seq1 = pF1KE0341.tfa, 2052 bp
seq2 = pF1KE0341/gi568815576r_36390011.tfa (gi568815576r:36390011_36606422), 216412 bp

>pF1KE0341 2052
>gi568815576r:36390011_36606422 (Chr22)

(complement)

1-527  (100001-100527)   100% ->
528-779  (101657-101908)   99% ->
780-1049  (102056-102325)   99% ->
1050-1216  (105016-105182)   100% ->
1217-1382  (108267-108432)   100% ->
1383-1624  (110215-110456)   100% ->
1625-1795  (112620-112790)   100% ->
1796-2052  (116156-116412)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCTCTCCGCTGCGGCCCCGTTGTGGGGTCCCCCGGGGCTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCTCTCCGCTGCGGCCCCGTTGTGGGGTCCCCCGGGGCTGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCATCGCCCTGCACCCAGCGCTGTCGGTGCCCCCGCGCCGGGACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCATCGCCCTGCACCCAGCGCTGTCGGTGCCCCCGCGCCGGGACTACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGCTGGGCGCTGGGCCCGCGGGCCTGCAGATGGCCTACTTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGCTGGGCGCTGGGCCCGCGGGCCTGCAGATGGCCTACTTCCTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCGCTGGACGCGACTACGCAGTGTTCGAGCGGGCCCCGCGGCCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCGCTGGACGCGACTACGCAGTGTTCGAGCGGGCCCCGCGGCCCGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTTCACACGCTACCCGCGGCACCGCAAGCTCATCAGCATCAACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTTCACACGCTACCCGCGGCACCGCAAGCTCATCAGCATCAACAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGTACACGGGCAAGGCTAACGCCGAGTTCAACCTCCGCCACGACTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGTACACGGGCAAGGCTAACGCCGAGTTCAACCTCCGCCACGACTGGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTCTGCTCAGCCACGACCCCCGGCTGCTCTTCAGACACTACTCGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTCTGCTCAGCCACGACCCCCGGCTGCTCTTCAGACACTACTCGCGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACTTCCCCGACGCCCGCGACATGGTGCGCTACCTGGGTGACTTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTACTTCCCCGACGCCCGCGACATGGTGCGCTACCTGGGTGACTTCGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACGCTGGGGCTCCGTGTCCAGTACAACACCACCATCGCCCACGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACACGCTGGGGCTCCGTGTCCAGTACAACACCACCATCGCCCACGTCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGACAAGGACCGACAGGCCTGGAATGGCCACTACTTCATCCTAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGACAAGGACCGACAGGCCTGGAATGGCCACTACTTCATCCTAACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGAAGGGCCAGGTGCATCAGTGCAG         CGTCCTCCTTGTAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||
 100501 CCAGAAGGGCCAGGTGCATCAGTGCAGGTA...CAGCGTCCTCTTTGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCACTGGTTTATCAGTCCCCAACCAGGTTGACTTCCCTGGCTCCGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101671 CCACTGGTTTATCAGTCCCCAACCAGGTTGACTTCCCTGGCTCCGAATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCAGAGGGTTACGAGTCCGTGTCCGTGGACCCTGAGGACTTTGTAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101721 GCAGAGGGTTACGAGTCCGTGTCCGTGGACCCTGAGGACTTTGTAGGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAATGTGCTGATCCTGGGTCGTGGGAACTCGGCCTTTGAGACAGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 GAATGTGCTGATCCTGGGTCGTGGGAACTCGGCCTTTGAGACAGCAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACATCTTGGGTGTCACAAACTTTATCCATATGCTCAGCCGCTCCCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101821 ACATCTTGGGTGTCACAAACTTTATCCATATGCTCAGCCGCTCCCGGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGTCTGTCCTGGGCCACCCACTACGTTGGAGACCTCAG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101871 CGTCTGTCCTGGGCCACCCACTACGTTGGAGACCTCAGGTA...CAGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CATCAACAATGGCCTGCTGGATACCTACCAGCTCAAGTCCCTGGACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102059 CATCAACAATGGCCTGCTGGATACCTACCAGCTCAAGTCCCTGGACGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGCTCGAGTCTGACCTGACGGATCTGGCCATCCTGAAGGACAGCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102109 TGCTCGAGTCTGACCTGACGGATCTGGCCATCCTGAAGGACAGCAAAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAGTTCCATGTCACCCCGAAATTCTTCCTGGAAGAAGCCAGCACCAACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 102159 AAGTTCCATGTCACCCCGAAATTCTTCCTGGAAGAAGCCAACACCAACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAGTGCCGACTCCATCACCCTCCCCCAGGACGACAATGACAACTTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102209 GAGTGCCGACTCCATCACCCTCCCCCAGGACGACAATGACAACTTTGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGCGCGTGCCCTATGACCGGGTAATCCGCTGCCTGGGCTGGAACTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102259 TGCGCGTGCCCTATGACCGGGTAATCCGCTGCCTGGGCTGGAACTTTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TTCTCCATTTTCAATAA         GTCCCTCAGACTTAACTCGGGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102309 TTCTCCATTTTCAATAAGTG...CAGGTCCCTCAGACTTAACTCGGGAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGCATTCGGCAAGAAGTACCCGCTGATTCGAGCTAGCTACGAATCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105040 TGCATTCGGCAAGAAGTACCCGCTGATTCGAGCTAGCTACGAATCCAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GAAGCCGGGGTCTGTTTATCCTGGGTACTGCCAGCCACTCGGTGGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105090 GAAGCCGGGGTCTGTTTATCCTGGGTACTGCCAGCCACTCGGTGGACTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CGGAAATCTGCTGGGGGCTTCATCCACGGATTCCGATACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105140 CGGAAATCTGCTGGGGGCTTCATCCACGGATTCCGATACACAGGTG...C

