seq1 = pF1KE0351.tfa, 2454 bp
seq2 = pF1KE0351/gi568815583r_41968718.tfa (gi568815583r:41968718_42194459), 225742 bp

>pF1KE0351 2454
>gi568815583r:41968718_42194459 (Chr15)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-118  (106760-106832)   100% ->
119-255  (107024-107160)   100% ->
256-387  (108116-108247)   100% ->
388-428  (108929-108969)   100% ->
429-471  (109322-109364)   100% ->
472-535  (110681-110744)   100% ->
536-672  (111126-111262)   100% ->
673-783  (112071-112181)   100% ->
784-821  (112626-112663)   100% ->
822-957  (112846-112981)   100% ->
958-1094  (113327-113463)   100% ->
1095-1317  (114701-114923)   100% ->
1318-1435  (122068-122185)   100% ->
1436-1573  (122549-122686)   100% ->
1574-1681  (122909-123016)   100% ->
1682-1876  (123143-123337)   100% ->
1877-2043  (123577-123743)   100% ->
2044-2230  (124365-124551)   100% ->
2231-2454  (125519-125742)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGCCTGTCACCTGGGGGACCACCTGGCCACCCTTACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGGAGAGCCTGTCACCTGGGGGACCACCTGGCCACCCTTACCAGGTA..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GGGGAGGCCTCTACCTGCTGGCAGCTCACAGTGAGGGTCCTGGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGGGGGAGGCCTCTACCTGCTGGCAGCTCACAGTGAGGGTCCTGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCGGAACCTGCGCTGGGCTGACCTGT         TGAGTGAGGCCGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106806 CGCGGAACCTGCGCTGGGCTGACCTGTGTG...CAGTGAGTGAGGCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCTTACGTGATCCTACAGCTGTCGACCGCACCTGGAATGAAGTTTAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107038 CCTTACGTGATCCTACAGCTGTCGACCGCACCTGGAATGAAGTTTAAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGACGCTCACCGACACCAGTCATCCTGTGTGGAATGAGGCCTTCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107088 CAAGACGCTCACCGACACCAGTCATCCTGTGTGGAATGAGGCCTTCCGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCTTATCCAAAGTCAGGTCAAG         AATGTTCTGGAGCTTAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107138 TCCTTATCCAAAGTCAGGTCAAGGTG...TAGAATGTTCTGGAGCTTAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATCTATGATGAGGACTCAGTCACGGAGGATGACATCTGCTTCAAGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108134 ATCTATGATGAGGACTCAGTCACGGAGGATGACATCTGCTTCAAGGTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTATGACATCTCAGAAGTCCTCCCTGGCAAGCTGCTCCGGAAAACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108184 CTATGACATCTCAGAAGTCCTCCCTGGCAAGCTGCTCCGGAAAACCTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCAGAGTCCCCAG         GGAGAGGAGGAGCTGGATGTGGAGTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108234 CCCAGAGTCCCCAGGTG...CAGGGAGAGGAGGAGCTGGATGTGGAGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGATGGAAGAAAC         GTCAGATCGCCCAGAAAACCTCATCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108956 CTGATGGAAGAAACGTG...CAGGTCAGATCGCCCAGAAAACCTCATCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAACAAAGTCATTGTG         GCCCGAGAGCTGTCATGCCTGGATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 109349 CAACAAAGTCATTGTGGTA...CAGGCCCGAGAGCTGTCATGCCTGGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGCATCTGGACAGCACAGGGAGCACCGCTGTGGTTGCAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110706 TGCATCTGGACAGCACAGGGAGCACCGCTGTGGTTGCAGGTG...TAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CAGGACAAGCTGGAGCTGGAGCTGGTGCTGAAGGGGTCCTATGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111128 CAGGACAAGCTGGAGCTGGAGCTGGTGCTGAAGGGGTCCTATGAGGACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 ACAGACATCCTTCCTGGGCACAGCCTCTGCCTTCCGCTTCCACTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111178 ACAGACATCCTTCCTGGGCACAGCCTCTGCCTTCCGCTTCCACTACATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CAGCCCTAGAGACAGAGCTGAGCGGGCGCCTGAGG         AGCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 111228 