seq1 = pF1KE0392.tfa, 2793 bp
seq2 = pF1KE0392/gi568815593f_141255201.tfa (gi568815593f:141255201_141611170), 355970 bp

>pF1KE0392 2793
>gi568815593f:141255201_141611170 (Chr5)

1-2421  (100001-102421)   100% ->
2422-2480  (239607-239665)   100% ->
2481-2569  (250193-250281)   100% ->
2570-2793  (255747-255970)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCCTCCTGCTCGCCCAGACCACACCCGGCTGCTCCAGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCCTCCTGCTCGCCCAGACCACACCCGGCTGCTCCAGATCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAATCAGGGCCGAACAGATTCTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAATCAGGGCCGAACAGATTCTCTACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTGTTTGAGGAGCAGGAAGAAGGCTCAGTGGTGGGCAACATCGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTGTTTGAGGAGCAGGAAGAAGGCTCAGTGGTGGGCAACATCGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCTGGGGTTGGCGCCCCGGGAGCTGGCGGAGCGCGGAGTCCGCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCTGGGGTTGGCGCCCCGGGAGCTGGCGGAGCGCGGAGTCCGCATCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCAGAGGTAGGACGCAGCTTTTCGCCCTGAACCCGCGCAGCGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCAGAGGTAGGACGCAGCTTTTCGCCCTGAACCCGCGCAGCGGCACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCACCGCGGGTAGGATAGACAGGGAGGAGCTCTGCGACAGATCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCACCGCGGGTAGGATAGACAGGGAGGAGCTCTGCGACAGATCTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACTGTGTGACAAACCTGGAGATTCTTCTAGAAGATACAGTGAAGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACTGTGTGACAAACCTGGAGATTCTTCTAGAAGATACAGTGAAGATTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGGGTAGAGGTGGAAATAATCGATGTTAATGATAACCCACCCAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGGGTAGAGGTGGAAATAATCGATGTTAATGATAACCCACCCAGTTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGACAGAACAGAGGGAAATAAAAGTTGCTGAAAATGAAAATCCTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGACAGAACAGAGGGAAATAAAAGTTGCTGAAAATGAAAATCCTGGGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGATTTCCTCTTCCTGAAGCTTTTGATCCGGATGTAGGTGTAAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGATTTCCTCTTCCTGAAGCTTTTGATCCGGATGTAGGTGTAAACTCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAGGGTTACCAGCTCAACTCAAACGGTTACTTTTCCCTGGACGTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAGGGTTACCAGCTCAACTCAAACGGTTACTTTTCCCTGGACGTGCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGGGCCGATGGGATTAAGTACCCAGAGCTGGTGCTGGAACGCGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGGGCCGATGGGATTAAGTACCCAGAGCTGGTGCTGGAACGCGCTCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATCGCGAGGAAGAGGCGGTTCACCACCTCGTTCTCACGGCCTTCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATCGCGAGGAAGAGGCGGTTCACCACCTCGTTCTCACGGCCTTCGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGTGACCCGGTTCGCTCTGGCACTGCCAGGATTCTCATAATACTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGTGACCCGGTTCGCTCTGGCACTGCCAGGATTCTCATAATACTTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATACCAACGATAATGCTCCCGTGTTCACTCAGCCCGAGTACCACGTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATACCAACGATAATGCTCCCGTGTTCACTCAGCCCGAGTACCACGTAAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTCGTGAGAACGTTCCTGTAGGCACTCGGCTACTCACCGTAAAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTCGTGAGAACGTTCCTGTAGGCACTCGGCTACTCACCGTAAAAGCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATCCAGATGAAGGAGCCAATGGAGACGTGACGTATTCTTTCCGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATCCAGATGAAGGAGCCAATGGAGACGTGACGTATTCTTTCCGGAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAGAGACAAAATATCACAGCTATTTCAGTTGAATTCTCTGAGTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAGAGACAAAATATCACAGCTATTTCAGTTGAATTCTCTGAGTGGGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATAACAATATTGGGGGGTCTAGATTATGAGGACTCTGGATTCTATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATAACAATATTGGGGGGTCTAGATTATGAGGACTCTGGATTCTATGACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGATGTAGAAGCCCATGATGGGCCTGGTCTCCGAGCTAGAAGCAAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGATGTAGAAGCCCATGATGGGCCTGGTCTCCGAGCTAGAAGCAAGGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGTGACAGTTCTGGATGAAAATGACAACGCACCAGAAGTCACAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGGTGACAGTTCTGGATGAAAATGACAACGCACCAGAAGTCACAGTTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCTCTCACCAGCTCAGTCCAGGAATCTTCTTCCCCGGGTACAGTAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCTCTCACCAGCTCAGTCCAGGAATCTTCTTCCCCGGGTACAGTAATTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ACTTTTCAACGTGCATGACAGTGACTCAGGAGGAAATGGCCTAGTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ACTTTTCAACGTGCATGACAGTGACTCAGGAGGAAATGGCCTAGTCACAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTTCTATTCCAGATAATCTGCCATTCACACTTGAAAAGACCTATGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTTCTATTCCAGATAATCTGCCATTCACACTTGAAAAGACCTATGGAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TATTATCGGTTGTTGACACACAGAACACTGGACAGGGAAGAAGTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TATTATCGGTTGTTGACACACAGAACACTGGACAGGGAAGAAGTCTCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ATATAACATCACTGTAACTGCCACTGACCAGGGAACTCCTCCACTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ATATAACATCACTGTAACTGCCACTGACCAGGGAACTCCTCCACTGTCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CAGAAACTCATATTTCACTGCAAGTGATGGACATCAATGACAACCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAGAAACTCATATTTCACTGCAAGTGATGGACATCAATGACAACCCACCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ACTTTCCCTCATGCTTCCTACTCTGCTTACATTCCTGAAAACAACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ACTTTCCCTCATGCTTCCTACTCTGCTTACATTCCTGAAAACAACCCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGGAGCCTCCATCTTATCTATGACTGCTCAAGACCCTGACAGTGGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGGAGCCTCCATCTTATCTATGACTGCTCAAGACCCTGACAGTGGTGACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ATGCCCGAATCACTTACTCCCTGGCCGAAGACACCTTCCAGGGTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ATGCCCGAATCACTTACTCCCTGGCCGAAGACACCTTCCAGGGTGCACCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGTCCTCCTATGTCTCCATCAACTCCAATACAGGGATCCTATATGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGTCCTCCTATGTCTCCATCAACTCCAATACAGGGATCCTATATGCTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TTGCTCCTTCGACTATGAGCAGTTTAGAGACCTGCAGCTGCTGATGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TTGCTCCTTCGACTATGAGCAGTTTAGAGACCTGCAGCTGCTGATGACAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCAGTGACAGTGGAGACCCTCCACTCAGCAGCAATGTGTCACTGAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCAGTGACAGTGGAGACCCTCCACTCAGCAGCAATGTGTCACTGAGCCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTTGTGCTGGACCAGAACGACAATGTCCCTGAGATCCTGTACCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTTGTGCTGGACCAGAACGACAATGTCCCTGAGATCCTGTACCCCACCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCCTACTGATGGCTCCACTGGTGTGGAGCTGGCACCCCGCTCCGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCCTACTGATGGCTCCACTGGTGTGGAGCTGGCACCCCGCTCCGCAGATT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CCGGCTACCTGGTGACCAAAGTGGTGGCAGTGGACAGAGACTCAGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CCGGCTACCTGGTGACCAAAGTGGTGGCAGTGGACAGAGACTCAGGTCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AATGCCTGGCTGTCCTACAGCCTACTCAAGTCCAGCGAGCCGGGACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AATGCCTGGCTGTCCTACAGCCTACTCAAGTCCAGCGAGCCGGGACTATT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TGCAGTGGGGCTGCACACAGGCGAGGTGCGCACCGCACGGGCCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TGCAGTGGGGCTGCACACAGGCGAGGTGCGCACCGCACGGGCCCTGCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACAGAGACGCGCTCAAGCAGAGGCTTGTAGTGGTCGTCCAGGACCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACAGAGACGCGCTCAAGCAGAGGCTTGTAGTGGTCGTCCAGGACCATGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CAGCCCCCTCTCTCGGCCACCGTCACACTCACTGTGGCTGTGGCCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CAGCCCCCTCTCTCGGCCACCGTCACACTCACTGTGGCTGTGGCCGACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CATCCCAGATGTCCTGGCTGACTTGGGCAGCCTCAAGCCTTCAGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CATCCCAGATGTCCTGGCTGACTTGGGCAGCCTCAAGCCTTCAGCAGACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CAGACGACTCGGGCCTCACACTCTATCTCGTGGTGGCAGTGGCCGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CAGACGACTCGGGCCTCACACTCTATCTCGTGGTGGCAGTGGCCGCTGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TCCTGCGTCTTCCTGGCTTTTGTCACGGTGCTGCTAGCACTCAAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TCCTGCGTCTTCCTGGCTTTTGTCACGGTGCTGCTAGCACTCAAGCTGAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 ACGCTGGCACAAGTCACGCCTGCTTCACGCTGAAGGCAGCAGGTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 ACGCTGGCACAAGTCACGCCTGCTTCACGCTGAAGGCAGCAGGTTGGCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GTGTGCCTGCCTCGCACTTTGTGGGCGTGGACGGGGTTCGGGCTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GTGTGCCTGCCTCGCACTTTGTGGGCGTGGACGGGGTTCGGGCTTTCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 CAGACCTATTCCCACGAGGTCTCCCTCACCGCGGACTCGCGGAAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CAGACCTATTCCCACGAGGTCTCCCTCACCGCGGACTCGCGGAAGAGTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CCTGATCTTCTCCCAACCCAGCTATGCAGACACGCTCATCAGCCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CCTGATCTTCTCCCAACCCAGCTATGCAGACACGCTCATCAGCCGGGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 GTTGTGAGAAAAGCGAGCCTCTTCTGATAACTCAGGATTTACTTGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 GTTGTGAGAAAAGCGAGCCTCTTCTGATAACTCAGGATTTACTTGAAACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 AAAGGAGACCCTAATCTTCAG         CAAGCCCCGCCCAACACGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102401 AAAGGAGACCCTAATCTTCAGGTG...CAGCAAGCCCCGCCCAACACGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 CTGGCGTTTCTCTCAGGCCCAGAGACCCGGCACCAGCGG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 239627 CTGGCGTTTCTCTCAGGCCCAGAGACCCGGCACCAGCGGGTA...CAGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2483 CCCAAAATGGCGATGACACCGGCACCTGGCCCAACAACCAGTTTGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 250195 CCCAAAATGGCGATGACACCGGCACCTGGCCCAACAACCAGTTTGACACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2533 GAGATGCTGCAAGCCATGATCTTGGCGTCCGCCAGTG         AAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 250245 GAGATGCTGCAAGCCATGATCTTGGCGTCCGCCAGTGGTA...CAGAAGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2574 TGCTGATGGGAGCTCCACCCTGGGAGGGGGTGCCGGCACCATGGGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255751 TGCTGATGGGAGCTCCACCCTGGGAGGGGGTGCCGGCACCATGGGATTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2624 GCGCCCGCTACGGACCCCAGTTCACCCTGCAGCACGTGCCCGACTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255801 GCGCCCGCTACGGACCCCAGTTCACCCTGCAGCACGTGCCCGACTACCGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2674 CAGAATGTCTACATCCCAGGCAGCAATGCCACACTGACCAACGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255851 CAGAATGTCTACATCCCAGGCAGCAATGCCACACTGACCAACGCAGCTGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2724 CAAGCGGGATGGCAAGGCCCCAGCAGGTGGCAATGGCAACAAGAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255901 CAAGCGGGATGGCAAGGCCCCAGCAGGTGGCAATGGCAACAAGAAGAAGT

   2800     .    :    .    :
   2774 CGGGCAAGAAGGAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||
 255951 CGGGCAAGAAGGAGAAGAAG