seq1 = pF1KE0323.tfa, 2532 bp
seq2 = pF1KE0323/gi568815595r_63999054.tfa (gi568815595r:63999054_64298927), 299874 bp

>pF1KE0323 2532
>gi568815595r:63999054_64298927 (Chr3)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-258  (135799-135912)   100% ->
259-396  (138851-138988)   100% ->
397-600  (141563-141766)   99% ->
601-787  (145560-145746)   100% ->
788-1660  (151226-152098)   99% ->
1661-2532  (199003-199874)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACAGTGATGCCGCTGGAGATGGAGAAGACCATCAGCAAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGACAGTGATGCCGCTGGAGATGGAGAAGACCATCAGCAAACTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTGACTTTCAGAGGAACTCGACCTCAGATGATGACTCAGGCTGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTGACTTTCAGAGGAACTCGACCTCAGATGATGACTCAGGCTGTGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAAGAGTATGCCTGGGTCCCGCCGGGTCTGAAGCCTGAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 TGGAAGAGTATGCCTGGGTCCCGCCGGGTCTGAAGCCTGAACAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    GTACACCAGTACTATAGCTGTCTCCCAGAAGAGAAAGTCCCTTATGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135796 CAGGTACACCAGTACTATAGCTGTCTCCCAGAAGAGAAAGTCCCTTATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACAGTCCTGGAGAGAAACTGCGAATCAAGCAGCTACTACACCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135846 CAACAGTCCTGGAGAGAAACTGCGAATCAAGCAGCTACTACACCAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCCACATGACAATGAG         GTTCGATATTGCAACTCCCTGGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135896 CGCCACATGACAATGAGGTA...CAGGTTCGATATTGCAACTCCCTGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAAGAGAAGAGGGAGCTGAAGCTTTTCAGCAGCCAGAGGAAACGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138875 GAGGAAGAGAAGAGGGAGCTGAAGCTTTTCAGCAGCCAGAGGAAACGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAACTTGGGCCGCGGGAATGTCAGGCCTTTCCCAGTCACCATGACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138925 AAACTTGGGCCGCGGGAATGTCAGGCCTTTCCCAGTCACCATGACAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTATTTGTGAACAG         TGCGGAGGCCAGATCAATGGTGGAGAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 138975 CTATTTGTGAACAGGTA...CAGTGCGGAGGCCAGATCAATGGTGGAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCGCTGTGTTTGCGTCACGCGCTGGCCACGGCGTTTGCTGGCACCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141590 ATCGCTGTGTTTGCGTCACGCGCTGGCCACGGCGTTTGCTGGCACCCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGCTTCGTACGCACTGTCTGCAATGAGCTCCTGGTGGATCTGATCTACT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141640 GTGCTTCGTATGCACTGTCTGCAATGAGCTCCTGGTGGATCTGATCTACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTACCAAGATGGGAAGATATACTGTGGCAGGCACCATGCTGAGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141690 TTTACCAAGATGGGAAGATATACTGTGGCAGGCACCATGCTGAGTGCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGCCGCGCTGTGCTGCCTGCGATGAG         ATCATCTTTGCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 141740 AAGCCGCGCTGTGCTGCCTGCGATGAGGTT...CAGATCATCTTTGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAATGCACAGAAGCTGAGGGGCGACACTGGCACATGAAACACTTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145574 TGAATGCACAGAAGCTGAGGGGCGACACTGGCACATGAAACACTTTTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCTTCGAGTGTGAGACAGTGCTGGGCGGCCAGCGCTACATCATGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145624 GCTTCGAGTGTGAGACAGTGCTGGGCGGCCAGCGCTACATCATGAAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGAAGACCCTACTGTTGCCACTGCTTCGAGTCCTTGTATGCAGAATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145674 GGAAGACCCTACTGTTGCCACTGCTTCGAGTCCTTGTATGCAGAATATTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGACACCTGTGCCCAACATATAG         GTATCGACCAAGGTCAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 145724 TGACACCTGTGCCCAACATATAGGTG...TAGGTATCGACCAAGGTCAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGACCTATGACGGCCAACACTGGCATGCCACTGAGACCTGTTTCTGCTGT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151244 TGACCTATGATGGCCAACACTGGCATGCCACTGAGACCTGTTTCTGCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCTCACTGCAAGAAATCCCTCCTGGGGCGGCCATTCCTCCCGAAGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151294 GCTCACTGCAAGAAATCCCTCCTGGGGCGGCCATTCCTCCCGAAGCAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCAGATATTCTGCTCACGGGCCTGCAGTGCTGGGGAAGACCCCAATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151344 CCAGATATTCTGCTCACGGGCCTGCAGTGCTGGGGAAGACCCCAATGGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGACTCCTCTGATTCCGCCTTCCAGAACGCCAGGGCCAAGGAGTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151394 CTGACTCCTCTGATTCCGCCTTCCAGAACGCCAGGGCCAAGGAGTCCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CGCAGTGCCAAAATTGGCAAGAACAAGGGCAAGACGGAGGAGCCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151444 CGCAGTGCCAAAATTGGCAAGAACAAGGGCAAGACGGAGGAGCCCATGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GAACCAGCACAGCCAGCTGCAAGTGAGTTCTAACCGGCTGTCAGCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151494 GAACCAGCACAGCCAGCTGCAAGTGAGTTCTAACCGGCTGTCAGCCGACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TAGACCCCCTGTCACTGCAGATGGACATGCTCAGCCTGTCCAGCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151544 TAGACCCCCTGTCACTGCAGATGGACATGCTCAGCCTGTCCAGCCAGACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CCCAGCCTCAACCGGGACCCCATCTGGAGGAGCCGGGAAGAGCCCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151594 CCCAGCCTCAACCGGGACCCCATCTGGAGGAGCCGGGAAGAGCCCTACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTATGGGAACAAGATGGAGCAGAACCAGACCCAGAGCCCTCTGCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151644 TTATGGGAACAAGATGGAGCAGAACCAGACCCAGAGCCCTCTGCAGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCAGCCAGTGCAACATCAGAACTTCCTACAGTCCAGGAGGGCAAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151694 TCAGCCAGTGCAACATCAGAACTTCCTACAGTCCAGGAGGGCAAGGGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GGGGCCCAGCCCGAAATGTGGGGCAAGCACTTCAGCAACCCCAAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151744 GGGGCCCAGCCCGAAATGTGGGGCAAGCACTTCAGCAACCCCAAAAGGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTCGTCACTGGCCATGACAGGACATGCTGGCAGCTTCATCAAGGAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151794 CTCGTCACTGGCCATGACAGGACATGCTGGCAGCTTCATCAAGGAATGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GAGAAGACTATTACCCGGGGAGGCTGAGATCTCAGGAGAGCTACAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151844 GAGAAGACTATTACCCGGGGAGGCTGAGATCTCAGGAGAGCTACAGTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 ATGTCTAGTCAGAGTTTCAGTGAGACCCGAGGCAGCATCCAAGTCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151894 ATGTCTAGTCAGAGTTTCAGTGAGACCCGAGGCAGCATCCAAGTCCCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 ATATGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAGGGGGCTTGTCCACTCAGCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151944 ATATGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAGGGGGCTTGTCCACTCAGCAGTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GGACCCGTCATCCCATCAGTTCCCTGAAATACACAGAGGACATGACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151994 GGACCCGTCATCCCATCAGTTCCCTGAAATACACAGAGGACATGACGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ACAGAGCAGACCCCTCGGGGCTCCATGGAATCCCTGGCCCTGTCTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152044 