seq1 = pF1KE0342.tfa, 1875 bp
seq2 = pF1KE0342/gi568815576r_20012566.tfa (gi568815576r:20012566_20216614), 204049 bp

>pF1KE0342 1875
>gi568815576r:20012566_20216614 (Chr22)

(complement)

1-24  (99709-99732)   100% ->
25-599  (100003-100577)   100% ->
600-708  (100835-100943)   100% ->
709-890  (101168-101349)   100% ->
891-1005  (101536-101650)   100% ->
1006-1121  (101739-101854)   100% ->
1122-1233  (101930-102041)   100% ->
1234-1356  (102807-102929)   100% ->
1357-1432  (103108-103183)   100% ->
1433-1549  (103381-103497)   100% ->
1550-1646  (103608-103704)   100% ->
1647-1875  (103821-104049)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGAGAACCTCGACAACGAG         GGCCCGAAGCCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  99709 ATGAGTGAGAACCTCGACAACGAGGTA...CAGGGCCCGAAGCCCATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGCTGTGGCCAGGAGAGCAGCAGTGCCCTGAGCTGCCCTACCGTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 GAGCTGTGGCCAGGAGAGCAGCAGTGCCCTGAGCTGCCCTACCGTCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCCCCCTGCAGCCCCGGCAGCCCTGGAGGAGGTGGAGAAAGAGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 TGCCCCCTGCAGCCCCGGCAGCCCTGGAGGAGGTGGAGAAAGAGGGCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGGCGGCTACAGGGCCGGGGCCTCAGCCCGGGCTCTACAGCTACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100120 GGGGCGGCTACAGGGCCGGGGCCTCAGCCCGGGCTCTACAGCTACATCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATGACTTGTTTACCTCTGAGATCTTTAAACTGGAGCTGCAGAACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 GGATGACTTGTTTACCTCTGAGATCTTTAAACTGGAGCTGCAGAACGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCGCCACGCCAGCTTCAGCGACGTCCGGCGCTTCCTGGGCCGCTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100220 CTCGCCACGCCAGCTTCAGCGACGTCCGGCGCTTCCTGGGCCGCTTTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCAGCCCCACAAAACCAAACTCTTTGGGCAACCACCCTGCGCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100270 CTGCAGCCCCACAAAACCAAACTCTTTGGGCAACCACCCTGCGCCTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACATTCCGCAGCGCTGCAGAGAGGGACAAGGCCCTGCGCGTTTTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100320 GACATTCCGCAGCGCTGCAGAGAGGGACAAGGCCCTGCGCGTTTTGCATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGCCCTCTGGAAAGGCCGCCCACTCAGTGTGCGCCTGGCCCGGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100370 GTGCCCTCTGGAAAGGCCGCCCACTCAGTGTGCGCCTGGCCCGGCCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCGACCCCATGGCCAGGAGGAGGCGACAGGAGGGTGAGAGTGAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100420 GCCGACCCCATGGCCAGGAGGAGGCGACAGGAGGGTGAGAGTGAGCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGTAACACGAGTGGCCGACGTGGTGACCCCTCTATGGACAGTGCCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100470 AGTAACACGAGTGGCCGACGTGGTGACCCCTCTATGGACAGTGCCCTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGAGCAGCTTGAGCGGAAGCAGCTGGAGTGCGAGCAGGTGCTGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100520 CTGAGCAGCTTGAGCGGAAGCAGCTGGAGTGCGAGCAGGTGCTGCAGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTTGCCAA         GGAAATCGGGAGCACCAACCGTGCCTTGCTGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100570 CTTGCCAAGTG...CAGGGAAATCGGGAGCACCAACCGTGCCTTGCTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTGGCTGCTCGAGCAGAGGCACAAGCACAACAAGGCCTGCTGCCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100868 CTGGCTGCTCGAGCAGAGGCACAAGCACAACAAGGCCTGCTGCCCGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGGGGTCAGGCCATCACCCCAGCAG         ACTGAGTATCGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100918 AGGGGGTCAGGCCATCACCCCAGCAGGTC...CAGACTGAGTATCGTAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAGTGTGAGTTTCTGGTTGGCGTCGGGGTGGATGGGGAGGATAACACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101183 AAGTGTGAGTTTCTGGTTGGCGTCGGGGTGGATGGGGAGGATAACACCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGGCTGTCGGCTCGGCAAGTACAAGGGCGGGACGTGTGCTGTGGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101233 GGGCTGTCGGCTCGGCAAGTACAAGGGCGGGACGTGTGCTGTGGCAGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CGTTTGACACCGTGCACATCCCCGAAGCCACCAAGCAGGTGGTGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101283 CGTTTGACACCGTGCACATCCCCGAAGCCACCAAGCAGGTGGTGAAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTCCAGGAGTTCATCCG         GTCCACTCCATACTCGGCATACGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101333 TTCCAGGAGTTCATCCGGTG...CAGGTCCACTCCATACTCGGCATACGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCCAGAGACGTACACAGGCCACTGGAAGCAGCTGACTGTGCGCACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 CCCAGAGACGTACACAGGCCACTGGAAGCAGCTGACTGTGCGCACCAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCCGCCACCAGGCCATGGCCATTGCCTACTTCCACCCCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101610 GCCGCCACCAGGCCATGGCCATTGCCTACTTCCACCCCCAGGTC...CAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAGCTGAGCCCTGAGGAGCTGGCAGAGCTGAAGACCTCCCTAGCGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101739 AAGCTGAGCCCTGAGGAGCTGGCAGAGCTGAAGACCTCCCTAGCGCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTTCACAGCAGGGCCAGGCAGGGCCAGTGGAGTGACCTGCCTCTACTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101789 CTTCACAGCAGGGCCAGGCAGGGCCAGTGGAGTGACCTGCCTCTACTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGGAGGAGGGACAGCG         AAAGACTCCTAGCCAGGAGGGCCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101839 TGGAGGAGGGACAGCGGTA...CAGAAAGACTCCTAGCCAGGAGGGCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CCCCTGGAGCATGTGGCTGGGGACCGGTGCATCCACGAGGACCTGCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101955 CCCCTGGAGCATGTGGCTGGGGACCGGTGCATCCACGAGGACCTGCTAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCTGACCTTCCGGATCTCTCCACACGCCTTCTTCCAG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102005 GCTGACCTTCCGGATCTCTCCACACGCCTTCTTCCAGGTA...CAGGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACACACCCGCAGCCGAGGTGCTCTACACAGTCATCCAGGACTGGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102811 ACACACCCGCAGCCGAGGTGCTCTACACAGTCATCCAGGACTGGGCCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTGGATGCGGGGAGCATGGTGCTGGACGTGTGCTGTGGCACCGGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102861 TTGGATGCGGGGAGCATGGTGCTGGACGTGTGCTGTGGCACCGGCACCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGGCCTGGCCCTGGCCCGG         AAGGTAAAGAGGGTCATTGGGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102911 TGGCCTGGCCCTGGCCCGGGTG...CAGAAGGTAAAGAGGGTCATTGGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCGAGCTATGCCCAGAGGCTGTGGAGGACGCCCGGGTGAACGCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103130 TCGAGCTATGCCCAGAGGCTGTGGAGGACGCCCGGGTGAACGCCCAGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AATG         AGTTGAGTAATGTGGAGTTCCACTGCGGGAGGGCCGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103180 AATGGTG...CAGAGTTGAGTAATGTGGAGTTCCACTGCGGGAGGGCCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGACCTGGTGCCCACCCTGGTGAGCAGACTGGCCTCCCAGCACCTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103418 GGACCTGGTGCCCACCCTGGTGAGCAGACTGGCCTCCCAGCACCTCGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCATCCTGGACCCACCCCGTGCTGGCTTGC         ATTCCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103468 CCATCCTGGACCCACCCCGTGCTGGCTTGCGTG...CAGATTCCAAGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATCCTGGCCATCCGGAGAGCTAAGAACCTCAGGCGGCTGCTGTACGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103619 ATCCTGGCCATCCGGAGAGCTAAGAACCTCAGGCGGCTGCTGTACGTCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 ATGCAACCCCCGGGCAGCCATGGGCAACTTTGTGGA         CCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103669 ATGCAACCCCCGGGCAGCCATGGGCAACTTTGTGGAGTG...CAGCCTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GCAGAGCCCCATCTAACCGGGTGAAGGGCATTCCCTTCCGGCCGGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103826 GCAGAGCCCCATCTAACCGGGTGAAGGGCATTCCCTTCCGGCCGGTCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GCTGTGGCAGTGGACCTGTTCCCGCAGACCCCGCACTGTGAGATGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103876 GCTGTGGCAGTGGACCTGTTCCCGCAGACCCCGCACTGTGAGATGCTCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCTGTTTGAGAGGGTGGAGCACCCCAATGGCACAGGGGTCTTGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103926 CCTGTTTGAGAGGGTGGAGCACCCCAATGGCACAGGGGTCTTGGGGCCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ACAGCCCTCCAGCTCAACCCACACCAGGACCCCCAGATAACACCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103976 ACAGCCCTCCAGCTCAACCCACACCAGGACCCCCAGATAACACCCTACAA

   1950     .    :    .    :
   1852 GAAACTGGGACCTTCCCCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||
 104026 GAAACTGGGACCTTCCCCTCATCC