seq1 = pF1KE0389.tfa, 2508 bp
seq2 = pF1KE0389/gi568815595r_44985641.tfa (gi568815595r:44985641_45246287), 260647 bp

>pF1KE0389 2508
>gi568815595r:44985641_45246287 (Chr3)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-292  (127667-127876)   100% ->
293-655  (133843-134205)   100% ->
656-1024  (135447-135815)   100% ->
1025-1246  (150720-150941)   100% ->
1247-1627  (152631-153011)   100% ->
1628-1993  (154750-155115)   100% ->
1994-2081  (157147-157234)   100% ->
2082-2508  (160221-160647)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGCCTGAACTGCGGGGTCTCTATCGCACTGCTAGGGGTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGCCTGAACTGCGGGGTCTCTATCGCACTGCTAGGGGTTCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGTGCGGCGCGCCTGCCGCGCGGGGCAG         AAGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GCTGGGTGCGGCGCGCCTGCCGCGCGGGGCAGGTG...CAGAAGCTTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATTGCTCTGCCACGAGAAAGCAACATTACAGTTCTCATAAAGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127676 AGATTGCTCTGCCACGAGAAAGCAACATTACAGTTCTCATAAAGCTGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCCGACTCTGCTGGCAAAACCCTGTTACATCGTCATTTCTAAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127726 ACCCCGACTCTGCTGGCAAAACCCTGTTACATCGTCATTTCTAAAAGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATAACCATGTTGTCCATCAAGTCTGGAGAAAGAATAGTCTTTACCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127776 TATAACCATGTTGTCCATCAAGTCTGGAGAAAGAATAGTCTTTACCTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTGCCAGAGTCCTGAGAATCACTTTGTCATAGAGATCCAGAAAAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127826 GCTGCCAGAGTCCTGAGAATCACTTTGTCATAGAGATCCAGAAAAATATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 G         ACTGTATGTCAGGCCCATGTCCTTTTGGGGAGGTTCAGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127876 GGTA...CAGACTGTATGTCAGGCCCATGTCCTTTTGGGGAGGTTCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCAGCCCTCGACATCGTTGTTGCCTACCCTCAACAGAACTTTCATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133883 TCAGCCCTCGACATCGTTGTTGCCTACCCTCAACAGAACTTTCATCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTCAAAGCTCATAAGAGCATCGGTTTAGAGCTGCAGTTTTCCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133933 ATGTCAAAGCTCATAAGAGCATCGGTTTAGAGCTGCAGTTTTCCATCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGCCTGAGGCAGATCGGTCCGGGTGAGAGCTGCCCAGACGGAGTCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133983 CGCCTGAGGCAGATCGGTCCGGGTGAGAGCTGCCCAGACGGAGTCACTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCCATCAGCGGCCGAATCGATGCCACCGTGGTCAGGATCGGAACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134033 CTCCATCAGCGGCCGAATCGATGCCACCGTGGTCAGGATCGGAACCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCAGCAATGGCACTGTGTCCCGGATCAAGATGCAAGAAGGAGTGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134083 GCAGCAATGGCACTGTGTCCCGGATCAAGATGCAAGAAGGAGTGAAAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCTTACACCTCCCATGGTTCCACCCCAGAAATGTCTCCGGCTTCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134133 GCCTTACACCTCCCATGGTTCCACCCCAGAAATGTCTCCGGCTTCAGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGCAAACCGCTCATCTATAAAAC         GTCTGTGCATCATCGAGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 134183 TGCAAACCGCTCATCTATAAAACGTG...TAGGTCTGTGCATCATCGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGTGTTTGAGGGTGAAGGCTCAGCAACCCTGATGTCTGCCAACTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135465 CTGTGTTTGAGGGTGAAGGCTCAGCAACCCTGATGTCTGCCAACTACCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAAGGCTTCCCTGAGGATGAGCTCATGACGTGGCAGTTTGTCGTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135515 