seq1 = pF1KE0338.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KE0338/gi568815576r_32287995.tfa (gi568815576r:32287995_32512156), 224162 bp

>pF1KE0338 1515
>gi568815576r:32287995_32512156 (Chr22)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-172  (103324-103402)   100% ->
173-240  (103915-103982)   100% ->
241-340  (105396-105495)   100% ->
341-497  (110254-110410)   100% ->
498-654  (112398-112554)   100% ->
655-814  (114057-114216)   100% ->
815-990  (115908-116083)   100% ->
991-1179  (116943-117131)   100% ->
1180-1290  (118155-118265)   100% ->
1291-1410  (119798-119917)   100% ->
1411-1515  (124058-124162)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCGCAGCTATAATGATGAGCTGCAGTTCTTGGAGAAGATCAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCGCAGCTATAATGATGAGCTGCAGTTCTTGGAGAAGATCAATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACTGCTGGAGGATCAAGAAGGGCTTCGTGCCCAACATGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 AAACTGCTGGAGGATCAAGAAGGGCTTCGTGCCCAACATGCAGGTA...T

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GTTGAAGGTGTTTTCTATGTGAATGATGCTCTGGAGAAATTGATGTTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103322 AGGTTGAAGGTGTTTTCTATGTGAATGATGCTCTGGAGAAATTGATGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAATTAAGGAATGCCTGTCGAGGTGGTG         GTGTTGGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103372 GAGGAATTAAGGAATGCCTGTCGAGGTGGTGGTA...CAGGTGTTGGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCCTGCCAGCCATGAAACAGATTGGCAATGTGGCAGCCCTGCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103925 CTTCCTGCCAGCCATGAAACAGATTGGCAATGTGGCAGCCCTGCCTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTTCAT         CGATCTATTGGGCTTCCTGATGTCCATTCAGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103975 TTGTTCATGTG...CAGCGATCTATTGGGCTTCCTGATGTCCATTCAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TATGGGTTTGCTATTGGGAACATGGCAGCCTTTGATATGAATGACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105429 TATGGGTTTGCTATTGGGAACATGGCAGCCTTTGATATGAATGACCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCAGTAGTATCCCCAG         GTGGTGTCGGGTTTGACATCAACT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105479 AGCAGTAGTATCCCCAGGTA...TAGGTGGTGTCGGGTTTGACATCAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTGGTGTCCGCTTGCTAAGAACCAATTTAGATGAAAGTGATGTCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110278 GTGGTGTCCGCTTGCTAAGAACCAATTTAGATGAAAGTGATGTCCAGCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGAAGGAGCAACTTGCCCAAGCTATGTTTGACCACATTCCTGTTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110328 GTGAAGGAGCAACTTGCCCAAGCTATGTTTGACCACATTCCTGTTGGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGGTCAAAAGGTGTCATCCCAATGAATGCCAA         AGACTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110378 GGGGTCAAAAGGTGTCATCCCAATGAATGCCAAGTA...CAGAGACTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAGGCCTTGGAGATGGGGGTGGACTGGTCCTTAAGAGAAGGGTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112406 AGGAGGCCTTGGAGATGGGGGTGGACTGGTCCTTAAGAGAAGGGTATGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGGGCTGAAGACAAGGAGCACTGCGAGGAGTACGGAAGGATGCTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112456 TGGGCTGAAGACAAGGAGCACTGCGAGGAGTACGGAAGGATGCTGCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGACCCCAATAAAGTTTCTGCAAGGGCGAAGAAAAGAGGCCTTCCTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112506 TGACCCCAATAAAGTTTCTGCAAGGGCGAAGAAAAGAGGCCTTCCTCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655         TTGGGGACCCTGGGAGCAGGCAACCATTATGCAGAAATCCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112556 TA...CAGTTGGGGACCCTGGGAGCAGGCAACCATTATGCAGAAATCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTTGTGGATGAGATTTTCAATGAGTATGCTGCTAAAAAAATGGGCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114099 GTTGTGGATGAGATTTTCAATGAGTATGCTGCTAAAAAAATGGGCATCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCATAAGGGACAGGTGTGTGTGATGATCCACAGTGGAAGCAGAGGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114149 CCATAAGGGACAGGTGTGTGTGATGATCCACAGTGGAAGCAGAGGCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCACCAAGTAGCCACAG         ATGCGCTGGTAGCTATGGAGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 114199 GCCACCAAGTAGCCACAGGTA...CAGATGCGCTGGTAGCTATGGAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCATGAAGAGAGACAAGATTATAGTCAATGATCGGCAGTTGGCTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115931 GCCATGAAGAGAGACAAGATTATAGTCAATGATCGGCAGTTGGCTTGTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCGAATCGCTTCCCCAGAGGGTCAAGACTATCTGAAGGGAATGGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115981 TCGAATCGCTTCCCCAGAGGGTCAAGACTATCTGAAGGGAATGGCAGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGGGAACTATGCCTGGGTCAACCGCTCTTCCATGACCTTCTTAACCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116031 CTGGGAACTATGCCTGGGTCAACCGCTCTTCCATGACCTTCTTAACCCGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAG         GCTTTCGCCAAGGTCTTCAACACAACCCCTGATGACTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116081 CAGGTA...TAGGCTTTCGCCAAGGTCTTCAACACAACCCCTGATGACTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGACCTACATGTGATCTATGATGTTTCTCACAACATTGCCAAAGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116981 GGACCTACATGTGATCTATGATGTTTCTCACAACATTGCCAAAGTGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCATGTGGTGGACGGAAAGGAACGGACACTGTTAGTACACAGGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117031 AGCATGTGGTGGACGGAAAGGAACGGACACTGTTAGTACACAGGAAGGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCCACCCGCGCTTTCCCTCCTCACCATCCCCTCATTGCTGTTGATTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117081 TCCACCCGCGCTTTCCCTCCTCACCATCCCCTCATTGCTGTTGATTACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 A         CTCACTGGACAGCCAGTGCTCATTGGTGGCACCATGGGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117131 AGTA...CAGCTCACTGGACAGCCAGTGCTCATTGGTGGCACCATGGGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCTGTAGTTATGTTCTTACTGGCACTGAACAGGGCATGACTGAGACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118195 CCTGTAGTTATGTTCTTACTGGCACTGAACAGGGCATGACTGAGACCTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GGAACAACCTGTCATGGAGCG         GGCCGTGCATTGTCCCGAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 118245 GGAACAACCTGTCATGGAGCGGTA...TAGGGCCGTGCATTGTCCCGAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AAAATCTCGACGTAATTTAGATTTCCAGGATGTCTTAGACAAATTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119818 AAAATCTCGACGTAATTTAGATTTCCAGGATGTCTTAGACAAATTGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATATGGGAATTGCGATCCGTGTTGCCTCACCCAAACTGGTTATGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119868 ATATGGGAATTGCGATCCGTGTTGCCTCACCCAAACTGGTTATGGAAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411          GCTCCTGAGTCCTATAAGAATGTGACAGATGTGGTAAATAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119918 GTA...CAGGCTCCTGAGTCCTATAAGAATGTGACAGATGTGGTAAATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CTGCCATGATGCTGGAATCAGCAAGAAAGCCATTAAACTGAGACCAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124099 CTGCCATGATGCTGGAATCAGCAAGAAAGCCATTAAACTGAGACCAATTG

   1600     .    :
   1502 CTGTGATCAAAGGA
        ||||||||||||||
 124149 CTGTGATCAAAGGA