 AGGCTGACTCTGAGAACCAAGCCCGGAAGTACATGAACGCAGTACGAAAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 CGGAAGGGGCTTTATGTGGAAGAAAAGATTGTGGAGCATGCAGAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231332 CGGAAGGGGCTTTATGTGGAAGAAAAGATTGTGGAGCATGCAGAAAAGCA

   3500     .    :    .    :
   3339 GAGGACACTCAGCAAAAATAAG
        ||||||||||||||||||||||
 231382 GAGGACACTCAGCAAAAATAAG