CAGCCCTAGAGACAGAGCTGAGCGGGCGCCTGAGGGTG...CAGAGCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AGAAGCAATGGCTGGAATGGGGACAACTCAGCTGGGTACCTCACTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112077 AGAAGCAATGGCTGGAATGGGGACAACTCAGCTGGGTACCTCACTGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CCTGAGGCCCTTGACCATTGGGAAGGAGGTGACTATGGATGTTCCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112127 CCTGAGGCCCTTGACCATTGGGAAGGAGGTGACTATGGATGTTCCTGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CAAAT         GCCCCAGGAGTGAGGCTGCAGCTCAAGGCAGAGGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112177 CAAATGTA...CAGGCCCCAGGAGTGAGGCTGCAGCTCAAGGCAGAGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TG         CCCTGAGGAGCTGGCCGTGCACCTGGGCTTCAATCTCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112662 TGGTA...CAGCCCTGAGGAGCTGGCCGTGCACCTGGGCTTCAATCTCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGCAGAGGAGCAGGCCTTCCTGAGCAGGAGGAAGCAGGTGGTGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112885 TGCAGAGGAGCAGGCCTTCCTGAGCAGGAGGAAGCAGGTGGTGGCCAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CCCTGAAGCAGGCCCTGCAGCTGGACAGAGACCTGCAGGAGGATGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 112935 CCCTGAAGCAGGCCCTGCAGCTGGACAGAGACCTGCAGGAGGATGAGGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    958       GTACCCGTTGTGGGCATCATGGCCACAGGAGGAGGTGCCCGGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112985 ...CAGGTACCCGTTGTGGGCATCATGGCCACAGGAGGAGGTGCCCGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CATGACCTCACTCTACGGCCACCTATTGGCCTTGCAGAAGCTGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113371 CATGACCTCACTCTACGGCCACCTATTGGCCTTGCAGAAGCTGGGCCTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TAGACTGTGTGACCTACTTCAGTGGCATCTCTGGCTCTACGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113421 TAGACTGTGTGACCTACTTCAGTGGCATCTCTGGCTCTACGTGGTG...C

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1095   GACAATGGCCCACCTGTACGGGGACCCTGAGTGGTCGCAGAGGGACCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114699 AGGACAATGGCCCACCTGTACGGGGACCCTGAGTGGTCGCAGAGGGACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGAGGGACCTATCAGATACGCCCGGGAGCACCTGGCCAAGAGCAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114749 GGAGGGACCTATCAGATACGCCCGGGAGCACCTGGCCAAGAGCAAGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AGGTCTTTTCCCCAGAGCGCCTGGCGAGCTACCGCCGGGAGCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114799 AGGTCTTTTCCCCAGAGCGCCTGGCGAGCTACCGCCGGGAGCTGGAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CGGGCTGAGCAGGGCCACCCCACGACCTTTGTGGACCTGTGGGCGCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114849 CGGGCTGAGCAGGGCCACCCCACGACCTTTGTGGACCTGTGGGCGCTAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GCTGGAGTCCATGCTGCACGGCCAG         GTGATGGATCAGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 114899 GCTGGAGTCCATGCTGCACGGCCAGGTA...CAGGTGATGGATCAGAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 TGTCAGGACAGAGAGCCGCCCTGGAACGGGGTCAGAACCCTCTGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122084 TGTCAGGACAGAGAGCCGCCCTGGAACGGGGTCAGAACCCTCTGCCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TACTTGAGCCTCAATGTCAAAGAGAACAATCTGGAGACACTGGACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122134 TACTTGAGCCTCAATGTCAAAGAGAACAATCTGGAGACACTGGACTTCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GG         AGTGGGTTGAGTTCTCCCCCTATGAGGTCGGTTTCCTGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122184 GGGTA...TAGAGTGGGTTGAGTTCTCCCCCTATGAGGTCGGTTTCCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AGTACGGGGCCTTCGTCCCTCCTGAGCTCTTCGGCTCCGAGTTCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122588 AGTACGGGGCCTTCGTCCCTCCTGAGCTCTTCGGCTCCGAGTTCTTCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GGACGGCTGATGAGGAGGATCCCGGAGCCCCGGATCTGCTTTCTGGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122638 