seq1 = pF1KE0379.tfa, 2382 bp
seq2 = pF1KE0379/gi568815593f_141050258.tfa (gi568815593f:141050258_141252639), 202382 bp

>pF1KE0379 2382
>gi568815593f:141050258_141252639 (Chr5)

1-2382  (100001-102382)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCAAACTAAAGTACAGAACAAGAAAAGGCAAGTGGCTTTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCAAACTAAAGTACAGAACAAGAAAAGGCAAGTGGCTTTCTTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTATTGATGCTTTGGGGAGAGGTGGGTTCTGAATCGATTCAGTATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTATTGATGCTTTGGGGAGAGGTGGGTTCTGAATCGATTCAGTATTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTGGAGGAGACAGAAAGTGGCACGTTTGTGGCCAACTTGACAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTGGAGGAGACAGAAAGTGGCACGTTTGTGGCCAACTTGACAAAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGACTGAGGGTGGGGGAGCTGGCTTCGCGGGGCGCTCGGGTTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGACTGAGGGTGGGGGAGCTGGCTTCGCGGGGCGCTCGGGTTGTTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAAGGGAACAGACAACATTTGCAGTTTGATCCACAGACCCATGATTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAAGGGAACAGACAACATTTGCAGTTTGATCCACAGACCCATGATTTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTAAATGAAAAACTGGACCGGGAGGAGCTGTGTGGCTCCACTGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTAAATGAAAAACTGGACCGGGAGGAGCTGTGTGGCTCCACTGAGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTGTGCTACCTTTCCAAGTGTTACTGGAAAACCCCTTGCAGTTTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGTGTGCTACCTTTCCAAGTGTTACTGGAAAACCCCTTGCAGTTTTTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTTCCTTGCGAGTCAGAGATATAAATGACCACGCCCCGGAATTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTTCCTTGCGAGTCAGAGATATAAATGACCACGCCCCGGAATTCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAGAGAAATGCTCCTGAAAATATCAGAAATTACTATGCCAGGAAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAGAGAAATGCTCCTGAAAATATCAGAAATTACTATGCCAGGAAAGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCCTTTGAAAATGGCACACGATTTAGACACCGGCAGCAACGGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTCCTTTGAAAATGGCACACGATTTAGACACCGGCAGCAACGGCCTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGGTACACAATCAGCTCCAACCCTCACTTCCACGTTCTCACCCGCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGGTACACAATCAGCTCCAACCCTCACTTCCACGTTCTCACCCGCAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAGCGAAGGCAGGAAGTTCCCGGAGCTGGTGCTAGACAAACCGTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAGCGAAGGCAGGAAGTTCCCGGAGCTGGTGCTAGACAAACCGTTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGCGAGGAGCAGCCCCAACTCAGGCTAACGCTGATCGCGCTGGATGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCGAGGAGCAGCCCCAACTCAGGCTAACGCTGATCGCGCTGGATGGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCTCCGCCCCGGTCAGGGACCTCCGAGATTCAGATCCAGGTTTTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTCTCCGCCCCGGTCAGGGACCTCCGAGATTCAGATCCAGGTTTTGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAATGACAACGTCCCCGAGTTTGCTCAGGAGCTCTATGAAGCACAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAATGACAACGTCCCCGAGTTTGCTCAGGAGCTCTATGAAGCACAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTGAGAACAACCCCCTCGGCTCTCTGGTTATTACCGTCTCAGCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTGAGAACAACCCCCTCGGCTCTCTGGTTATTACCGTCTCAGCCAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTAGATGCAGGATCGTTTGGGAAGGTATCTTACGCCCTGTTTCAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTAGATGCAGGATCGTTTGGGAAGGTATCTTACGCCCTGTTTCAAGTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGACGTCAACCAACCCTTCGAAATAAACGCAATCACAGGAGAAATTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGACGTCAACCAACCCTTCGAAATAAACGCAATCACAGGAGAAATTCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGAGAAAGGCTTTGGATTTTGAGGAAATTCAGTCTTATGACGTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAGAAAGGCTTTGGATTTTGAGGAAATTCAGTCTTATGACGTGGATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGAGGCTACAGATGGTGGAGGCCTATCAGGAAAATGCTCTTTAGTCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGAGGCTACAGATGGTGGAGGCCTATCAGGAAAATGCTCTTTAGTCGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGGTCCTGGACGTGAATGACAATGCCCCTGAACTCACCATGTCGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGGTCCTGGACGTGAATGACAATGCCCCTGAACTCACCATGTCGTTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATCAGCCTCATCCCAGAAAACTTACCAGAGATCACAGTGGCAGTTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATCAGCCTCATCCCAGAAAACTTACCAGAGATCACAGTGGCAGTTTTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTTTCAGATGCAGACTCTGGACATAACCAACAGGTTATTTGTTCAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTTTCAGATGCAGACTCTGGACATAACCAACAGGTTATTTGTTCAATAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAACAATCTCCCCTTTCTACTAAGACCTTCCGTGGAGAATTTCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAACAATCTCCCCTTTCTACTAAGACCTTCCGTGGAGAATTTCTACACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGGTAACAGAAGGCGCGCTGGACAGAGAGAGCAGAGCCGAGTACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTGGTAACAGAAGGCGCGCTGGACAGAGAGAGCAGAGCCGAGTACAACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CACTATCACGGTCACTGATTTGGGGACACCAAGGCTGAAAACCCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CACTATCACGGTCACTGATTTGGGGACACCAAGGCTGAAAACCCAGCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCATAACTGTGCAGGTCTCCGACGTCAATGACAACGTCCCCGCCTTCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 