seq1 = pF1KE0308.tfa, 1557 bp
seq2 = pF1KE0308/gi568815594r_158027410.tfa (gi568815594r:158027410_158271375), 243966 bp

>pF1KE0308 1557
>gi568815594r:158027410_158271375 (Chr4)

(complement)

1-910  (100001-100910)   99% ->
911-1125  (115551-115765)   99% ->
1126-1352  (140364-140590)   100% ->
1353-1557  (143762-143966)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCTGTCCAGACAAGCCGGGGCAGCTCATAAACTGGTTCATCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCTGTCCAGACAAGCCGGGGCAGCTCATAAACTGGTTCATCTGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGTGCGTCCCGCGGGTGCGTAAGCTCTGGAGCAGCCGGCGTCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGTGCGTCCCGCGGGTGCGTAAGCTCTGGAGCAGCCGGCGTCCAAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGGAGAAACCTTCTGCTGGGCACTGCGTGTGCCATCTACTTGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGGAGAAACCTTCTGCTGGGCACTGCGTGTGCCATCTACTTGGGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGTGAGCCAGGTGGGGAGGGCCTCTCTCCAGCATGGACAGGCGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGTGAGCCAGGTGGGGAGGGCCTCTCTCCAGCATGGACAGGCGGCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGGGGCCACATCGCAGCCGCGACACCGCCGAGCCATCCTTCCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGGGGCCACATCGCAGCCGCGACACCGCCGAGCCATCCTTCCCTGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACCCCTGGATGGTACCCTGGCCCCTCCAGAGTCCCAGGGCAATGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACCCCTGGATGGTACCCTGGCCCCTCCAGAGTCCCAGGGCAATGGGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTCTGCAGCCCAATGTGGTGTACATTACCCTACGCTCCAAGCGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTCTGCAGCCCAATGTGGTGTACATTACCCTACGCTCCAAGCGCAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGGCCAATATCCGTGGCACTGTGAAGCCCAAGCGCAGGAAAAAGCATG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGGCCAATATCCGTGGCACCGTGAAGCCCAAGCGCAGGAAAAAGCATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTGGCATCGGCTGCCCCAGGGCAGGAGGCTTTGGTCGGACCATCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTGGCATCGGCTGCCCCAGGGCAGGAGGCTTTGGTCGGACCATCCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCCGCAGGAAGCGGCAAGGGAAGCTGATGCTGTAGCACCTGGGTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCCGCAGGAAGCGGCAAGGGAAGCTGATGCTGTAGCACCTGGGTACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCAGGGAGCAAACCTGGTTAAGATTGGAGAGCGACCCTGGAGGTTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCAGGGAGCAAACCTGGTTAAGATTGGAGAGCGACCCTGGAGGTTGGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGGTCCGGGAGTGCGAGCCGGGGGCCCAGACTTCCTGCAGCCCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGGTCCGGGAGTGCGAGCCGGGGGCCCAGACTTCCTGCAGCCCAGCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGGGAGAGCAACATTAGGATCTACAGCGAGAGCGCCCCCTCCTGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGGGAGAGCAACATTAGGATCTACAGCGAGAGCGCCCCCTCCTGGCTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAAGATGACATCCGAAGAATGCGACTCTTGGCGGACAGCGCAGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAAGATGACATCCGAAGAATGCGACTCTTGGCGGACAGCGCAGTGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCTCCGGCCTGTGTCCTCTAGGAGCGGAGCCCGTTTGCTGGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCTCCGGCCTGTGTCCTCTAGGAGCGGAGCCCGTTTGCTGGTGCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGGGCGCACCTGGCGCTGTGCTCCGCTGTGGCCCTAGCCCCTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGGGCGCACCTGGCGCTGTGCTCCGCTGTGGCCCTAGCCCCTGTGGGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTCAAGCAGCCCTTGGACATGAGTGAGGTGTTTGCCTTCCACCTAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTCAAGCAGCCCTTGGACATGAGTGAGGTGTTTGCCTTCCACCTAGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGATCCTGGGGCTCAACAGGACCCTGCCGTCTGTGAGCAGGAAAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGATCCTGGGGCTCAACAGGACCCTGCCGTCTGTGAGCAGGAAAGCAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCATCCAAG         ATGGCCGCCCATGCCCCATCATTCTTTGGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCATCCAAGGTA...TAGATGGCCGCCCATGCCCCATCATTCTTTGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGCATCTTTATCTTCAGCAAGTAATGACACCCATTCTTCTGTTAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115582 TGCATCTTTATCTTCAGCAAGTAATGACACCCATTCTTCTGTTAAGCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCTGGGGAACTTATCAGCAGTTGCTGAAACAGAAATGCTGGCAGAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115632 CCTGGGGAACTTATCAGCAGTTGCTGAAACAGAAATGCTGGCAGAATGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGAGTACCCAAGCCTGAATCAGGTTGTACTGAAATACATCATCATGAGTG
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 115682 CGAGTACCCAAGCCTGAATCGGGTTGTACTGAAATACATCATCATGAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GTCCAAGATGGCACTCTTTGATTTTTTGTTACAG         ATTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115732 GTCCAAGATGGCACTCTTTGATTTTTTGTTACAGGTA...CAGATTTATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATCGCTTAGATACAAATTGCTGTGGATTCAGACCTCGCAAGGAAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140371 ATCGCTTAGATACAAATTGCTGTGGATTCAGACCTCGCAAGGAAGATGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TGTGTACAGAATGGATTGAGGCCAAAATGTGATGACCAAGGTTCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140421 TGTGTACAGAATGGATTGAGGCCAAAATGTGATGACCAAGGTTCTGCGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TCTAGCACACATTATCCAGCGAAAGCATGACCCAAGGCATTTGGTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140471 TCTAGCACACATTATCCAGCGAAAGCATGACCCAAGGCATTTGGTTTTTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TAGACAACAAGGGTTTCTTTGACAGGAGTGAAGATAACTTAAACTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140521 TAGACAACAAGGGTTTCTTTGACAGGAGTGAAGATAACTTAAACTTCAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTGTTAGAAGGCATCAAAGA         GTTTCCAGCTTCTGCAGTTTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 140571 TTGTTAGAAGGCATCAAAGAGTA...CAGGTTTCCAGCTTCTGCAGTTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGTTTTGAAGAGCCAGCACTTACGGCAGAAACTTCTTCAGTCTCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143783 TGTTTTGAAGAGCCAGCACTTACGGCAGAAACTTCTTCAGTCTCTGTTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TTGATAAAGTGTATTGGGAAAGTCAAGGAGGTAGACAAGGAATTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143833 TTGATAAAGTGTATTGGGAAAGTCAAGGAGGTAGACAAGGAATTGAAAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CTTATCGATGTAATAGAACACAGAGCCAAAATTCTTATCACCTATATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143883 CTTATCGATGTAATAGAACACAGAGCCAAAATTCTTATCACCTATATCAA

   1550     .    :    .    :    .    :
   1524 TGCACACGGGGTCAAAGTATTACCTATGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143933 TGCACACGGGGTCAAAGTATTACCTATGAATGAA