GAAGGCTTCCCTGAGGATGAGCTCATGACGTGGCAGTTTGTCGTTCCTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACACCTGCGGGCCAGCGTCTCCTTCCTCAACTTCAACCTCTCCAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135565 ACACCTGCGGGCCAGCGTCTCCTTCCTCAACTTCAACCTCTCCAACTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGAGGAAGGAGGAGCGGGTTGAATACTACATCCCGGGCTCCACCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135615 AGAGGAAGGAGGAGCGGGTTGAATACTACATCCCGGGCTCCACCACCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CCCGAGGTGTTCAAGCTGGAGGACAAGCAGCCTGGGAACATGGCGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135665 CCCGAGGTGTTCAAGCTGGAGGACAAGCAGCCTGGGAACATGGCGGGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTTCAACCTCTCTCTGCAAGGCTGTGACCAAGATGCCCAAAGTCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135715 CTTCAACCTCTCTCTGCAAGGCTGTGACCAAGATGCCCAAAGTCCAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TCCTCCGGCTGCAGTTCCAAGTTTTGGTCCAACATCCACAAAATGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135765 TCCTCCGGCTGCAGTTCCAAGTTTTGGTCCAACATCCACAAAATGAAAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 A         ATAAAATCTACGTGGTTGACTTGAGTAATGAGCGAGCCAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135815 AGTG...CAGATAAAATCTACGTGGTTGACTTGAGTAATGAGCGAGCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GTCACTCACCATCGAGCCACGGCCCGTCAAACAGAGCCGCAAGTTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150760 GTCACTCACCATCGAGCCACGGCCCGTCAAACAGAGCCGCAAGTTTGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CTGGCTGTTTCGTGTGTCTAGAATCTCGGACCTGCAGTAGCAACCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150810 CTGGCTGTTTCGTGTGTCTAGAATCTCGGACCTGCAGTAGCAACCTCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGACATCTGGCTCCAAACACAAAATCTCCTTCCTTTGTGATGATCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150860 CTGACATCTGGCTCCAAACACAAAATCTCCTTCCTTTGTGATGATCTGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 ACGTCTGTGGATGAATGTGGAAAAAACCATAA         GCTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 150910 ACGTCTGTGGATGAATGTGGAAAAAACCATAAGTA...CAGGCTGCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACCACCGGTACTGCCAAAGGAAATCCTACTCACTCCAGGTGCCCAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152640 ACCACCGGTACTGCCAAAGGAAATCCTACTCACTCCAGGTGCCCAGTGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ATCCTCCACCTGCCTGTGGAGCTGCATGACTTCTCCTGGAAGCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152690 ATCCTCCACCTGCCTGTGGAGCTGCATGACTTCTCCTGGAAGCTGCTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GCCCAAGGACAGGCTCAGCCTGGTGCTGGTGCCAGCCCAGAAGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152740 GCCCAAGGACAGGCTCAGCCTGGTGCTGGTGCCAGCCCAGAAGCTGCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGCATACACACGAGAAGCCCTGCAACACCAGCTTCAGCTACCTCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152790 AGCATACACACGAGAAGCCCTGCAACACCAGCTTCAGCTACCTCGTGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AGTGCCATACCCAGCCAGGACCTGTACTTCGGCTCCTTCTGCCCGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152840 AGTGCCATACCCAGCCAGGACCTGTACTTCGGCTCCTTCTGCCCGGGAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTCTATCAAGCAGATCCAGGTGAAGCAGAACATCTCGGTGACCCTTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152890 CTCTATCAAGCAGATCCAGGTGAAGCAGAACATCTCGGTGACCCTTCGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CCTTTGCCCCCAGCTTCCAACAAGAGGCCTCCAGGCAGGGTCTGACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152940 CCTTTGCCCCCAGCTTCCAACAAGAGGCCTCCAGGCAGGGTCTGACGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 TCCTTTATACCTTATTTCAAAG         AGGAAGGCGTTTTCACGGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 152990 