seq1 = pF1KE0364.tfa, 2070 bp
seq2 = pF1KE0364/gi568815579r_58398518.tfa (gi568815579r:58398518_58611902), 213385 bp

>pF1KE0364 2070
>gi568815579r:58398518_58611902 (Chr19)

(complement)

1-688  (99948-100635)   100% ->
689-898  (100973-101182)   100% ->
899-1057  (101898-102056)   100% ->
1058-1182  (110493-110617)   100% ->
1183-1377  (111197-111391)   100% ->
1378-1468  (111474-111564)   100% ->
1469-1667  (112213-112411)   100% ->
1668-1765  (112683-112780)   100% ->
1766-1896  (112988-113118)   100% ->
1897-2070  (113212-113385)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGTCAGGCAACAGTTGGCCTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99948 ATGGGTGTCAGGCAACAGTTGGCCTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGGCCTGGGGCAGCCAGTGTGGCCAGTCGCTGTGGCCTTGACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 CTGGGGCCTGGGGCAGCCAGTGTGGCCAGTCGCTGTGGCCTTGACCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGGCTCCTGGGGGATCCCACATGTTGCGTGCTACTTGGGCTGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 GCTGGCTCCTGGGGGATCCCACATGTTGCGTGCTACTTGGGCTGGCCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTAGCACGGCCCTGGCTCGGCCCCTGGGTGCCCCATGGGCTGAGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 TTAGCACGGCCCTGGCTCGGCCCCTGGGTGCCCCATGGGCTGAGCCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTGCGGCCCTGGCACTAACCCTCCTGCCAGCACGGCTGCCCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100148 AGCTGCGGCCCTGGCACTAACCCTCCTGCCAGCACGGCTGCCCCCAGGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACGCTGGCTGCCGGCTGATGTGATCTTCTTGGCCAAGATCCTCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100198 TACGCTGGCTGCCGGCTGATGTGATCTTCTTGGCCAAGATCCTCCACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCTGAAGATCAGGGGATGCTTGAGCCGGCAGCCGCCTGACACCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100248 GGCCTGAAGATCAGGGGATGCTTGAGCCGGCAGCCGCCTGACACCTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGATGCCTTCGAGCGGCGAGCACGAGCGCAGCCTGGCAGGGCACTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 AGATGCCTTCGAGCGGCGAGCACGAGCGCAGCCTGGCAGGGCACTCTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTGGACGGGGCCTGGGGCCGGCTCAGTCACCTTTGGTGAGCTGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 TGTGGACGGGGCCTGGGGCCGGCTCAGTCACCTTTGGTGAGCTGGATGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGGCCTGCCAGGCGGCATGGGCCCTGAAGGCTGAGCTGGGTGACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 CGGGCCTGCCAGGCGGCATGGGCCCTGAAGGCTGAGCTGGGTGACCCTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGCCTGTGTGCCGGGGAGCCTACTGCCCTCCTTGTGCTGGCTTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100448 GAGCCTGTGTGCCGGGGAGCCTACTGCCCTCCTTGTGCTGGCTTCCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGTTCCAGCCCTGTGTATGTGGCTGGGGCTGGCCAAGCTGGGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 CCGTTCCAGCCCTGTGTATGTGGCTGGGGCTGGCCAAGCTGGGCTGCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGCCTGGATCAACCCGCATGGCCGGGGGATGCCCCTGGCGCACTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 ACAGCCTGGATCAACCCGCATGGCCGGGGGATGCCCCTGGCGCACTCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGAGCTCTGGGGCCCGGGTGCTGGTGGTGGACCCAG         ACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100598 GCTGAGCTCTGGGGCCCGGGTGCTGGTGGTGGACCCAGGTG...CAGACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCGGGAGAGCCTGGAGGAGATCCTTCCCAAGCTGCAGGCTGAGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100976 TCCGGGAGAGCCTGGAGGAGATCCTTCCCAAGCTGCAGGCTGAGAACATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGCTGCTTCTACCTCAGCCATACCTCCCCTACACCAGGGGTGGGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101026 CGCTGCTTCTACCTCAGCCATACCTCCCCTACACCAGGGGTGGGGGCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGGGGCTGCCCTGGATGCAGCGCCCTCCCACCCAGTGCCTGCTGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 GGGGGCTGCCCTGGATGCAGCGCCCTCCCACCCAGTGCCTGCTGACCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GTGCTGGGATCACATGGAGAAGCCCTGCCCTCTTCATCTATACCTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101126 GTGCTGGGATCACATGGAGAAGCCCTGCCCTCTTCATCTATACCTCGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACCACTG         GCCTCCCGAAGCCAGCCATCCTCACGCATGAGCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101176 ACCACTGGTG...AAGGCCTCCCGAAGCCAGCCATCCTCACGCATGAGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGTACTGCAGATGAGCAAGATGCTGTCCTTATCTGGGGCCACAGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101932 GGTACTGCAGATGAGCAAGATGCTGTCCTTATCTGGGGCCACAGCTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATGTGGTTTACACGGTCCTGCCTCTGTACCACGTGATGGGACTTGTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101982 