101301 GCATAACTGTGCAGGTCTCCGACGTCAATGACAACGCCCCCGCCTTCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CAAACCTCCTACACCCTGTTCGTCCGCGAGAACAACAGCCCCGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CAAACCTCCTACACCCTGTTCGTCCGCGAGAACAACAGCCCCGCCCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CATCGGCAGCGTCAGCGCCACAGACAGAGACTCAGGCATCAACGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CATCGGCAGCGTCAGCGCCACAGACAGAGACTCAGGCATCAACGCCCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCACCTACTCGCTGCTGCCGCCCCAGGACCCGCACCTGCCCCTCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCACCTACTCGCTGCTGCCGCCCCAGGACCCGCACCTGCCCCTCTCTTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGGTCTCCATCAACGCGGACAACGGCCACCTGTTTGCCCTCAGGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGGTCTCCATCAACGCGGACAACGGCCACCTGTTTGCCCTCAGGTCGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGACTACGAGGCCCTGCAGTCTTTCGAGTTCCGCGTGGGCGCCACAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGACTACGAGGCCCTGCAGTCTTTCGAGTTCCGCGTGGGCGCCACAGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GCGGCTCCCCGGCGTTGAGCAGCGAGGCGCTGGTGCGCTTGCTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GCGGCTCCCCGGCGTTGAGCAGCGAGGCGCTGGTGCGCTTGCTGGTGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GACGCCAACGACAACTCGCCCTTCGTGTTGTACCCGCTGCAGAACGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GACGCCAACGACAACTCGCCCTTCGTGTTGTACCCGCTGCAGAACGGCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CGCGCCCTGCACCGAGCTGGTGCCCCGGGCGGCCGAGCCGGGCTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CGCGCCCTGCACCGAGCTGGTGCCCCGGGCGGCCGAGCCGGGCTACCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACGGCGACTCGGGCCAGAACGCCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACGGCGACTCGGGCCAGAACGCCTGGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TCGTACCAGCTGCTCAAGGCCACGGAGCTCGGTCTGTTCGGCGTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TCGTACCAGCTGCTCAAGGCCACGGAGCTCGGTCTGTTCGGCGTGTGGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GCACAATGGCGAGGTGCGCACCGCCAGGCTGCTGAGCGAGCGAGACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GCACAATGGCGAGGTGCGCACCGCCAGGCTGCTGAGCGAGCGAGACGCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCAAGCACAGGCTGGTGGTGCTTGTCAAGGACAATGGCGAGCCTCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCAAGCACAGGCTGGTGGTGCTTGTCAAGGACAATGGCGAGCCTCCGCGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TCGGCCACCGCCACGCTGCACGTGCTCCTGGTGGACGGCTTCTCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TCGGCCACCGCCACGCTGCACGTGCTCCTGGTGGACGGCTTCTCCCAGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CTACCTGCCTCTCCCTGAGGCGGCCCCGGCCCAAGCCCAGGCCGACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CTACCTGCCTCTCCCTGAGGCGGCCCCGGCCCAAGCCCAGGCCGACTCTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 TCACCGTCTACCTGGTGGTGGCGTTGGCCTCGGTGTCGTCGCTCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TCACCGTCTACCTGGTGGTGGCGTTGGCCTCGGTGTCGTCGCTCTTCCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TTTTCGGTGCTCCTGTTCGTGGCGGTGCGGCTGTGCAGGAGGAGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TTTTCGGTGCTCCTGTTCGTGGCGGTGCGGCTGTGCAGGAGGAGCAGGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GGCCTCGGTGGGTCGCTACTCGGTGCCCGAGGGTCCCTTTCCAGGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GGCCTCGGTGGGTCGCTACTCGGTGCCCGAGGGTCCCTTTCCAGGGCATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 TGGTGGATGTGAGCGGCACCGGGACCCTATCCCAGAGCTACCAGTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 TGGTGGATGTGAGCGGCACCGGGACCCTATCCCAGAGCTACCAGTACAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GTGTGTCTGACGGGAGGCTCAGAAACAAATGAGTTCAAGTTCCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GTGTGTCTGACGGGAGGCTCAGAAACAAATGAGTTCAAGTTCCTGAAGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 GATTATGCCCAACTTCCCTCCTCAGGGCACTGAGAGAGAAATGGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 GATTATGCCCAACTTCCCTCCTCAGGGCACTGAGAGAGAAATGGAAGAAA

   2350     .    :    .    :    .    :
   2351 CCCCCACCTCTCGGAATAGCTTCCCGTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 CCCCCACCTCTCGGAATAGCTTCCCGTTCAGT