TCCTTTATACCTTATTTCAAAGGTA...CAGAGGAAGGCGTTTTCACGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GACCCCTGACACAAAAAGCAAGGTCTACCTGAGGACCCCCAACTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154769 GACCCCTGACACAAAAAGCAAGGTCTACCTGAGGACCCCCAACTGGGACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 GGGGCCTGCCATCCCTCACCTCTGTGTCCTGGAACATCAGCGTGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154819 GGGGCCTGCCATCCCTCACCTCTGTGTCCTGGAACATCAGCGTGCCCAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GACCAGGTGGCCTGCCTGACTTTCTTTAAGGAGCGGAGCGGCGTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154869 GACCAGGTGGCCTGCCTGACTTTCTTTAAGGAGCGGAGCGGCGTGGTCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CCAGACAGGGCGCGCATTCATGATCATCCAGGAGCAGCGGACCCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154919 CCAGACAGGGCGCGCATTCATGATCATCCAGGAGCAGCGGACCCGGGCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 AGGAGATCTTCAGCCTGGACGAGGATGTGCTCCCCAAGCCAAGCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154969 AGGAGATCTTCAGCCTGGACGAGGATGTGCTCCCCAAGCCAAGCTTCCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 CATCACAGCTTCTGGGTCAACATCTCTAACTGCAGCCCCACGAGCGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155019 CATCACAGCTTCTGGGTCAACATCTCTAACTGCAGCCCCACGAGCGGCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 GCAGCTAGACCTGCTCTTCTCGGTGACACTTACCCCAAGGACTGTGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 155069 GCAGCTAGACCTGCTCTTCTCGGTGACACTTACCCCAAGGACTGTGGGTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1994       ACTTGACTGTCATCCTCATCGCAGCGGTGGGAGGTGGAGTCTTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155119 ...CAGACTTGACTGTCATCCTCATCGCAGCGGTGGGAGGTGGAGTCTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 CTGCTGTCTGCCCTCGGGCTCATCATTTGCTGTGTGAAAAAGAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 157191 CTGCTGTCTGCCCTCGGGCTCATCATTTGCTGTGTGAAAAAGAAGTA...

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2082    GAAAAAGAAGACAAACAAGGGCCCCGCTGTGGGTATCTACAATGACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160218 TAGGAAAAAGAAGACAAACAAGGGCCCCGCTGTGGGTATCTACAATGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 ACATCAATACTGAGATGCCGAGGCAGCCAAAAAAGTTTCAGAAAGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160268 ACATCAATACTGAGATGCCGAGGCAGCCAAAAAAGTTTCAGAAAGGGCGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 AAGGACAATGACTCCCATGTGTATGCAGTCATCGAGGACACCATGGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160318 AAGGACAATGACTCCCATGTGTATGCAGTCATCGAGGACACCATGGTATA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 TGGGCATCTGCTACAGGATTCCAGCGGCTCCTTCCTGCAGCCAGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160368 TGGGCATCTGCTACAGGATTCCAGCGGCTCCTTCCTGCAGCCAGAGGTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 ACACCTACCGGCCGTTCCAGGGCACCATGGGGGTCTGTCCTCCCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160418 ACACCTACCGGCCGTTCCAGGGCACCATGGGGGTCTGTCCTCCCTCCCCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CCCACCATATGCTCCAGGGCCCCAACTGCAAAGTTGGCCACTGAGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160468 CCCACCATATGCTCCAGGGCCCCAACTGCAAAGTTGGCCACTGAGGAGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 ACCTCCTCGCTCCCCTCCTGAGTCTGAGAGTGAACCGTACACCTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160518 ACCTCCTCGCTCCCCTCCTGAGTCTGAGAGTGAACCGTACACCTTCTCCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 ATCCCAACAATGGGGATGTAAGCAGCAAGGACACAGACATTCCCTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160568 ATCCCAACAATGGGGATGTAAGCAGCAAGGACACAGACATTCCCTTACTG

   2550     .    :    .    :    .    :
   2479 AACACTCAGGAGCCCATGGAGCCAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 160618 AACACTCAGGAGCCCATGGAGCCAGCAGAA