seq1 = pF1KE0373.tfa, 2172 bp
seq2 = pF1KE0373/gi568815593r_102136861.tfa (gi568815593r:102136861_102396262), 259402 bp

>pF1KE0373 2172
>gi568815593r:102136861_102396262 (Chr5)

(complement)

1-355  (100001-100355)   100% ->
356-619  (104657-104920)   100% ->
620-802  (125457-125639)   100% ->
803-899  (132483-132579)   100% ->
900-1021  (134230-134351)   100% ->
1022-1128  (135944-136050)   100% ->
1129-1273  (138176-138320)   100% ->
1274-1469  (138953-139148)   100% ->
1470-1620  (146475-146625)   100% ->
1621-1811  (148821-149011)   100% ->
1812-1876  (155481-155545)   100% ->
1877-2014  (156875-157012)   100% ->
2015-2172  (159245-159402)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAGCGCCAAAGGTATTGAGAACTTGGCTTTTGTCCCCTCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAGCGCCAAAGGTATTGAGAACTTGGCTTTTGTCCCCTCCAGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACATCCTGCGCCGCTTGTCTGCGTCGCCCTCCCAAATCGAAGTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACATCCTGCGCCGCTTGTCTGCGTCGCCCTCCCAAATCGAAGTCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTGTCCTCTGACCCCCAAAGAGAGAATTCTCAGCCACAGGAGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTGTCCTCTGACCCCCAAAGAGAGAATTCTCAGCCACAGGAGCTTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCCCCAGGAGCCCCAGAAGTCACCAGAGCCATCTCTGCCTTCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCCCCAGGAGCCCCAGAAGTCACCAGAGCCATCTCTGCCTTCAGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCCAATGTCTCCGAAGAGAAGCTCCGGTCACTGTCGCTGTCCGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCCAATGTCTCCGAAGAGAAGCTCCGGTCACTGTCGCTGTCCGAGTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGGGGTCTTACGGCTGGAGGAACTTCCATCCTCAATGTCTCCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGGGGTCTTACGGCTGGAGGAACTTCCATCCTCAATGTCTCCAGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCAACACACCTGGAGGCTTTCTGCTTCACTACTGCCTCTTGGCCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCAACACACCTGGAGGCTTTCTGCTTCACTACTGCCTCTTGGCCGTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAAG         GTATTGTAGTTAATGGCCTAGTAAATATTAGCATTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAAGGTA...TAGGTATTGTAGTTAATGGCCTAGTAAATATTAGCATTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCACTGTTGAGAAGCGTTATGAAATGAAGAGTTCCCTGACTGGCCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104693 CCACTGTTGAGAAGCGTTATGAAATGAAGAGTTCCCTGACTGGCCTGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCATCAAGCTACGATATTTCATTCTGTTTGTTGTCTTTATTTGTATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104743 TCATCAAGCTACGATATTTCATTCTGTTTGTTGTCTTTATTTGTATCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTTTGGTGAAAGAGGACATAAGCCGAGATGGCTTGCATTTGCAGCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104793 CTTTGGTGAAAGAGGACATAAGCCGAGATGGCTTGCATTTGCAGCCTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGATTGGACTGGGAGCACTTGTATTCTCATTGCCACAATTTTTCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104843 TGATTGGACTGGGAGCACTTGTATTCTCATTGCCACAATTTTTCAGTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAATATAAATTGGGGTCTCTTTTTGAAG         ACACTTGTGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104893 GAATATAAATTGGGGTCTCTTTTTGAAGGTA...AAGACACTTGTGTAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AACAAGGAATAGCACCAGTTGTACATCTTCAACTTCTTCACTTTCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125470 AACAAGGAATAGCACCAGTTGTACATCTTCAACTTCTTCACTTTCTAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACTTGTATGTCTTCATCTTGGGACAACTATTGCTGGGGGCAGGAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125520 ACTTGTATGTCTTCATCTTGGGACAACTATTGCTGGGGGCAGGAGGAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCTCTTTATACTCTGGGAACAGCCTTTCTTGATGATTCTGTGCCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125570 CCTCTTTATACTCTGGGAACAGCCTTTCTTGATGATTCTGTGCCCACACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAAGTCTTCTCTCTATATAG         GAACCGGTTATGCTATGTCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125620 CAAGTCTTCTCTCTATATAGGTA...TAGGAACCGGTTATGCTATGTCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTTAGGCCCTGCTATTGGCTATGTATTGGGAGGACAACTGCTAACCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132504 TCTTAGGCCCTGCTATTGGCTATGTATTGGGAGGACAACTGCTAACCATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TACATTGATGTTGCTATGGGAGAAAG         CACTGATGTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 132554 TACATTGATGTTGCTATGGGAGAAAGGCA...TAGCACTGATGTCACTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGATGATCCGCGATGGTTGGGAGCTTGGTGGATTGGGTTTCTTCTATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134245 GGATGATCCGCGATGGTTGGGAGCTTGGTGGATTGGGTTTCTTCTATCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GGATCTTTGCTTGGTCTTTAATAATACCTTTTTCTTGCTTTCCAAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134295 GGATCTTTGCTTGGTCTTTAATAATACCTTTTTCTTGCTTTCCAAAACAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTACCAG         GTACAGCAGAAATTCAAGCTGGAAAAACTTCCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134345 