seq1 = pF1KE0360.tfa, 1977 bp
seq2 = pF1KE0360/gi568815576r_32118517.tfa (gi568815576r:32118517_32355329), 236813 bp

>pF1KE0360 1977
>gi568815576r:32118517_32355329 (Chr22)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-207  (101117-101188)   100% ->
208-312  (103456-103560)   100% ->
313-372  (106528-106587)   100% ->
373-477  (107815-107919)   100% ->
478-583  (116240-116345)   100% ->
584-664  (118006-118086)   100% ->
665-885  (120237-120457)   99% ->
886-1021  (122296-122431)   100% ->
1022-1129  (124255-124362)   100% ->
1130-1280  (125986-126136)   100% ->
1281-1449  (129507-129675)   100% ->
1450-1665  (130848-131063)   100% ->
1666-1768  (134308-134410)   100% ->
1769-1977  (136605-136813)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTACGGTTAGCCCCAGCACCATAGCTGAGACCCCAGAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTACGGTTAGCCCCAGCACCATAGCTGAGACCCCAGAGCCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCATTGTCTGACCACATCCGAAATGCTGCTGACATCTCAGTCATTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCATTGTCTGACCACATCCGAAATGCTGCTGACATCTCAGTCATTGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATTTTCTGGTGGTGATGGCTGTTGGGCTGTGG         GCGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 TCTATTTTCTGGTGGTGATGGCTGTTGGGCTGTGGGTA...CAGGCGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGAAGACCAACCGAGGTACTATAGGAGGCTTCTTCCTCGCTGGTCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101123 CTGAAGACCAACCGAGGTACTATAGGAGGCTTCTTCCTCGCTGGTCGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGGCCTGGTGGCCG         ATGGGCGCCTCTCTCTTTGCCAGTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101173 TATGGCCTGGTGGCCGGTA...CAGATGGGCGCCTCTCTCTTTGCCAGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACATCGGCAGCAACCACTATGTGGGGCTGGCTGGGACAGGAGCAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103481 ACATCGGCAGCAACCACTATGTGGGGCTGGCTGGGACAGGAGCAGCTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAGTCGCCACCGTAACATTTGAATGGACT         TCCTCAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103531 GGAGTCGCCACCGTAACATTTGAATGGACTGTA...TAGTCCTCAGTAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTGCTGATTCTTGGGTGGATCTTTGTCCCTATCTACATCAAGTCGGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106539 GTTGCTGATTCTTGGGTGGATCTTTGTCCCTATCTACATCAAGTCGGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373         GTGATGACCATGCCGGAATATCTCAAGAAGCGGTTTGGTGGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106589 TG...CAGGTGATGACCATGCCGGAATATCTCAAGAAGCGGTTTGGTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGCGACTCCAGGTCTACCTCTCCATCCTCTCCCTCTTCATCTGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107857 GAGCGACTCCAGGTCTACCTCTCCATCCTCTCCCTCTTCATCTGTGTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTGTTAATTTCT         GCAGACATATTTGCTGGAGCCATATTCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107907 TTTGTTAATTTCTGTG...TAGGCAGACATATTTGCTGGAGCCATATTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCAAGCTGGCCTTGGGATTGGACCTTTACCTGGCAATCTTCATCCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116268 TCAAGCTGGCCTTGGGATTGGACCTTTACCTGGCAATCTTCATCCTCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTATGACTGCTGTTTACACCACCACTG         GGGGCTTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 116318 GCTATGACTGCTGTTTACACCACCACTGGTA...TAGGGGGCTTGGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGTGATTTACACAGACACCCTCCAGACCATCATCATGCTGATTGGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118019 GGTGATTTACACAGACACCCTCCAGACCATCATCATGCTGATTGGCTCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTATTCTCATGGGGTTTG         CATTTAACGAAGTTGGAGGTTAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 118069 TTATTCTCATGGGGTTTGGTA...TAGCATTTAACGAAGTTGGAGGTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAGAGCTTTACCGAGAAGTACGTGAATGCCACCCCATCCGTAGTCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120260 GAGAGCTTTACCGAGAAGTACGTGAATGCCACCCCATCCGTAGTCGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGACAACTTGACAATCAGTGCCAGTTGCTACACACCTCGGGCGGACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120310 GGACAACTTGACAATCAGTGCCAGTTGCTACACACCTCGGGCGGACTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCCATATCTTCCGAGATGCTGTGACTGGGGACATTCCATGGCCAGGAATT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120360 TCCACATCTTCCGAGATGCTGTGACTGGGGACATTCCATGGCCAGGAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATATTTGGAATGCCCATTACAGCTTTGTGGTACTGGTGCACAAATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 120410 ATATTTGGAATGCCCATTACAGCTTTGTGGTACTGGTGCACAAATCAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    886        GTCATTGTGCAGCGCTGCCTGTGTGGCAAGGACATGTCTCACG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120460 G...CAGGTCATTGTGCAGCGCTGCCTGTGTGGCAAGGACATGTCTCACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGAAGGCCGCTTGCATTATGTGTGCTTACCTGAAGCTGCTGCCCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122339 TGAAGGCCGCTTGCATTATGTGTGCTTACCTGAAGCTGCTGCCCATGTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCATGGTGATGCCGGGGATGATCAGCCGCATCCTGTACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 122389 CTCATGGTGATGCCGGGGATGATCAGCCGCATCCTGTACACAGGTA...