seq1 = pF1KE0332.tfa, 1878 bp
seq2 = pF1KE0332/gi568815594r_163371857.tfa (gi568815594r:163371857_163573734), 201878 bp

>pF1KE0332 1878
>gi568815594r:163371857_163573734 (Chr4)

(complement)

1-1878  (100001-101878)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCCAACGACGCCAAGCCCGACGTGAAGACCGTGCAGGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCCAACGACGCCAAGCCCGACGTGAAGACCGTGCAGGTGCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACACAGCCAACCGCCTGCGGATCCATTCCATCAGGGCCACGTGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACACAGCCAACCGCCTGCGGATCCATTCCATCAGGGCCACGTGTGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGTTCTGGCCAGCTCACGTCGTGCTGCAGTGCAGCGGAGGTCGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGTTCTGGCCAGCTCACGTCGTGCTGCAGTGCAGCGGAGGTCGTGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCTCTTCTTCCACACGATGAAGTATAAACAGACAGACCCAGAACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCTCTTCTTCCACACGATGAAGTATAAACAGACAGACCCAGAACACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACAACGACCGGTTCATCCTCTCCAGGGGACATGCTGCTCCTATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACAACGACCGGTTCATCCTCTCCAGGGGACATGCTGCTCCTATCCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGCTGCTTGGGTGGAGGTGGGTGACATCAGTGAATCTGACTTGCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGCTGCTTGGGTGGAGGTGGGTGACATCAGTGAATCTGACTTGCTGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAGGAAACTTCACAGCGACTTGGAGAGACACCCTACCCCGCGATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100301 CTGAGGAAACTTCACAGCGACTTGGAGAGACACCCTACCCCCCGATTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTTGTTGACGTGGCAACAGGGTCCCTAGGTCAGGGATTAGGTACTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTTGTTGACGTGGCAACAGGGTCCCTAGGTCAGGGATTAGGTACTGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGGAATGGCTTATACTGGCAAGTACCTTGACAAGGCCAGCTACCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGGAATGGCTTATACTGGCAAGTACCTTGACAAGGCCAGCTACCGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCTGCCTTATGGGAGATGGCGAATCCTCAGAAGGCTCTGTGTGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCTGCCTTATGGGAGATGGCGAATCCTCAGAAGGCTCTGTGTGGGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTTGCTTTTGCCTCCCACTACAACTTGGACAATCTCGTGGCGGTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTTGCTTTTGCCTCCCACTACAACTTGGACAATCTCGTGGCGGTCTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGTGAACCGCTTGGGACAAAGTGGCCCTGCACCCCTTGAGCATGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGTGAACCGCTTGGGACAAAGTGGCCCTGCACCCCTTGAGCATGGCGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACATCTACCAGAATTGCTGTGAAGCCTTTGGATGGAATACTTACTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACATCTACCAGAATTGCTGTGAAGCCTTTGGATGGAATACTTACTTAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGATGGCCATGATGTGGAGGCCTTGTGCCAAGCATTTTGGCAAGCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGATGGCCATGATGTGGAGGCCTTGTGCCAAGCATTTTGGCAAGCAAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGTGAAGAACAAGCCTACTGCTATAGTTGCCAAGACCTTCAAAGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGTGAAGAACAAGCCTACTGCTATAGTTGCCAAGACCTTCAAAGGTCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTATTCCAAATATTGAGGATGCAGAAAATTGGCATGGAAAGCCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTATTCCAAATATTGAGGATGCAGAAAATTGGCATGGAAAGCCAGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAAGAAAGAGCAGATGCAATTGTCAAATTAATTGAGAGTCAGATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAAGAAAGAGCAGATGCAATTGTCAAATTAATTGAGAGTCAGATACAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAATGAGAATCTCATACCAAAATCGCCTGTGGAAGACTCACCTCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAATGAGAATCTCATACCAAAATCGCCTGTGGAAGACTCACCTCAAATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCATCACAGATATAAAAATGACCTCCCCACCTGCTTACAAAGTTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCATCACAGATATAAAAATGACCTCCCCACCTGCTTACAAAGTTGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAGATAGCTACTCAGAAAACATATGGTTTGGCTCTGGCTAAACTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAGATAGCTACTCAGAAAACATATGGTTTGGCTCTGGCTAAACTGGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTGCAAATGAAAGAGTTATTGTTCTGAGTGGTGACACGATGAACTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTGCAAATGAAAGAGTTATTGTTCTGAGTGGTGACACGATGAACTCCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTTCTGAGATATTCAGGAAAGAACACCCTGAGCGTTTCATAGAGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTTCTGAGATATTCAGGAAAGAACACCCTGAGCGTTTCATAGAGTGTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TATTGCTGAACAAAACATGGTAAGTGTGGCACTAGGCTGTGCTACACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TATTGCTGAACAAAACATGGTAAGTGTGGCACTAGGCTGTGCTACACGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTCGAACCATTGCTTTTGCTGGTGCTTTTGCTGCCTTTTTTACTAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTCGAACCATTGCTTTTGCTGGTGCTTTTGCTGCCTTTTTTACTAGAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTCGATCAGCTCCGAATGGGAGCCATTTCTCAAGCCAATATCAACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTCGATCAGCTCCGAATGGGAGCCATTTCTCAAGCCAATATCAACCTTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGTTCCCACTGTGGGGTATCCACTGGAGAAGATGGAGTCTCCCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGTTCCCACTGTGGGGTATCCACTGGAGAAGATGGAGTCTCCCAGATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCCTGGAGGATCTAGCCATGTTCCGAAGCATTCCCAATTGTACTGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCCTGGAGGATCTAGCCATGTTCCGAAGCATTCCCAATTGTACTGTTTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TATCCAAGTGATGCCATCTCGACAGAGCATGCTATTTATCTAGCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TATCCAAGTGATGCCATCTCGACAGAGCATGCTATTTATCTAGCCGCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TACCAAGGGAATGTGCTTCATTCGAACCAGCCAACCAGAAACTGCAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TACCAAGGGAATGTGCTTCATTCGAACCAGCCAACCAGAAACTGCAGTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TTTATACCCCACAAGAAAATTTTGAGATTGGCCAGGCCAAGGTGGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TTTATACCCCACAAGAAAATTTTGAGATTGGCCAGGCCAAGGTGGTCCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CACGGTGTCAATGATAAAGTCACAGTAATTGGAGCTGGAGTTACTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CACGGTGTCAATGATAAAGTCACAGTAATTGGAGCTGGAGTTACTCTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TGAAGCCTTAGAAGCTGCTGACCATCTTTCTCAACAAGGTATTTCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TGAAGCCTTAGAAGCTGCTGACCATCTTTCTCAACAAGGTATTTCTGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GTGTCATCGACCCATTTACCATTAAACCCCTGGATGCCGCCACCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GTGTCATCGACCCATTTACCATTAAACCCCTGGATGCCGCCACCATCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TCCAGTGCAAAAGCCACAGGCGGCCGAGTTATCACAGTGGAGGATCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TCCAGTGCAAAAGCCACAGGCGGCCGAGTTATCACAGTGGAGGATCACTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CAGGGAAGGTGGCATTGGAGAAGCTGTTTGTGCAGCTGTCTCCAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CAGGGAAGGTGGCATTGGAGAAGCTGTTTGTGCAGCTGTCTCCAGGGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CTGATATCCTTGTTCATCAACTGGCAGTGTCAGGAGTGCCTCAACGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CTGATATCCTTGTTCATCAACTGGCAGTGTCAGGAGTGCCTCAACGTGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AAAACTAGTGAATTGCTGGATATGTTTGGAATCAGTACCAGACACATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AAAACTAGTGAATTGCTGGATATGTTTGGAATCAGTACCAGACACATTAT

   1850     .    :    .    :    .
   1851 AGCAGCCGTAACACTTACTTTAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGCAGCCGTAACACTTACTTTAATGAAG