seq1 = pF1KE0371.tfa, 1686 bp
seq2 = pF1KE0371/gi568815581f_74824633.tfa (gi568815581f:74824633_75033542), 208910 bp

>pF1KE0371 1686
>gi568815581f:74824633_75033542 (Chr17)

1-313  (100001-100313)   100% ->
314-450  (100924-101060)   100% ->
451-509  (102591-102649)   100% ->
510-643  (103033-103166)   100% ->
644-1518  (105647-106521)   100% ->
1519-1686  (108743-108910)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGAGGAGCTGGCCCAGGGCCCCAAGGAGAGCCCCCCGGCGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGAGGAGCTGGCCCAGGGCCCCAAGGAGAGCCCCCCGGCGCCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGGGCCCCAGGGAGGTGTGGAAGAAGGGTGGCCGCCTGCTGTCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCGGGCCCCAGGGAGGTGTGGAAGAAGGGTGGCCGCCTGCTGTCGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGGCGGTGAACGTGCTGCTCCTCGCCTGCACGCTCATCAGCGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGGCGGTGAACGTGCTGCTCCTCGCCTGCACGCTCATCAGCGGCGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTCAACAAGGTGGCCGTGTACGACACCGACGTGTTCGCGCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTCAACAAGGTGGCCGTGTACGACACCGACGTGTTCGCGCTGCTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCGATGATGCTGCTGGCAACGCTCTGGATCCTCTTCTACCTCCTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCGATGATGCTGCTGGCAACGCTCTGGATCCTCTTCTACCTCCTCCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGTGCGCTGCCCCTGCGCGGTACCCTACCGGGACGCGCACGCTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGTGCGCTGCCCCTGCGCGGTACCCTACCGGGACGCGCACGCTGGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTGGCTCCGAG         GTGGGCTGGTGCTGTTTGGAATCTGCAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTGGCTCCGAGGTG...CAGGTGGGCTGGTGCTGTTTGGAATCTGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCATCATGGATGTCTTCAAGACCGGCTACTACTCCAGTTTCTTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100952 CCTCATCATGGATGTCTTCAAGACCGGCTACTACTCCAGTTTCTTTGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCAGTCAGCCATCAAGATCCTGCACCCCCTCATCCAGGCTGTGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 GCCAGTCAGCCATCAAGATCCTGCACCCCCTCATCCAGGCTGTGTTTGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATCATCCAG         ACCTACTTTCTCTGGGTCTCTGCTAAAGACTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 ATCATCCAGGTG...CAGACCTACTTTCTCTGGGTCTCTGCTAAAGACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGTTCACGTCCACCTGGATCTGACCTG         GTGTGGTCTCATGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102623 CGTTCACGTCCACCTGGATCTGACCTGGTG...CAGGTGTGGTCTCATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCACACTCACCACCAACCTGGCCATCTGGATGGCGGCCGTGGTGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103047 TCACACTCACCACCAACCTGGCCATCTGGATGGCGGCCGTGGTGGATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTGTGCACCAATCCCACTCCTACAGCAGTTCTCACAGCAACGCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103097 TCTGTGCACCAATCCCACTCCTACAGCAGTTCTCACAGCAACGCCAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCCGTCTCATCTCTGACC         AGCATGCAGACAACCCGGTCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103147 CGCCCGTCTCATCTCTGACCGTG...CAGAGCATGCAGACAACCCGGTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGGAGACTCCTGCCTCTGCAGCACGGCCGTCTGCCAGATCTTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105668 GAGGAGACTCCTGCCTCTGCAGCACGGCCGTCTGCCAGATCTTCCAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGTACTTCTACCTATATCCCTTCAACATCGAGTACAGCCTCTTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105718 GGGTACTTCTACCTATATCCCTTCAACATCGAGTACAGCCTCTTCGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACCATGCTGTATGTCATGTGGAAGAATGTGGGTAGATTCCTGGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105768 