seq1 = pF1KE0354.tfa, 2157 bp
seq2 = pF1KE0354/gi568815579r_38630965.tfa (gi568815579r:38630965_38844165), 213201 bp

>pF1KE0354 2157
>gi568815579r:38630965_38844165 (Chr19)

(complement)

1-237  (100001-100237)   100% ->
238-307  (101064-101133)   100% ->
308-426  (101638-101756)   99% ->
427-560  (102256-102389)   100% ->
561-729  (103947-104115)   100% ->
730-804  (105518-105592)   100% ->
805-890  (105663-105748)   100% ->
891-965  (105819-105893)   100% ->
966-1129  (106528-106691)   100% ->
1130-1374  (106778-107015)   96% ->
1375-1583  (107848-108056)   100% ->
1584-1626  (108622-108664)   100% ->
1627-1686  (108737-108796)   100% ->
1687-1744  (109296-109353)   100% ->
1745-1815  (109777-109847)   100% ->
1816-1878  (109962-110024)   100% ->
1879-1957  (110385-110463)   100% ->
1958-2074  (112943-113059)   100% ->
2075-2133  (113143-113201)   100% ->
2134-2157  (113288-113311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCCAGCAGTGGGAGGGTCACCATCCAGCTCGTGGATGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCCAGCAGTGGGAGGGTCACCATCCAGCTCGTGGATGAGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGTCGGAGCCGGGCGCCTGCAGCTTTTTCGGGGCCAGAGCTATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGGTCGGAGCCGGGCGCCTGCAGCTTTTTCGGGGCCAGAGCTATGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAATTCGGGCAGCCTGCCTGGATTCGGGGATCCTGTTCCGCGACCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAATTCGGGCAGCCTGCCTGGATTCGGGGATCCTGTTCCGCGACCCTTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCCTGCTGGCCCTGATGCCCTTGGCTATGACCAGCTGGGGCCGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCCTGCTGGCCCTGATGCCCTTGGCTATGACCAGCTGGGGCCGGACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGAAGGCCAAAGGCGTGAAATGGATGAGGCCCCAT         GAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100201 GGAGAAGGCCAAAGGCGTGAAATGGATGAGGCCCCATGTA...CAGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTGTGCTGAGCCGAAGTTCATCTGTGAAGACATGAGCCGCACAGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101068 TCTGTGCTGAGCCGAAGTTCATCTGTGAAGACATGAGCCGCACAGACGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGTCAGGGGAGCCTGG         GTAACTGCTGGTTCCTTGCAGCCGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| ||
 101118 TGTCAGGGGAGCCTGGGTG...CAGGTAACTGCTGGTTCCTTGCAGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCCTCCCTTACTCTGTATCCCCGGCTCCTGCGCCGGGTGGTCCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101663 CGCCTCCCTTACTCTGTATCCCCGGCTCCTGCGCCGGGTGGTCCCTCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GACAGGATTTCCAGCATGGCTACGCAGGCGTCTTCCACTTCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101713 GACAGGATTTCCAGCATGGCTACGCAGGCGTCTTCCACTTCCAGGTA...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    427    CTCTGGCAGTTTGGCCGCTGGATGGACGTCGTGGTGGATGACAGGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102253 CAGCTCTGGCAGTTTGGCCGCTGGATGGACGTCGTGGTGGATGACAGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCCGTGCGTGAGGGGAAGCTGATGTTCGTGCGCTCGGAACAGCGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102303 GCCCGTGCGTGAGGGGAAGCTGATGTTCGTGCGCTCGGAACAGCGGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTTCTGGGCCCCACTCCTGGAGAAGGCCTACGCCAA         GCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102353 AGTTCTGGGCCCCACTCCTGGAGAAGGCCTACGCCAAGTG...CAGGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACGGCTCCTATGAGGTGATGCGGGGCGGCCACATGAATGAGGCTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103951 CACGGCTCCTATGAGGTGATGCGGGGCGGCCACATGAATGAGGCTTTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGATTTCACAGGCGGCGTGGGCGAGGTGCTCTATCTGAGACAAAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104001 GGATTTCACAGGCGGCGTGGGCGAGGTGCTCTATCTGAGACAAAACAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGGGCTGTTCTCTGCCCTGCGCCATGCCCTGGCCAAGGAGTCCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104051 TGGGGCTGTTCTCTGCCCTGCGCCATGCCCTGGCCAAGGAGTCCCTCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCGCCACTGCCCTG         AGTGATCGGGGTGAGTACCGCACAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104101 GGCGCCACTGCCCTGGTA...CAGAGTGATCGGGGTGAGTACCGCACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAGGGCCTGGTAAAGGGACACGCGTATTCCATCACGGGCACACACAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105544 AGAGGGCCTGGTAAAGGGACACGCGTATTCCATCACGGGCACACACAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    805         GTGTTCCTGGGCTTCACCAAGGTGCGGCTGCTGCGGCTGCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105594 TA...CAGGTGTTCCTGGGCTTCACCAAGGTGCGGCTGCTGCGGCTGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACCCATGGGGCTGCGTGGAGTGGACGGGGGCCTGGAGCGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105705 AACCCATGGGGCTGCGTGGAGTGGACGGGGGCCTGGAGCGACAGGTG...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    891    CTGCCCACGCTGGGACACACTCCCCACCGAGTGCCGCGATGCCCTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105816 CAGCTGCCCACGCTGGGACACACTCCCCACCGAGTGCCGCGATGCCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGTGAAAAAGGAGGATGGCGAGTTCTG         GATGGAGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105866 TGGTGAAAAAGGAGGATGGCGAGTTCTGGTC...CAGGATGGAGCTGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GACTTCCTCCTCCATTTCGACACCGTGCAGATCTGCTCGCTGAGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106541 GACTTCCTCCTCCATTTCGACACCGTGCAGATCTGCTCGCTGAGCCCGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGTGCTGGGCCCCAGCCCGGAGGGGGGCGGCTGGCACGTCCACACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106591 GGTGCTGGGCCCCAGCCCGGAGGGGGGCGGCTGGCACGTCCACACCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAGGCCGCTGGGTGCGTGGCTTCAACTCCGGCGGGAGCCAGCCTAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106641 AAGGCCGCTGGGTGCGTGGCTTCAACTCCGGCGGGAGCCAGCCTAATGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 G         AAACCTTCTGGACCAATCCTCAGTTCCGTTTAACGCTGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106691 GGTG...TAGAAACCTTCTGGACCAATCCTCAGTTCCGTTTAACGCTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGAGCCTGATGAGGAGGATGACGAGGATGAGGAAGGGCCCTGGGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106818 GGAGCCTGATGAGGAGGATGACGAGGATGAGGAAGGGCCCTGGGGGGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GGGGGGCTGCAGGGGCACGGGGCCCAGCGCGGGGGGGCCGCACGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106868 GGGGGGCTGCAGGGGCACGGGGCCCAGCGCGGGGGGGCCGCACGCCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGCACGGTCCTTCTGTCCCTCATCCAGCGCAACCGGCGGCGCCTGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106918 TGCACGGTCCTTCTGTCCCTCATCCAGCGCAACCGGCGGCGCCTGAGAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CAAGGGCCTCACTTACCTCACCGTTGGCTTCCACGTGTTCCAGATTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |----|
 106968 CAAGGGCCTCACTTACCTCACCGTTGGCTTCCACGTGTTCCAGGT    G

