seq1 = pF1KE0301.tfa, 1527 bp
seq2 = pF1KE0301/gi568815588f_22245721.tfa (gi568815588f:22245721_22516685), 270965 bp

>pF1KE0301 1527
>gi568815588f:22245721_22516685 (Chr10)

1-25  (99892-99916)   100% ->
26-121  (100003-100098)   100% ->
122-288  (119133-119299)   100% ->
289-472  (122775-122958)   100% ->
473-678  (141034-141239)   100% ->
679-852  (142103-142276)   100% ->
853-1005  (143440-143592)   100% ->
1006-1197  (146009-146200)   100% ->
1198-1314  (155441-155557)   100% ->
1315-1460  (165311-165456)   100% ->
1461-1527  (170899-170965)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCAGAGGCAGGTGCTGCAAG         TGTTCGAGCAATACCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  99892 ATGAGTCAGAGGCAGGTGCTGCAAGGTA...CAGTGTTCGAGCAATACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAAGGCCAGGACCCAGTTCGTGCAGATGGTGGCGGAGCTGGCGACTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GAAGGCCAGGACCCAGTTCGTGCAGATGGTGGCGGAGCTGGCGACTAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCAAAACATCGAGACGCTGCAGAACGCGG         GTGTAATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100069 CCCAAAACATCGAGACGCTGCAGAACGCGGGTG...CAGGTGTAATGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTGCTGAGAACTCTTCTTCTGGACGTGGTCCCAACAATTCAACAGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119144 TTGCTGAGAACTCTTCTTCTGGACGTGGTCCCAACAATTCAACAGACTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTTTGGCTCTTGGGAGACTGGCCAATTATAATGATGACCTAGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119194 TGCTTTGGCTCTTGGGAGACTGGCCAATTATAATGATGACCTAGCAGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGTTGTGAAGTGCGACATTCTTCCACAGCTTGTTTATTCATTGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119244 CTGTTGTGAAGTGCGACATTCTTCCACAGCTTGTTTATTCATTGGCAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGAAT         CGCTTCTACAAGAAAGCAGCTGCCTTTGTGTTACG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119294 CAGAATGTA...TAGCGCTTCTACAAGAAAGCAGCTGCCTTTGTGTTACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCAGTTGGTAAACATTCTCCCCAGCTAGCTCAGGCAATAGTCGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122810 AGCAGTTGGTAAACATTCTCCCCAGCTAGCTCAGGCAATAGTCGATTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGCACTGGATACGCTGGTCATATGCTTGGAAGATTTTGACCCTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122860 GAGCACTGGATACGCTGGTCATATGCTTGGAAGATTTTGACCCTGGAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGAGGCTGCAGCCTGGGCACTTAGATATATTGCAAGACATAATGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122910 AAGGAGGCTGCAGCCTGGGCACTTAGATATATTGCAAGACATAATGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473         AACTGTCACAAGCTGTGGTGGATGCAGGAGCTGTTCCTCTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122960 TA...CAGAACTGTCACAAGCTGTGGTGGATGCAGGAGCTGTTCCTCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAGTACTCTGTATCCAGGAGCCAGAAATTGCTTTGAAAAGGATTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141076 TAGTACTCTGTATCCAGGAGCCAGAAATTGCTTTGAAAAGGATTGCTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCGGCCCTCAGTGATATTGCAAAGCATTCTCCAGAGTTAGCACAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141126 TCGGCCCTCAGTGATATTGCAAAGCATTCTCCAGAGTTAGCACAGACAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGTGGATGCAGGAGCTGTTGCTCATTTAGCCCAGATGATCCTGAACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141176 AGTGGATGCAGGAGCTGTTGCTCATTTAGCCCAGATGATCCTGAACCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGCTAAATTGAAG         CATCAGATCCTTTCAGCTCTCAGTCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 141226 ATGCTAAATTGAAGGTA...CAGCATCAGATCCTTTCAGCTCTCAGTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTTCAAAACATTCCGTGGATCTGGCAGAAATGGTTGTTGAAGCAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142130 GTTTCAAAACATTCCGTGGATCTGGCAGAAATGGTTGTTGAAGCAGAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTTTCCAGTTGTACTTACCTGTCTGAAGGACAAGGATGAATACGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142180 TTTTCCAGTTGTACTTACCTGTCTGAAGGACAAGGATGAATACGTGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAAATGCTTCTACTTTAATTAGAGAGATTGCAAAACATACACCCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142230 AAAATGCTTCTACTTTAATTAGAGAGATTGCAAAACATACACCCGAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    853       CTTTCACAGCTGGTAGTTAACGCAGGAGGGGTTGCTGCCGTGAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142280 ...TAGCTTTCACAGCTGGTAGTTAACGCAGGAGGGGTTGCTGCCGTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGACTGCATTGGGTCCTGCAAAGGGAACACACGGCTGCCTGGCATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143484 TGACTGCATTGGGTCCTGCAAAGGGAACACACGGCTGCCTGGCATCATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGCTTGGTTATGTAGCAGCTCATTCTGAGAACCTAGCAATGGCAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143534 TGCTTGGTTATGTAGCAGCTCATTCTGAGAACCTAGCAATGGCAGTCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATTTCTAAG         GGTGTACCCCAGTTGTCAGTCTGCTTGTCAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 143584 ATTTCTAAGGTT...CAGGGTGTACCCCAGTTGTCAGTCTGCTTGTCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGAACCGGAAGATCATATTAAGGCTGCAGCTGCTTGGGCCTTAGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146041 AGAACCGGAAGATCATATTAAGGCTGCAGCTGCTTGGGCCTTAGGACAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGGAAGACACACTCCTGAACACGCACGGGCTGTTGCAGTCACAAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146091 TTGGAAGACACACTCCTGAACACGCACGGGCTGTTGCAGTCACAAATACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TTGCCAGTTCTGCTTTCTTTGTACATGTCAACAGAAAGTTCTGAGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146141 TTGCCAGTTCTGCTTTCTTTGTACATGTCAACAGAAAGTTCTGAGGATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCAAGTAAAA         AGTAAAAAAGCCATAAAGAATATCCTGCAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 146191 CCAAGTAAAAGTA...TAGAGTAAAAAAGCCATAAAGAATATCCTGCAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AATGTACCTACTTACCAGCCCTTGAACCATTTCTATATGATGCTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155472 AATGTACCTACTTACCAGCCCTTGAACCATTTCTATATGATGCTCCTCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AATATTCTGAAACATGTGGTTGGACAGTTCAGTAAG         GTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 155522 AATATTCTGAAACATGTGGTTGGACAGTTCAGTAAGGTA...AAGGTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCCGCATGATAGCAAAGCTCGACGACTTTTTGTAACAAGTGGTGGCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165316 GCCGCATGATAGCAAAGCTCGACGACTTTTTGTAACAAGTGGTGGCCTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AAAAAGTTCAAGAGATAAAAGCAGAACCTGGTTCTCTCCTTCAAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165366 AAAAAGTTCAAGAGATAAAAGCAGAACCTGGTTCTCTCCTTCAAGAATAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCAACAGTATTAACAGTTGTTACCCCGAGGAAATAGTGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 165416 ATCAACAGTATTAACAGTTGTTACCCCGAGGAAATAGTGAGGTG...CAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GTATTATTCCCCTGGATATTCAGATACACTTCTGCAGAGGGTGGACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170899 GTATTATTCCCCTGGATATTCAGATACACTTCTGCAGAGGGTGGACAGCT

   1600     .    :    .
   1511 ATCAACCACTTAATAAC
        |||||||||||||||||
 170949 ATCAACCACTTAATAAC