seq1 = pF1KE0348.tfa, 1509 bp
seq2 = pF1KE0348/gi568815578r_772963.tfa (gi568815578r:772963_1016214), 243252 bp

>pF1KE0348 1509
>gi568815578r:772963_1016214 (Chr20)

(complement)

1-309  (100001-100309)   100% ->
310-465  (125847-126002)   100% ->
466-587  (127776-127897)   100% ->
588-835  (130890-131137)   100% ->
836-951  (134929-135044)   100% ->
952-1053  (136367-136468)   100% ->
1054-1220  (137888-138054)   100% ->
1221-1351  (141801-141931)   100% ->
1352-1509  (143095-143252)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCTCCCAGCTAGCCATGCTGCAGGGCAGCCTCCTCCTTGTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCTCCCAGCTAGCCATGCTGCAGGGCAGCCTCCTCCTTGTGGTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCATGTCTGTGGCTCAACAGACAAGGCAGGAGGCGGATAGGGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCATGTCTGTGGCTCAACAGACAAGGCAGGAGGCGGATAGGGGCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACACTTGTAGTCCAGCACGGCCACTGTAGCTACACCTTCTTGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACACTTGTAGTCCAGCACGGCCACTGTAGCTACACCTTCTTGCTGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGTCTGAGCCCTGCCCTCCGGGGCCTGAGGTCTCCAGGGACTCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGTCTGAGCCCTGCCCTCCGGGGCCTGAGGTCTCCAGGGACTCCAACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCAGAGAGAATCACTGGCCAACCCACTGCACCTGGGGAAGTTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCCAGAGAGAATCACTGGCCAACCCACTGCACCTGGGGAAGTTGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCAGCAGGTGAAACAGCTGGAGCAGGCACTGCAGAACAACACGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCAGCAGGTGAAACAGCTGGAGCAGGCACTGCAGAACAACACGCAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAAGAAG         CTAGAGAGGGCCATCAAGACGATCTTGAGGTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGAAGAAGGTA...CAGCTAGAGAGGGCCATCAAGACGATCTTGAGGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGCTGGAGCAGGTCCAGCAGCAAATGGCCCAGAATCAGACGGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125879 GAAGCTGGAGCAGGTCCAGCAGCAAATGGCCCAGAATCAGACGGCCCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCTAGAGCTGGGCACCAGCCTCCTGAACCAGACCACTGCCCAGATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125929 TGCTAGAGCTGGGCACCAGCCTCCTGAACCAGACCACTGCCCAGATCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGCTGACCGACATGGAGGCTCAG         CTCCTGAACCAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 125979 AAGCTGACCGACATGGAGGCTCAGGTA...CAGCTCCTGAACCAGACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAGAATGGATGCCCAGATGCCAGAGACCTTTCTGTCCACCAACAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127793 AAGAATGGATGCCCAGATGCCAGAGACCTTTCTGTCCACCAACAAGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAACCAGCTGCTGCTACAGAGGCAGAAGCTCCAGCAGCTTCAGGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127843 AGAACCAGCTGCTGCTACAGAGGCAGAAGCTCCAGCAGCTTCAGGGCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACAG         CGCGCTCGAGAAGCGGTTGCAGGCCCTGGAGACCAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127893 AACAGGTG...CAGCGCGCTCGAGAAGCGGTTGCAGGCCCTGGAGACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGCAGGAGGAGCTGGCCAGCATCCTCAGCAAGAAGGCGAAGCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130926 GCAGCAGGAGGAGCTGGCCAGCATCCTCAGCAAGAAGGCGAAGCTGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACACGCTGAGCCGCCAGAGCGCCGCCCTCACCAACATCGAGCGCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130976 ACACGCTGAGCCGCCAGAGCGCCGCCCTCACCAACATCGAGCGCGGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGCGGTGTCAGGCACAACTCCAGCCTCCTGCAGGACCAGCAGCACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131026 CGCGGTGTCAGGCACAACTCCAGCCTCCTGCAGGACCAGCAGCACAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCGCCAGCTGCTGGTGTTGTTGCGGCACCTGGTGCAAGAAAGGGCTAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131076 GCGCCAGCTGCTGGTGTTGTTGCGGCACCTGGTGCAAGAAAGGGCTAACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTCGGCCCCGG         CCTTCATAATGGCAGGTGAGCAGGTGTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131126 CCTCGGCCCCGGGTG...CAGCCTTCATAATGGCAGGTGAGCAGGTGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAGGACTGTGCAGAGATCCAGCGCTCTGGGGCCAGTGCCAGTGGTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134958 CAGGACTGTGCAGAGATCCAGCGCTCTGGGGCCAGTGCCAGTGGTGTCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACCATCCAGGTGTCCAATGCAACGAAGCCCAGGAAG         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 135008 CACCATCCAGGTGTCCAATGCAACGAAGCCCAGGAAGGTT...CAGGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCTGTGACCTGCAGAGCAGTGGAGGCAGGTGGACCCTCATCCAGCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136371 TCTGTGACCTGCAGAGCAGTGGAGGCAGGTGGACCCTCATCCAGCGCCGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGAATGGCACCGTGAATTTTCAGCGGAACTGGAAGGATTACAAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 136421 GAGAATGGCACCGTGAATTTTCAGCGGAACTGGAAGGATTACAAACAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1054        GGCTTCGGAGACCCAGCTGGGGAGCACTGGCTGGGCAATGAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136471 A...TAGGGCTTCGGAGACCCAGCTGGGGAGCACTGGCTGGGCAATGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGTGCACCAGCTCACCAGAAGGGCAGCCTACTCTCTGCGTGTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137931 TGGTGCACCAGCTCACCAGAAGGGCAGCCTACTCTCTGCGTGTGGAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAAGACTGGGAAGGCCACGAGGCCTATGCCCAGTACGAACATTTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137981 CAAGACTGGGAAGGCCACGAGGCCTATGCCCAGTACGAACATTTCCACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGGCAGTGAGAACCAGCTATACAG         GCTTTCTGTGGTCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 138031 GGGCAGTGAGAACCAGCTATACAGGTG...CAGGCTTTCTGTGGTCGGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACAGCGGCTCAGCAGGGCGCCAGAGCAGCCTGGTCCTGCAGAACACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141818 ACAGCGGCTCAGCAGGGCGCCAGAGCAGCCTGGTCCTGCAGAACACCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTTAGCACCCTTGACTCAGACAACGACCACTGTCTCTGCAAGTGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141868 TTTAGCACCCTTGACTCAGACAACGACCACTGTCTCTGCAAGTGTGCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AGTGATGTCTGGAG         GGTGGTGGTTTGACGCCTGTGGCCTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 141918 AGTGATGTCTGGAGGTA...CAGGGTGGTGGTTTGACGCCTGTGGCCTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAAACCTCAACGGCGTCTACTACCACGCTCCCGACAACAAGTACAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143122 CAAACCTCAACGGCGTCTACTACCACGCTCCCGACAACAAGTACAAGATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GACGGCATCCGCTGGCACTACTTCAAGGGCCCCAGCTACTCACTGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143172 GACGGCATCCGCTGGCACTACTTCAAGGGCCCCAGCTACTCACTGCGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :
   1479 CTCTCGCATGATGATACGGCCTTTGGACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 143222 CTCTCGCATGATGATACGGCCTTTGGACATC