TTACCAGGTA...TAGGTACAGCAGAAATTCAAGCTGGAAAAACTTCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGCTCATCAGAGTAATAGTAATGCAGATGTGAAATTTGGAAAAAGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135978 GGCTCATCAGAGTAATAGTAATGCAGATGTGAAATTTGGAAAAAGTATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AAGATTTTCCAGCTGCTCTAAAG         AATTTGATGAAGAATGCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 136028 AAGATTTTCCAGCTGCTCTAAAGGTA...TAGAATTTGATGAAGAATGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTCTTTATGTGTTTAGTTCTATCAACTTCTTCAGAAGCCTTAATTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138194 GTCTTTATGTGTTTAGTTCTATCAACTTCTTCAGAAGCCTTAATTACTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGGATTTGCTACATTTTTACCTAAATTTATAGAAAATCAATTCGGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138244 TGGATTTGCTACATTTTTACCTAAATTTATAGAAAATCAATTCGGATTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CATCCAGCTTCGCAGCTACTCTTGGAG         GGGCTGTTTTAATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 138294 CATCCAGCTTCGCAGCTACTCTTGGAGGTA...TAGGGGCTGTTTTAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCTGGAGCTGCTCTCGGTCAAATTTTAGGTGGCTTCCTTGTTTCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138967 CCTGGAGCTGCTCTCGGTCAAATTTTAGGTGGCTTCCTTGTTTCAAAATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CAGAATGACATGTAAAAACACAATGAAGTTTGCACTGTTCACATCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139017 CAGAATGACATGTAAAAACACAATGAAGTTTGCACTGTTCACATCTGGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TTGCACTTACGCTGAGTTTTGTATTTATGTATGCCAAATGTGAAAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139067 TTGCACTTACGCTGAGTTTTGTATTTATGTATGCCAAATGTGAAAATGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCATTTGCTGGTGTATCTGAATCATATAATGG         GACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 139117 CCATTTGCTGGTGTATCTGAATCATATAATGGGTA...CAGGACTGGAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 ATTGGGAAACTTGATAGCCCCTTGTAATGCCAATTGTAACTGTTCGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146484 ATTGGGAAACTTGATAGCCCCTTGTAATGCCAATTGTAACTGTTCGCGAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CATATTATTATCCTGTCTGTGGAGATGGAGTCCAATATTTTTCTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146534 CATATTATTATCCTGTCTGTGGAGATGGAGTCCAATATTTTTCTCCCTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 TTTGCAGGCTGTTCAAACCCAGTTGCACACAGGAAGCCAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 146584 TTTGCAGGCTGTTCAAACCCAGTTGCACACAGGAAGCCAAAGGTA...TA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1621  GTATATTACAACTGTTCCTGTATTGAAAGGAAAACAGAAATAACATCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148820 GGTATATTACAACTGTTCCTGTATTGAAAGGAAAACAGAAATAACATCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CTGCAGAAACTTTTGGTTTTGAAGCTAAAGCTGGAAAATGTGAAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148870 CTGCAGAAACTTTTGGTTTTGAAGCTAAAGCTGGAAAATGTGAAACTCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TGTGCGAAACTGCCCATATTCCTTTGCATTTTCTTTATTGTAATTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148920 TGTGCGAAACTGCCCATATTCCTTTGCATTTTCTTTATTGTAATTATTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TACCTTTATGGCCGGTACTCCTATAACTGTGTCTATCCTAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 148970 TACCTTTATGGCCGGTACTCCTATAACTGTGTCTATCCTAAGGTA...CA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1812  GTGTGTTAATCACAGACAACGGTCCCTAGCCTTGGGAATACAATTTATG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155480 GGTGTGTTAATCACAGACAACGGTCCCTAGCCTTGGGAATACAATTTATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GTCCTTCGATTATTAG         GGACAATTCCTGGACCAATTATATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 155530 GTCCTTCGATTATTAGGTA...TAGGGACAATTCCTGGACCAATTATATT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TGGTTTCACAATAGACAGCACATGTATTCTTTGGGATATAAATGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156900 TGGTTTCACAATAGACAGCACATGTATTCTTTGGGATATAAATGATTGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GAATTAAAGGAGCTTGCTGGATTTATGATAACATCAAGATGGCCCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156950 GAATTAAAGGAGCTTGCTGGATTTATGATAACATCAAGATGGCCCATATG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CTAGTAGCCATAA         GTGTTACTTGTAAAGTTATCACCATGTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 157000 CTAGTAGCCATAAGTA...TAGGTGTTACTTGTAAAGTTATCACCATGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CTTCAATGGATTTGCAATCTTTTTGTATAAACCACCTCCATCAGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159273 CTTCAATGGATTTGCAATCTTTTTGTATAAACCACCTCCATCAGCCACAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 ATGTGTCATTTCATAAAGAGAATGCAGTTGTGACTAATGTTTTAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159323 ATGTGTCATTTCATAAAGAGAATGCAGTTGTGACTAATGTTTTAGCAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :
   2143 CAGGATCTCAACAAAATAGTAAAAGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 159373 CAGGATCTCAACAAAATAGTAAAAGAAGGG