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGAG         CTGCTGGGCCTCTGGGATTCCCCGCGCAGCCATGCG
        ||--->>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107014 AG   GTC...CAGCTGCTGGGCCTCTGGGATTCCCCGCGCAGCCATGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTCCTGCCCCGGCTGCTGCGCGCCGACCGCTCGCCCCTCAGCGCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107884 CTCCTGCCCCGGCTGCTGCGCGCCGACCGCTCGCCCCTCAGCGCCCGCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CGACGTGACCCGCCGCTGCTGCCTGCGTCCAGGCCACTACCTGGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107934 CGACGTGACCCGCCGCTGCTGCCTGCGTCCAGGCCACTACCTGGTGGTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CGAGCACCGCCCACGCCGGCGACGAGGCTGACTTCACTCTGCGTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107984 CGAGCACCGCCCACGCCGGCGACGAGGCTGACTTCACTCTGCGTGTCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TCCGAGCGCCGCCACACGGCCGT         GGAGATCGACGACGTGAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108034 TCCGAGCGCCGCCACACGGCCGTGTG...CAGGGAGATCGACGACGTGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CAGCGCAGACCTGCAGTCTCTCCAG         GGCCCCTACCTGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 108640 CAGCGCAGACCTGCAGTCTCTCCAGGTG...CAGGGCCCCTACCTGCCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGGAGCTGGGGTTGGAGCAGCTGTTTCAGGAGCTGGCTGGAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 108753 TGGAGCTGGGGTTGGAGCAGCTGTTTCAGGAGCTGGCTGGAGAGGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1687    GAGGAAGAACTCAATGCCTCTCAGCTCCAGGCCTTACTAAGCATTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109293 TAGGAGGAAGAACTCAATGCCTCTCAGCTCCAGGCCTTACTAAGCATTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCTGGAGCCTG         CCAGGGCCCATACCTCCACCCCCAGAGAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109343 CCTGGAGCCTGGTG...TAGCCAGGGCCCATACCTCCACCCCCAGAGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCGGGCTCAGGACCTGTGAGCAGCTGCTGCAGTGTTTCGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109807 TCGGGCTCAGGACCTGTGAGCAGCTGCTGCAGTGTTTCGGGGTA...CAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CATGGGCAAAGCCTGGCCTTACACCACTTCCAGCAGCTCTGGGGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109962 CATGGGCAAAGCCTGGCCTTACACCACTTCCAGCAGCTCTGGGGCTACCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CCTGGAGTGGCAG         GCCATATTTAACAAGTTCGATGAGGACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110012 CCTGGAGTGGCAGGTG...CAGGCCATATTTAACAAGTTCGATGAGGACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CCTCTGGAACCATGAACTCCTACGAGCTGAGGCTGGCACTGAATGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110413 CCTCTGGAACCATGAACTCCTACGAGCTGAGGCTGGCACTGAATGCAGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 G         GCTTCCACCTGAACAACCAGCTGACCCAGACCCTCACCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110463 GGTG...TAGGCTTCCACCTGAACAACCAGCTGACCCAGACCCTCACCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CCGCTACCGGGATAGCCGTCTGCGTGTGGACTTCGAGCGGTTCGTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112983 CCGCTACCGGGATAGCCGTCTGCGTGTGGACTTCGAGCGGTTCGTGTCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GTGTGGCCCACCTCACCTGCATCTTCT         GCCACTGCAGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 113033 GTGTGGCCCACCTCACCTGCATCTTCTGTG...CAGGCCACTGCAGCCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 CACCTGGATGGGGGTGAGGGGGTCATCTGCCTGACCCACAGACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 113157 CACCTGGATGGGGGTGAGGGGGTCATCTGCCTGACCCACAGACAGGTG..

   2300     .    :    .    :    .
   2134     TGGATGGAGGTGGCCACCTTCTCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||
 113207 .TAGTGGATGGAGGTGGCCACCTTCTCC