seq1 = pF1KE0322.tfa, 1740 bp
seq2 = pF1KE0322/gi568815591r_100055014.tfa (gi568815591r:100055014_100258499), 203486 bp

>pF1KE0322 1740
>gi568815591r:100055014_100258499 (Chr7)

(complement)

1-411  (100001-100411)   100% ->
412-507  (100562-100657)   100% ->
508-637  (100738-100867)   100% ->
638-724  (101041-101127)   100% ->
725-845  (101286-101406)   100% ->
846-993  (101508-101655)   100% ->
994-1076  (101784-101866)   100% ->
1077-1240  (101951-102114)   100% ->
1241-1395  (102675-102829)   100% ->
1396-1589  (103045-103238)   100% ->
1590-1740  (103336-103486)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCCCAGTGCGACTACTCGATGTACTTCCCGGCCGTGCCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTCCCAGTGCGACTACTCGATGTACTTCCCGGCCGTGCCGCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCGCGCGGAGCTGGCAGGGGATCCGGGCCGGTACCGGGCGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCGCGCGGAGCTGGCAGGGGATCCGGGCCGGTACCGGGCGCTGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCGCAACCATCTGTACTTGGGGGAGACTGTCCGTTTTCTGCTGGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCGCAACCATCTGTACTTGGGGGAGACTGTCCGTTTTCTGCTGGTGTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCCGGGGCGGTGCGGGGTCCGGCACCGGGGGCGGCCCGGGCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTGCCGGGGCGGTGCGGGGTCCGGCACCGGGGGCGGCCCGGGCTTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCAGAGGAGCCTGGGCAGAACTGGCAACCGCCCTGGCCGCCCTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCAGAGGAGCCTGGGCAGAACTGGCAACCGCCCTGGCCGCCCTGGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGTCAGCGCCGGAGGCGGGATGCCGGGGGGCGGCGGCGCCGGCGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGTCAGCGCCGGAGGCGGGATGCCGGGGGGCGGCGGCGCCGGCGACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATTCGGAGCCCCCAGGGGGAGGGGATCCTGGGGGTGGGGGTTTGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATTCGGAGCCCCCAGGGGGAGGGGATCCTGGGGGTGGGGGTTTGTTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGGCTGCAGCCCCCTTCTCACCCACGGCCCGGGCCCTGCTACCTCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGGCTGCAGCCCCCTTCTCACCCACGGCCCGGGCCCTGCTACCTCAGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGCGACCACG         CTGCCTGTGGAGGAACCGATTGTGTCCACA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGCGACCACGGTG...CAGCTGCCTGTGGAGGAACCGATTGTGTCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GATGAGGTCATCTTCCCACTCACCGTTTCACTGGATAGACTGCCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 GATGAGGTCATCTTCCCACTCACCGTTTCACTGGATAGACTGCCCCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GACACCTAAGGCCAAG         ATTGTAGTGACTGTGTGGAAGCGGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100642 GACACCTAAGGCCAAGGTA...CAGATTGTAGTGACTGTGTGGAAGCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATTGAGGCACCAGAGGTCAGAGATCAAGGCTACCTGCGATTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100763 AGATTGAGGCACCAGAGGTCAGAGATCAAGGCTACCTGCGATTGCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCCGATCTCCTGGGGAGACATTCCGGGGCGAGCAGAGCGCTTTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100813 ACCCGATCTCCTGGGGAGACATTCCGGGGCGAGCAGAGCGCTTTCAAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAAG         TGAGCACGCTGCTGACTCTGCTGCCCCCTCCGGTTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100863 CCAAGGTG...CAGTGAGCACGCTGCTGACTCTGCTGCCCCCTCCGGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGAGATGCCGGCAGTTCACTGTGGCTGGAAAACACTTGACCGTGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101077 TGAGATGCCGGCAGTTCACTGTGGCTGGAAAACACTTGACCGTGCTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 G         TGCTGAACAGCTCCTCTCAGGAGGAAATCTCCATCTGGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101127 GGTA...CAGTGCTGAACAGCTCCTCTCAGGAGGAAATCTCCATCTGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATCCGAATCCTCCCCAACTTCAACGCCAGTTATCTACCTGTCATGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101326 TATCCGAATCCTCCCCAACTTCAACGCCAGTTATCTACCTGTCATGCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGGCTCTGTGCTGCTGGTGGACAATGTCTG         TCACCAGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101376 ATGGCTCTGTGCTGCTGGTGGACAATGTCTGGTG...TAGTCACCAGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGGGAAGTCTCCATGGGCTCCTTCTGCCGCCTACCCGGGACCTCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101518 GGGGAAGTCTCCATGGGCTCCTTCTGCCGCCTACCCGGGACCTCTGGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTCCCCTGCCCGCTGAATGCCCTGGAGGAACACAACTTCCTGTTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101568 CTTCCCCTGCCCGCTGAATGCCCTGGAGGAACACAACTTCCTGTTTCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGAGAGGGGGTGAGCAGCCCCCTCCAGGGGCCAAGGAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101618 TGAGAGGGGGTGAGCAGCCCCCTCCAGGGGCCAAGGAGGTG...CAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGGAAGTTCCCCTGATTGCTGTGGTTCAGTGGTCTACCCCAAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 CTGGAAGTTCCCCTGATTGCTGTGGTTCAGTGGTCTACCCCAAAGCTGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTTCACTCAGAGCATCTACACCCACTACCG         CCTGCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101837 CTTCACTCAGAGCATCTACACCCACTACCGGTG...TAGCCTGCCCAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCGCTTGGACCGCCCGTGTTTTGTGATGACCGCTTCTTGTAAGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101962 TCCGCTTGGACCGCCCGTGTTTTGTGATGACCGCTTCTTGTAAGTCCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTCGGACCTACGAGCGTTTCACTGTCACCTACACGCTGCTTAACAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 GTTCGGACCTACGAGCGTTTCACTGTCACCTACACGCTGCTTAACAATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCAAGACTTCCTTGCTGTGAGGCTCGTGTGGACCCCAGAGCATGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102062 CCAAGACTTCCTTGCTGTGAGGCTCGTGTGGACCCCAGAGCATGCACAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTG         GAAAGCAGCTGTGTGAGGAGGAGCGCCGGGCCATGCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 CTGGTA...CAGGAAAGCAGCTGTGTGAGGAGGAGCGCCGGGCCATGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTGCCCTGGACTCCGTCGTCTGCCACACGCCCCTCAACAACCTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102713 GCTGCCCTGGACTCCGTCGTCTGCCACACGCCCCTCAACAACCTTGGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTCCCGGAAGGGCAGCGCGCTCACCTTCAGTGTGGCCTTCCAGGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102763 TTCCCGGAAGGGCAGCGCGCTCACCTTCAGTGTGGCCTTCCAGGCTCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GGACGGGGCTCTTCGAG         CTAAGCCAGCACATGAAACTGAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102813 GGACGGGGCTCTTCGAGGTG...CAGCTAAGCCAGCACATGAAACTGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CTGCAGTTCACCGCCAGCGTGTCCCACCCTCCACCCGAGGCCCGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103069 CTGCAGTTCACCGCCAGCGTGTCCCACCCTCCACCCGAGGCCCGGCCCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCCCGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCCCTGCTGTCCGGGACTTGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103119 CTCCCGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCCCTGCTGTCCGGGACTTGGTGGAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GGCATCAGGCTAGCCTGGGCCGCTCCCAGTCCTTCTCCCACCAGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103169 GGCATCAGGCTAGCCTGGGCCGCTCCCAGTCCTTCTCCCACCAGCAGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TCCCGAAGCCACCTCATGAG         GTCGGGCAGTGTGATGGAGCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103219 TCCCGAAGCCACCTCATGAGGTA...CAGGTCGGGCAGTGTGATGGAGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CAGAGCCATCACGCCCCCTGTGGCCTCTCCTGTTGGCCGCCCCCTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103357 CAGAGCCATCACGCCCCCTGTGGCCTCTCCTGTTGGCCGCCCCCTCTACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGCCCCCGGACAAGGCTGTGTTGTCTCTGGACAAGATTGCCAAGCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103407 TGCCCCCGGACAAGGCTGTGTTGTCTCTGGACAAGATTGCCAAGCGCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :
   1711 TGCAAGGTCCTGGTGGTGGAACCCGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 103457 TGCAAGGTCCTGGTGGTGGAACCCGTCAAG