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1217   TGCGTGCTGTTCACCGGCTCCTGGAGCACCGCCACCACAGCGTCACCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108265 AGTGCGTGCTGTTCACCGGCTCCTGGAGCACCGCCACCACAGCGTCACCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GGCCCGCCACTGAGCTCCCCATCACACAGCTGACCAGCTCCATCGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108315 GGCCCGCCACTGAGCTCCCCATCACACAGCTGACCAGCTCCATCGTGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CGCGTGAATGAGGCTTCTGGGCTCTACCAGATGTTCGGTGTGCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108365 CGCGTGAATGAGGCTTCTGGGCTCTACCAGATGTTCGGTGTGCTGGCCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TGTCATCCTGTTGAAGGA         GAATTCCACGGCCTTTGAGTACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108415 TGTCATCCTGTTGAAGGAGTG...CAGGAATTCCACGGCCTTTGAGTACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGGAGGAGTTCCCCATACAGATGCTGGCCCAGCTGGAGACACTCACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110238 TGGAGGAGTTCCCCATACAGATGCTGGCCCAGCTGGAGACACTCACAGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AGGAAGGCAAAGCACGGGCTCTTCGTCATCAACATGGAATATGGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110288 AGGAAGGCAAAGCACGGGCTCTTCGTCATCAACATGGAATATGGCAGAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TTTCTCTGGCCCCGACAAGGACGTCTTCTTTGATGACCGGTCTGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110338 TTTCTCTGGCCCCGACAAGGACGTCTTCTTTGATGACCGGTCTGTGGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 ACACAGAAGATGCCTGGCAGTCTAACTTTCTTCATCCTGTCATCTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110388 ACACAGAAGATGCCTGGCAGTCTAACTTTCTTCATCCTGTCATCTACTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 TATAGATACCTCCCCACCG         AACAGGAGGTGAGGTTCCGCCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 110438 TATAGATACCTCCCCACCGGTG...CAGAACAGGAGGTGAGGTTCCGCCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TGCACACTGGCCCCTGCCTCGGCCCACGGCCATCCATCACATCGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112642 TGCACACTGGCCCCTGCCTCGGCCCACGGCCATCCATCACATCGTGGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 ACTTCTTAACAGACTGGACTGCCCCGATCGGGCACATCCTACCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112692 ACTTCTTAACAGACTGGACTGCCCCGATCGGGCACATCCTACCTCTGAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 CGCTTCCTGGAGAACTGTTTGGACACCGATTTGCGAAGCTTCTATGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112742 CGCTTCCTGGAGAACTGTTTGGACACCGATTTGCGAAGCTTCTATGCAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1796         AGTCCTGCTTCCTGTTCGCCCTCACGCGCCAGAAGTTGCCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112792 TA...TAGAGTCCTGCTTCCTGTTCGCCCTCACGCGCCAGAAGTTGCCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 CCTTTTGCCAGCAGGGGTACCTGAGGATGCAGGGACTCGTGAGTACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116198 CCTTTTGCCAGCAGGGGTACCTGAGGATGCAGGGACTCGTGAGTACCGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AGCCTTTGGCAGCACAGAGTGGAGAGCAGGCTCCTGCGGGACTATGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116248 AGCCTTTGGCAGCACAGAGTGGAGAGCAGGCTCCTGCGGGACTATGCCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 CACAGGCAGGCGCCTGGAGGACAGCAGCCAGCAGCTTGGCGACCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116298 CACAGGCAGGCGCCTGGAGGACAGCAGCCAGCAGCTTGGCGACCAAGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 CACTAGGTTCCCCCCTGGCTCCAGGGCCTCTGGCTCAGTCCGTCGATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116348 CACTAGGTTCCCCCCTGGCTCCAGGGCCTCTGGCTCAGTCCGTCGATAGC

   2100     .    :    .
   2038 AACAAAGAGGAGCTC
        |||||||||||||||
 116398 AACAAAGAGGAGCTC