ATGTGGTTTACACGGTCCTGCCTCTGTACCACGTGATGGGACTTGTCGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GGGATCCTCGGCTGCTTAGATCTCG         GAGCCACCTGTGTTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102032 GGGATCCTCGGCTGCTTAGATCTCGGTA...CAGGAGCCACCTGTGTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGCCCCCAAGTTCTCTACTTCCTGCTTCTGGGATGACTGTCGGCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110509 GGCCCCCAAGTTCTCTACTTCCTGCTTCTGGGATGACTGTCGGCAGCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCGTGACAGTGATCCTGTATGTGGGCGAGCTCCTGCGGTACTTGTGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110559 GCGTGACAGTGATCCTGTATGTGGGCGAGCTCCTGCGGTACTTGTGTAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ATTCCCCAG         CAACCAGAGGACCGGACACATACAGTCCGCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110609 ATTCCCCAGGTG...TAGCAACCAGAGGACCGGACACATACAGTCCGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGCAATGGGCAATGGACTACGGGCTGATGTGTGGGAGACCTTCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111229 GGCAATGGGCAATGGACTACGGGCTGATGTGTGGGAGACCTTCCAGCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GCTTCGGTCCTATTCGGATCTGGGAAGTCTACGGCTCCACAGAAGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111279 GCTTCGGTCCTATTCGGATCTGGGAAGTCTACGGCTCCACAGAAGGCAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ATGGGCTTAGTCAACTATGTGGGGCGCTGCGGGGCCCTGGGCAAGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111329 ATGGGCTTAGTCAACTATGTGGGGCGCTGCGGGGCCCTGGGCAAGATGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTGCCTCCTCCGA         ATGCTGTCCCCCTTTGAGCTGGTGCAGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111379 CTGCCTCCTCCGAGTG...CAGATGCTGTCCCCCTTTGAGCTGGTGCAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCGACATGGAGGCGGCGGAGCCTGTGAGGGACAATCAGGGCTTCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111502 TCGACATGGAGGCGGCGGAGCCTGTGAGGGACAATCAGGGCTTCTGCATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCTGTAGGGCTAG         GGGAGCCGGGGCTGCTGCTGACCAAGGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111552 CCTGTAGGGCTAGGTA...CAGGGGAGCCGGGGCTGCTGCTGACCAAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GGTAAGCCAGCAACCCTTCGTGGGCTACCGCGGCCCCCGAGAGCTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112241 GGTAAGCCAGCAACCCTTCGTGGGCTACCGCGGCCCCCGAGAGCTGTCGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 AACGGAAGCTGGTGCGCAACGTGCGGCAATCGGGCGACGTTTACTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112291 AACGGAAGCTGGTGCGCAACGTGCGGCAATCGGGCGACGTTTACTACAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 ACCGGGGACGTACTGGCCATGGACCGCGAAGGCTTCCTCTACTTCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112341 ACCGGGGACGTACTGGCCATGGACCGCGAAGGCTTCCTCTACTTCCGCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CCGCCTCGGGGACACCTTCCG         ATGGAAGGGCGAGAACGTGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 112391 CCGCCTCGGGGACACCTTCCGGTC...CAGATGGAAGGGCGAGAACGTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CCACGCACGAGGTGGAGGGCGTGTTGTCGCAGGTGGACTTCTTGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112703 CCACGCACGAGGTGGAGGGCGTGTTGTCGCAGGTGGACTTCTTGCAACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GTTAACGTGTATGGCGTGTGCGTGCCAG         GTTGTGAGGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112753 GTTAACGTGTATGGCGTGTGCGTGCCAGGTG...TAGGTTGTGAGGGTAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GGTGGGCATGGCTGCTGTGCAGCTAGCCCCCGGCCAGACTTTCGACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113001 GGTGGGCATGGCTGCTGTGCAGCTAGCCCCCGGCCAGACTTTCGACGGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AGAAGTTGTACCAGCACGTTCGCGCTTGGCTCCCTGCCTACGCTACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113051 AGAAGTTGTACCAGCACGTTCGCGCTTGGCTCCCTGCCTACGCTACCCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CATTTCATCCGCATCCAG         GACGCCATGGAGGTCACCAGCAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113101 CATTTCATCCGCATCCAGGTG...CAGGACGCCATGGAGGTCACCAGCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GTTCAAACTGATGAAGACCCGGTTGGTGCGTGAGGGCTTCAATGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113235 GTTCAAACTGATGAAGACCCGGTTGGTGCGTGAGGGCTTCAATGTGGGGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TCGTGGTTGACCCTCTGTTTGTACTGGACAACCGGGCCCAGTCCTTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113285 TCGTGGTTGACCCTCTGTTTGTACTGGACAACCGGGCCCAGTCCTTCCGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 CCCCTGACGGCAGAAATGTACCAGGCTGTGTGTGAGGGAACCTGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113335 CCCCTGACGGCAGAAATGTACCAGGCTGTGTGTGAGGGAACCTGGAGGCT

   2150 
   2070 C
        |
 113385 C