seq1 = pF1KE0357.tfa, 1803 bp
seq2 = pF1KE0357/gi568815590f_27675515.tfa (gi568815590f:27675515_27903435), 227921 bp

>pF1KE0357 1803
>gi568815590f:27675515_27903435 (Chr8)

1-53  (100001-100053)   100% ->
54-861  (100848-101655)   100% ->
862-955  (104660-104753)   100% ->
956-1013  (108486-108543)   100% ->
1014-1131  (112371-112488)   100% ->
1132-1263  (113333-113464)   100% ->
1264-1353  (116449-116538)   100% ->
1354-1497  (117154-117297)   100% ->
1498-1673  (124027-124202)   100% ->
1674-1803  (127792-127921)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCTCTTACTCCAAGGAAGAGGAAGCAGGATTCTTTGAAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCTCTTACTCCAAGGAAGAGGAAGCAGGATTCTTTGAAGTGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAG         CCTTTTACACTTCACTGAAAATCTGTTTCCATCACCTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGTG...TAGCCTTTTACACTTCACTGAAAATCTGTTTCCATCACCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATAAAAAGCACTGTTTTTATCAAAACAGTGATAAAAATGAAGAAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100886 ATAAAAAGCACTGTTTTTATCAAAACAGTGATAAAAATGAAGAAAACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATTGCTCTCAACAAGAGCATTTTGTTTTAAGTGCGCTCAAAACAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100936 CATTGCTCTCAACAAGAGCATTTTGTTTTAAGTGCGCTCAAAACAACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATAAATAGACTGCCATCAGCAAATCAAGGCTCACCATTTAAATCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100986 AATAAATAGACTGCCATCAGCAAATCAAGGCTCACCATTTAAATCTGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCCACTGTATCTTTTTACAACCAAAATAAGTGGTACCTCAATCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 TCTCCACTGTATCTTTTTACAACCAAAATAAGTGGTACCTCAATCCACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAGAAAGCTGATAAAAGAGAGTAGATCTACTTGTCTAAAAACTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101086 GAGAGAAAGCTGATAAAAGAGAGTAGATCTACTTGTCTAAAAACTAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAAGATAAATCTTTTCCCATTGTGACAGAAAAAATGCAAGGAAAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101136 TGAAGATAAATCTTTTCCCATTGTGACAGAAAAAATGCAAGGAAAACCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTGCTCCAAGAAGAACAACAAAAAACCACAGAAGAGTTTAACTGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 TCTGCTCCAAGAAGAACAACAAAAAACCACAGAAGAGTTTAACTGCTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TATCAACCAAAGTATAGACACATCAAGCCTGTATCAAGGAATTCTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101236 TATCAACCAAAGTATAGACACATCAAGCCTGTATCAAGGAATTCTAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCCAAGCAAAATCGAGTGATCTATAAGCCAATTGTGGAGAAGGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 TTCCAAGCAAAATCGAGTGATCTATAAGCCAATTGTGGAGAAGGAAAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATTGTCATTCAGCTGAAAATAATTCCAATGCTCCTCGGGTTCTGAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 ATTGTCATTCAGCTGAAAATAATTCCAATGCTCCTCGGGTTCTGAGCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAATAAAACCACAAGTTACACTCCAGGGTGGAGCAGCATTTTTTGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 AAAATAAAACCACAAGTTACACTCCAGGGTGGAGCAGCATTTTTTGTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AAAAAAATCTTCTCTTAGAAAATCGTCCCTGGAAAATGAGCCGTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 AAAAAAATCTTCTCTTAGAAAATCGTCCCTGGAAAATGAGCCGTCACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GACGCACCCAAAAGAGTAAATCAGAAGTCATTGAAGATTCTGATGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101486 GACGCACCCAAAAGAGTAAATCAGAAGTCATTGAAGATTCTGATGTAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACTGTCAGTGAAAAAAAAACTTTTGCGACAAGGCAAGTGCCAAAGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 ACTGTCAGTGAAAAAAAAACTTTTGCGACAAGGCAAGTGCCAAAGTGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGTCCTAGAAGAGAAATTGAAAATTGGACTACTGAGTGCAAGCAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101586 GGTCCTAGAAGAGAAATTGAAAATTGGACTACTGAGTGCAAGCAGTAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATAAAGAGAAATTAATAAAG         GATTCATCAGATGACAGAGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101636 