CACCATGCTGTATGTCATGTGGAAGAATGTGGGTAGATTCCTGGCCTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCCCTGGCCACAGCCACACCCCAACCCCTGTCAGCCTCTTCCGGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105818 CCCCTGGCCACAGCCACACCCCAACCCCTGTCAGCCTCTTCCGGGAGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTTTTTGCTGGCCCGGTTCTGGGCCTGCTGCTCTTCGTGGTGGGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105868 TTTTTTGCTGGCCCGGTTCTGGGCCTGCTGCTCTTCGTGGTGGGGCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGTCTTCATCATCTACGAGGTTCAAGTGAGCGGGGACGGGAGCCGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105918 TGTCTTCATCATCTACGAGGTTCAAGTGAGCGGGGACGGGAGCCGCACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GGCAGGCCCTGGTCATCTACTACAGCTTCAACATTGTCTGCTTGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105968 GGCAGGCCCTGGTCATCTACTACAGCTTCAACATTGTCTGCTTGGGACTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ACCACCTTGGTCAGCCTGAGCGGCTCCATCATCTACCGTTTTGACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106018 ACCACCTTGGTCAGCCTGAGCGGCTCCATCATCTACCGTTTTGACCGCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGCCATGGACCACCATAAGAACCCCACGCGCACTCTGGACGTGGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106068 GGCCATGGACCACCATAAGAACCCCACGCGCACTCTGGACGTGGCCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGATGGGTGCCGCCCTGGGTCAGTACGCCATCTCTTACTACTCCATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106118 TGATGGGTGCCGCCCTGGGTCAGTACGCCATCTCTTACTACTCCATCGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GCTGTGGTGGCGGGCACACCCCAGGACCTGCTGGCAGGGCTCAACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106168 GCTGTGGTGGCGGGCACACCCCAGGACCTGCTGGCAGGGCTCAACCTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCATGCACTGCTCATGATCGCCCAGCACACCTTCCAGAACATGTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106218 CCATGCACTGCTCATGATCGCCCAGCACACCTTCCAGAACATGTTTATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TCGAGAGCCTTCACCGAGGACCGCCCGGGGCTGAGCCTCACAGTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106268 TCGAGAGCCTTCACCGAGGACCGCCCGGGGCTGAGCCTCACAGTACCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CCCAAGGAGCCCTGCCAAGACCTCACCTTCACCAACCTGGATGCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106318 CCCAAGGAGCCCTGCCAAGACCTCACCTTCACCAACCTGGATGCCCTCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CACGTTGTCCGCCTGCCCACCCAACCCCGGGCTGGTTAGCCCCAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106368 CACGTTGTCCGCCTGCCCACCCAACCCCGGGCTGGTTAGCCCCAGCCCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CAGACCAGCGGGAAGCAGTGGCCATCGTCTCAACCCCCAGAAGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106418 CAGACCAGCGGGAAGCAGTGGCCATCGTCTCAACCCCCAGAAGCCAGTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 AGACGCCAGTGCCTAAAAGACATTTCTCTGTTTCTCCTACTCTGCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106468 AGACGCCAGTGCCTAAAAGACATTTCTCTGTTTCTCCTACTCTGCAATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CATT         CTGTGGATCATGCCTGCCTTCGGGGCCCGCCCTCATT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106518 CATTGTG...CAGCTGTGGATCATGCCTGCCTTCGGGGCCCGCCCTCATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TCAGCAACACAGTGGAGGTGGATTTCTACGGCTACTCCCTCTGGGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108780 TCAGCAACACAGTGGAGGTGGATTTCTACGGCTACTCCCTCTGGGCGGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ATCGTCAACATCTGCCTCCCTTTCGGCATCTTCTACCGCATGCACGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108830 ATCGTCAACATCTGCCTCCCTTTCGGCATCTTCTACCGCATGCACGCTGT

   1700     .    :    .    :    .    :
   1656 GTCCAGCCTGCTGGAGGTCTACGTGCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 108880 GTCCAGCCTGCTGGAGGTCTACGTGCTGTCC