GGACGGCTGATGAGGAGGATCCCGGAGCCCCGGATCTGCTTTCTGGAAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574         CCATCTGGAGCAACATTTTCTCCCTGAACCTGCTGGATGCCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122688 TG...CAGCCATCTGGAGCAACATTTTCTCCCTGAACCTGCTGGATGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GGTATGACCTCACCAGTTCTGGGGAGTCCTGGAAACAGCACATCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122951 GGTATGACCTCACCAGTTCTGGGGAGTCCTGGAAACAGCACATCAAGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 AAGACCAGGAGCTTAG         AGAAGGAGCCCCTGACCACCTCGGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 123001 AAGACCAGGAGCTTAGGTG...CAGAGAAGGAGCCCCTGACCACCTCGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GACCTCCTCGCGGCTGGAGGCCTCGTGGCTGCAGCCAGGCACGGCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123168 GACCTCCTCGCGGCTGGAGGCCTCGTGGCTGCAGCCAGGCACGGCGCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 CCCAGGCATTTAAAGGCTTCCTGACAGGCAGGCCCCTCCACCAGCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123218 CCCAGGCATTTAAAGGCTTCCTGACAGGCAGGCCCCTCCACCAGCGCAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 CCCAACTTCCTCCAGGGCCTCCAGCTGCACCAGGACTACTGTAGCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123268 CCCAACTTCCTCCAGGGCCTCCAGCTGCACCAGGACTACTGTAGCCACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 AGACTTCTCCACCTGGGCAG         ACTACCAGCTTGACTCCATGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 123318 AGACTTCTCCACCTGGGCAGGTC...CAGACTACCAGCTTGACTCCATGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 CCAGCCAGCTGACCCCCAAGGAGCCCCGGCTCTGCCTGGTGGACGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123598 CCAGCCAGCTGACCCCCAAGGAGCCCCGGCTCTGCCTGGTGGACGCCGCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 TACTTCATCAACACCAGCTCTCCCTCCATGTTCCGGCCAGGCCGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123648 TACTTCATCAACACCAGCTCTCCCTCCATGTTCCGGCCAGGCCGCAGGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GGACCTCATCCTCTCCTTCGACTACTCCCTATCTGCGCCCTTCGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 123698 GGACCTCATCCTCTCCTTCGACTACTCCCTATCTGCGCCCTTCGAGGTA.

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2044      GCACTGCAGCAGACGGAGCTGTACTGCCGGGCCCGGGGGCTGCCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123748 ..CAGGCACTGCAGCAGACGGAGCTGTACTGCCGGGCCCGGGGGCTGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 TTCCCCCGGGTGGAACCCAGCCCTCAGGACCAGCACCAGCCAAGGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124410 TTCCCCCGGGTGGAACCCAGCCCTCAGGACCAGCACCAGCCAAGGGAATG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CCACCTCTTCTCAGACCCCGCCTGCCCCGAGGCCCCGATCCTGCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124460 CCACCTCTTCTCAGACCCCGCCTGCCCCGAGGCCCCGATCCTGCTGCACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TCCCGCTGGTCAATGCCTCCTTCAAGGACCACTCAGCCCCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 124510 TCCCGCTGGTCAATGCCTCCTTCAAGGACCACTCAGCCCCCGGTG...CA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2231  GTGTCCAGCGCAGCCCCGCAGAGCTCCAGGGTGGCCAAGTGGATCTCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125518 GGTGTCCAGCGCAGCCCCGCAGAGCTCCAGGGTGGCCAAGTGGATCTCAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CGGGGCCACCTGCCCCTACACCCTGTCCAACATGACCTACAAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125568 CGGGGCCACCTGCCCCTACACCCTGTCCAACATGACCTACAAGGAGGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 ACTTCGAGCGCCTGCTGCGGCTCAGTGACTACAACGTGCAGACCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125618 ACTTCGAGCGCCTGCTGCGGCTCAGTGACTACAACGTGCAGACCAGCCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GGTGCCATCCTGCAGGCCCTGAGGACCGCGCTGAAGCACCGGACTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125668 GGTGCCATCCTGCAGGCCCTGAGGACCGCGCTGAAGCACCGGACTCTAGA

   2600     .    :    .    :    .
   2430 GGCGAGGCCTCCAAGGGCACAGACC
        |||||||||||||||||||||||||
 125718 GGCGAGGCCTCCAAGGGCACAGACC