seq1 = pF1KE0346.tfa, 1905 bp
seq2 = pF1KE0346/gi568815576r_20929058.tfa (gi568815576r:20929058_21131812), 202755 bp

>pF1KE0346 1905
>gi568815576r:20929058_21131812 (Chr22)

(complement)

1-982  (100001-100982)   99% ->
983-1623  (101462-102102)   99% ->
1624-1732  (102369-102477)   100% ->
1733-1905  (102583-102755)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGGGGCTGCCCACCATTGCTAGCCTGGCACGCTTATGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGGGGCTGCCCACCATTGCTAGCCTGGCACGCTTATGCCAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGAACCGCCTGAAGCCGCTGGAGGACTCCATCATGGAGACGTCACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100051 GCTGAACCGCCTGAAGCCGCTGGAGGACTCCACCATGGAGACGTCACTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCGCTGCCTGTCCACGCTGGACCTGACTCTTCTGGGCGTGGGTGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCGCTGCCTGTCCACGCTGGACCTGACTCTTCTGGGCGTGGGTGGCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGCTCGGGTCTCTACGTGCTCACAGGTGCCGTGGCCAAGGAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGGCTCGGGTCTCTACGTGCTCACAGGTGCCGTGGCCAAGGAGGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCCCTGCTGTGCTCTTGTCCTTCGGTGTGGCCGCTGTGGCCTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCCCTGCTGTGCTCTTGTCCTTCGGTGTGGCCGCTGTGGCCTCCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCAGCCCTATGCTATGCAGAATTTGGGGCACGTGTGCCACGCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCAGCCCTATGCTATGCAGAATTTGGGGCACGTGTGCCACGCACGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTGCCTACCTGTTCACCTACGTATCCATGGGCGAGCTGTGGGCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTGCCTACCTGTTCACCTACGTATCCATGGGCGAGCTGTGGGCCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCGGCTGGAATGTTCTCCTCGAATACATCATCGGTGGCGCCGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCGGCTGGAATGTTCTCCTCGAATACATCATCGGTGGCGCCGCCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCGTGCCTGGAGTGGCTACCTGGACTCTATGTTCAGCCACAGCATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCGTGCCTGGAGTGGCTACCTGGACTCTATGTTCAGCCACAGCATCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACTTCACTGAGACCCACGTGGGTTCTTGGCAGGTGCCCCTCCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACTTCACTGAGACCCACGTGGGTTCTTGGCAGGTGCCCCTCCTGGGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACCCGGACTTCCTGGCTGCTGGCATCATCCTCCTGGCCTCTGCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACCCGGACTTCCTGGCTGCTGGCATCATCCTCCTGGCCTCTGCCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTCCTGTGGAGCCCGCGTGTCCTCCTGGCTCAATCACACCTTCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCCTGTGGAGCCCGCGTGTCCTCCTGGCTCAATCACACCTTCTCGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGCCTGCTTGTCATTCTCTTCATTGTCATCCTGGGCTTCATCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGCCTGCTTGTCATTCTCTTCATTGTCATCCTGGGCTTCATCCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCAGCCTCACAACTGGAGCGCTGACGAAGGCGGCTTTGCACCCTTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCAGCCTCACAACTGGAGCGCTGACGAAGGCGGCTTTGCACCCTTCGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTCCGGCGTCATGGCCGGCACTGCCTCCTGCTTCTATGCTTTCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTCCGGCGTCATGGCCGGCACTGCCTCCTGCTTCTATGCTTTCGTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCGACGTCATTGCCGCCTCCAGTGAGGAGGCCCAGAACCCACGGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCGACGTCATTGCCGCCTCCAGTGAGGAGGCCCAGAACCCACGGCGGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGCCTCTGGCCATCGCCATCTCGCTTGCCATTGCAGCTGGTGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGCCTCTGGCCATCGCCATCTCGCTTGCCATTGCAGCTGGTGCCTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTTGTCTCCACCGTGCTAACCCTCATGGTGCCCTGGCACAGCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTTGTCTCCACCGTGCTAACCCTCATGGTGCCCTGGCACAGCCTGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCGACTCAGCGCTTGCAGATGCCTTCTACCAGCGGGGCTACAGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCGACTCAGCGCTTGCAGATGCCTTCTACCAGCGGGGCTACAGGTGGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCTTCATCGTGGCAGCTGGCTCCATCTGCG         CCATGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100951 TGGCTTCATCGTGGCAGCTGGCTCCATCTGCGGTG...CAGCCATGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCGTCCTGCTCAGCCTCCTCTTCTCCCTGCCACGCATTGTCTATGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101471 CCGTCCTGCTCAGCCTCCTCTTCTCCCTGCCACGCATTGTCTATGCCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCCACCGATGGGCTCTTCTTCCAGGTGTTTGCCCATGTGCACCCCCGGAC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101521 GCCGCCGATGGGCTCTTCTTCCAGGTGTTTGCCCATGTGCACCCCCGGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 ACAGGTGCCTGTGGCGGGCACCCTGGCGTTCGGGCTCCTCACGGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101571 ACAGGTGCCTGTGGCGGGCACCCTGGCGTTCGGGCTCCTCACGGCCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGGCACTGCTGCTGGACCTGGAGTCGCTGGTTCAGTTCCTGTCCCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 TGGCACTGCTGCTGGACCTGGAGTCGCTGGTTCAGTTCCTGTCCCTTGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ACACTCCTGGCCTACACATTCGTGGCCACCAGTATCATTGTGCTGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101671 ACACTCCTGGCCTACACATTCGTGGCCACCAGTATCATTGTGCTGCGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCAGAAGTCTTCCCCGCCCAGCTCCCCAGGCCCAGCCAGCCCTGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101721 CCAGAAGTCTTCCCCGCCCAGCTCCCCAGGCCCAGCCAGCCCTGGCCCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TGACCAAGCAGCAGAGCTCCTTCTCAGACCACCTACAGCTGGTGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 TGACCAAGCAGCAGAGCTCCTTCTCAGACCACCTACAGCTGGTGGGCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GTACACGCCTCCGTCCCTGAGCCAGGGGAGCTGAAGCCAGCCCTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101821 GTACACGCCTCCGTCCCTGAGCCAGGGGAGCTGAAGCCAGCCCTGAGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CTACCTGGGCTTCTTGGATGGGTACAGCCCTGGAGCAGTGGTGACTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101871 CTACCTGGGCTTCTTGGATGGGTACAGCCCTGGAGCAGTGGTGACTTGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CGCTTGGCGTTATGTTGGCCTCAGCCATCACCATAGGCTGCGTGCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101921 CGCTTGGCGTTATGTTGGCCTCAGCCATCACCATAGGCTGCGTGCTTGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TTTGGGAACTCGACCCTGCACCTCCCACACTGGGGTTACATCCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 TTTGGGAACTCGACCCTGCACCTCCCACACTGGGGTTACATCCTGCTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CCTGCTCACCAGTGTCATGTTTCTGCTCAGCCTCCTTGTCCTGGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102021 CCTGCTCACCAGTGTCATGTTTCTGCTCAGCCTCCTTGTCCTGGGGGCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 ACCAGCAACAGTATCGGGAAGACTTATTTCAG         ATCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102071 ACCAGCAACAGTATCGGGAAGACTTATTTCAGGTA...CAGATCCCCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GTTCCCCTGATTCCAGCCCTGAGCATCGTCCTCAACATCTGCCTCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102378 GTTCCCCTGATTCCAGCCCTGAGCATCGTCCTCAACATCTGCCTCATGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GAAACTTAGCTATCTGACCTGGGTGCGCTTCTCCATCTGGCTGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102428 GAAACTTAGCTATCTGACCTGGGTGCGCTTCTCCATCTGGCTGCTGATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733          GACTTGCAGTGTATTTCGGCTATGGCATCCGGCATAGCAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102478 GTG...TAGGACTTGCAGTGTATTTCGGCTATGGCATCCGGCATAGCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GAGAACCAGCGGGAGCTGCCAGGGCTGAACTCCACACACTACGTGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 GAGAACCAGCGGGAGCTGCCAGGGCTGAACTCCACACACTACGTGGTATT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCCCAGGGGCAGCCTGGAGGAGACAGTGCAGGCTATGCAGCCCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102674 CCCCAGGGGCAGCCTGGAGGAGACAGTGCAGGCTATGCAGCCCCCCAGCC

   1900     .    :    .    :    .    :
   1874 AGGCACCAGCACAGGACCCTGGCCATATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 AGGCACCAGCACAGGACCCTGGCCATATGGAG