ATAAAGAGAAATTAATAAAGGTA...CAGGATTCATCAGATGACAGAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCTTCAAAGGAACATAAAGTTGATAAAAATGAGGCTTTTTCTTCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104681 TCTTCAAAGGAACATAAAGTTGATAAAAATGAGGCTTTTTCTTCAGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TTCTCTTGGTGAGAATAAGACAA         TTTCTCCTAAGTCCACTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104731 TTCTCTTGGTGAGAATAAGACAAGTA...CAGTTTCTCCTAAGTCCACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TCTATCCAATCTTCAGTGCATCTTCAGTCAATTCAAAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108504 TCTATCCAATCTTCAGTGCATCTTCAGTCAATTCAAAAAGGTG...AAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCTTTAGGTGAAGAACAGTTTTCTGTGGGATCTGTCAACTTCATGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112372 TCTTTAGGTGAAGAACAGTTTTCTGTGGGATCTGTCAACTTCATGAAACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GACCAATATCCAGAAAAATACTAATACCAGAGATACAAGTAAAAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112422 GACCAATATCCAGAAAAATACTAATACCAGAGATACAAGTAAAAAAACAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AAGACCAGCTCATCATC         GACGCTGGTCAGAAACATTTTGGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112472 AAGACCAGCTCATCATCGTG...TAGGACGCTGGTCAGAAACATTTTGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCTACTGTGTGCAAGTCTTGTGGTATGATATATACTGCTTCCAACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113357 GCTACTGTGTGCAAGTCTTGTGGTATGATATATACTGCTTCCAACCCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AGATGAAATGCAGCATGTACAGCATCACCACAGGTTTCTGGAAGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113407 AGATGAAATGCAGCATGTACAGCATCACCACAGGTTTCTGGAAGGAATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AATATGTG         GGTTGGAAGAAAGAACGTGTAGTAGCAGAGTTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 113457 AATATGTGGTG...CAGGGTTGGAAGAAAGAACGTGTAGTAGCAGAGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TGGGATGGGAAAATCGTGTTGGTTCTGCCACATGATCCAAGCTTTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116482 TGGGATGGGAAAATCGTGTTGGTTCTGCCACATGATCCAAGCTTTGCTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CAAAAAG         GTAGAAGATGTCCAAGAACTTGTTGATAATGAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116532 CAAAAAGGTA...TAGGTAGAAGATGTCCAAGAACTTGTTGATAATGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGGGCTTCCAGCAAGTTGTTCCTAAATGTCCAAACAAAATAAAAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117188 TGGGCTTCCAGCAAGTTGTTCCTAAATGTCCAAACAAAATAAAAACTTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CTTTTTATATCTGATGAAAAGAGAGTAGTTGGGTGTTTAATTGCAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117238 CTTTTTATATCTGATGAAAAGAGAGTAGTTGGGTGTTTAATTGCAGAACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CATCAAACAG         GCATTTCGTGTCCTGTCTGAACCAATTGGTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 117288 CATCAAACAGGTA...CAGGCATTTCGTGTCCTGTCTGAACCAATTGGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CAGAATCCCCAAGCTCTACGGAATGTCCTAGGGCTTGGCAATGTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124058 CAGAATCCCCAAGCTCTACGGAATGTCCTAGGGCTTGGCAATGTTCAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GTACCAGAACCTGCAGTCTGTGGGATAAGTAGAATCTGGGTTTTCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124108 GTACCAGAACCTGCAGTCTGTGGGATAAGTAGAATCTGGGTTTTCAGACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GAAGAGAAGAAAGCGCATTGCAAGACGACTGGTTGATACCCTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 124158 GAAGAGAAGAAAGCGCATTGCAAGACGACTGGTTGATACCCTCAGGTA..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674     GAATTGCTTCATGTTTGGCTGTTTTCTCAGCACTGATGAAATAGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124208 .TAGGAATTGCTTCATGTTTGGCTGTTTTCTCAGCACTGATGAAATAGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TTTTCTGACCCAACACCAGATGGCAAGTTATTTGCAACCAAGTACTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127838 TTTTCTGACCCAACACCAGATGGCAAGTTATTTGCAACCAAGTACTGCAA

   1850     .    :    .    :    .    :
   1770 CACCCCTAATTTCCTCGTATATAATTTTAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127888 CACCCCTAATTTCCTCGTATATAATTTTAATAGT