ACAGAGCAGACCCCTCGGGGCTCCATGGAATCCCTGGCCCTGTCTAATGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 AACAG         GCCTCTCTGCTGATGGTGGTGCCAAGCGCCAGGAGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152094 AACAGGTA...CAGGCCTCTCTGCTGATGGTGGTGCCAAGCGCCAGGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 ACCTATCCCGATTTTCCATGCCTGACCTCAGCAAAGACTCTGGAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199039 ACCTATCCCGATTTTCCATGCCTGACCTCAGCAAAGACTCTGGAATGAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GTGTCTGAGAAGCTGAGCAACATGGGCACTCTTAACTCGTCCATGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199089 GTGTCTGAGAAGCTGAGCAACATGGGCACTCTTAACTCGTCCATGCAGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CCGGAGCGCAGAGTCAGTTCGCAGCCTGCTCTCTGCCCAGCAGTACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199139 CCGGAGCGCAGAGTCAGTTCGCAGCCTGCTCTCTGCCCAGCAGTACCAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 AGATGGAGGGAAACCTCCACCAGCTCAGCAACCCCATTGGCTACAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199189 AGATGGAGGGAAACCTCCACCAGCTCAGCAACCCCATTGGCTACAGAGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 CTGCAGTCCCACGGAAGGATGCATCAGAGCTTTGATTTTGATGGAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199239 CTGCAGTCCCACGGAAGGATGCATCAGAGCTTTGATTTTGATGGAGGGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 GGCGGGCAGCAAGCTGCCAGGGCAGGAGGGCGTGAGGATCCAGCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199289 GGCGGGCAGCAAGCTGCCAGGGCAGGAGGGCGTGAGGATCCAGCCCATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 GTGAACGCACCCGGAGAAGAGCTACTTCACGCGACGACAACCGCCGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199339 GTGAACGCACCCGGAGAAGAGCTACTTCACGCGACGACAACCGCCGTTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 CGACCTCACAGGTCCAGGCGTTCCCGACGCTCTCGCTCCGACAACGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199389 CGACCTCACAGGTCCAGGCGTTCCCGACGCTCTCGCTCCGACAACGCCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 CCACCTGGCCAGCGAACGCGAGGCCATCTCCCGGTTAAAAGATAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199439 CCACCTGGCCAGCGAACGCGAGGCCATCTCCCGGTTAAAAGATAGGCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 CTCTGAGAGCCAGGGAGGACTATGACCAATTTATGCGCCAGCGGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199489 CTCTGAGAGCCAGGGAGGACTATGACCAATTTATGCGCCAGCGGAGCTTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 CAGGAGAGCATGGGGCATGGGTCCCGGAGGGACCTGTACGGCCAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199539 CAGGAGAGCATGGGGCATGGGTCCCGGAGGGACCTGTACGGCCAGTGCCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 TAGGACTGTGTCGGACCTGGCTTTGCAGAATGCCTTTGGGGACCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199589 TAGGACTGTGTCGGACCTGGCTTTGCAGAATGCCTTTGGGGACCGCTGGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 GACCCTACTTCGCCGAGTATGATTGGTGTTCCACCTGCTCCTCCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199639 GACCCTACTTCGCCGAGTATGATTGGTGTTCCACCTGCTCCTCCTCTTCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 GAGTCTGACAACGAGGGCTATTTCCTAGGAGAACCCATCCCCCAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199689 GAGTCTGACAACGAGGGCTATTTCCTAGGAGAACCCATCCCCCAGCCAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2397 GCGCCTGCGATACGTCACAAGCGATGAGCTGCTGCACAAATACAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199739 GCGCCTGCGATACGTCACAAGCGATGAGCTGCTGCACAAATACAGCTCCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 ACGGCCTCCCCAAATCTTCCACATTAGGTGGCAGAGGACAGTTGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199789 ACGGCCTCCCCAAATCTTCCACATTAGGTGGCAGAGGACAGTTGCACAGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .
   2497 AGGAAAAGACAGAAGAGCAAAAACTGTATCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199839 AGGAAAAGACAGAAGAGCAAAAACTGTATCATTTCT