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1022   ATATGGTAGCATGTGTGGTACCTTCTGAATGCGTGAAACACTGTGGCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124253 AGATATGGTAGCATGTGTGGTACCTTCTGAATGCGTGAAACACTGTGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTGATGTTGGCTGCACCAACTACGCATACCCCACGATGGTGCTGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124303 TTGATGTTGGCTGCACCAACTACGCATACCCCACGATGGTGCTGGAACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATGCCCCAAG         GACTGCGAGGCCTGATGCTTTCGGTCATGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 124353 ATGCCCCAAGGTA...CAGGACTGCGAGGCCTGATGCTTTCGGTCATGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGCCTCTCTCATGAGCTCCCTGACCTCCATCTTCAACAGCGCCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126017 GGCCTCTCTCATGAGCTCCCTGACCTCCATCTTCAACAGCGCCAGCACCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCTTCACCATTGACCTCTACACCAAGATGCGGAAGCAAGCGTCGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126067 TCTTCACCATTGACCTCTACACCAAGATGCGGAAGCAAGCGTCGGAGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAGCTCCTGATAGCTGGACG         GATATTTGTTCTTCTATTAAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 126117 GAGCTCCTGATAGCTGGACGGTG...CAGGATATTTGTTCTTCTATTAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGTTGTGAGCATTGTGTGGGTCCCACTGGTACAAGTTTCTCAAAATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129528 TGTTGTGAGCATTGTGTGGGTCCCACTGGTACAAGTTTCTCAAAATGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AACTAATCCATTACACAGAATCAATTTCTAGCTACCTTGGGCCTCCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129578 AACTAATCCATTACACAGAATCAATTTCTAGCTACCTTGGGCCTCCAATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCAGCTGTCTTTGTGCTTGCCATCTTCTGTAAAAGAGTCAATGAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129628 GCAGCTGTCTTTGTGCTTGCCATCTTCTGTAAAAGAGTCAATGAACAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1450        GGAGCATTCTGGGGTCTAATGGTTGGACTTGCAATGGGCCTCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129678 G...CAGGGAGCATTCTGGGGTCTAATGGTTGGACTTGCAATGGGCCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TTCGTATGATAACAGAGTTTGCTTATGGAACAGGGAGTTGCTTGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130891 TTCGTATGATAACAGAGTTTGCTTATGGAACAGGGAGTTGCTTGGCTCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AGTAACTGTCCCAAGATTATCTGTGGAGTGCACTATCTGTACTTTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130941 AGTAACTGTCCCAAGATTATCTGTGGAGTGCACTATCTGTACTTTTCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CGTTCTCTTTTTTGGGTCCATGCTGGTCACCCTGGGAATTTCCCTCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130991 CGTTCTCTTTTTTGGGTCCATGCTGGTCACCCTGGGAATTTCCCTCTTAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CAAAACCCATTCCTGATGTACAT         CTGTACCGCCTGTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131041 CAAAACCCATTCCTGATGTACATGTG...CAGCTGTACCGCCTGTGCTGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GTTCTTCGGAACAGTACAGAGGAGCGAATCGATATAGATGCAGAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134326 GTTCTTCGGAACAGTACAGAGGAGCGAATCGATATAGATGCAGAAGAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AAGTCAGGAAGAAACAGATGATGGTGTTGAAGAAG         ATTATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 134376 AAGTCAGGAAGAAACAGATGATGGTGTTGAAGAAGGTA...CAGATTATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CTGAGAAATCACGTGGATGCCTCAAGAAAGCTTATGACTTGTTCTGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136611 CTGAGAAATCACGTGGATGCCTCAAGAAAGCTTATGACTTGTTCTGCGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TTGCAGAAGGGACCCAAGCTAACCAAGGAGGAGGAGGAAGCCTTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136661 TTGCAGAAGGGACCCAAGCTAACCAAGGAGGAGGAGGAAGCCTTGAGCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GAAGCTCACAGACACGTCTGAGAGGCCCTCGTGGAGGACAATAGTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136711 GAAGCTCACAGACACGTCTGAGAGGCCCTCGTGGAGGACAATAGTGAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TCAACGCCATCCTCCTCCTGGCTGTGGTGGTCTTTATTCACGGCTACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136761 TCAACGCCATCCTCCTCCTGGCTGTGGTGGTCTTTATTCACGGCTACTAT

   2100 
   1975 GCC
        |||
 136811 GCC