seq1 = pF1KE0295.tfa, 708 bp
seq2 = pF1KE0295/gi568815575r_153344723.tfa (gi568815575r:153344723_153545430), 200708 bp

>pF1KE0295 708
>gi568815575r:153344723_153545430 (ChrX)

(complement)

1-708  (100001-100708)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGAGGCACCCCGGGCCGAGACCTTTGTCTTCCTGGACCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGAGGCACCCCGGGCCGAGACCTTTGTCTTCCTGGACCTGGAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGGGCTCCCCAGTGTGGAGCCCGAGATTGCCGAGCTGTCCCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGGGCTCCCCAGTGTGGAGCCCGAGATTGCCGAGCTGTCCCTCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTCCACCGCTCCTCCCTGGAGAACCCGGAGCACGACGAGTCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTCCACCGCTCCTCCCTGGAGAACCCGGAGCACGACGAGTCTGGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGTATTGCCCCGGGTCCTGGACAAGCTCACGCTGTGCATGTGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGTATTGCCCCGGGTCCTGGACAAGCTCACGCTGTGCATGTGCCCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCCCTTCACTGCCAAGGCCAGCGAGATCACCGGCCTGAGCAGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCCCTTCACTGCCAAGGCCAGCGAGATCACCGGCCTGAGCAGTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGGCGCGATGCCGGAAGGCTGGCTTTGATGGCGCCGTGGTGCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGGCGCGATGCCGGAAGGCTGGCTTTGATGGCGCCGTGGTGCGGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCAGGCCTTCCTGAGCCGCCAGGCAGGGCCCATCTGCCTTGTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCAGGCCTTCCTGAGCCGCCAGGCAGGGCCCATCTGCCTTGTGGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATGGCTTTGATTATGATTTCCCCCTGCTGTGTGCCGAGCTGCGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATGGCTTTGATTATGATTTCCCCCTGCTGTGTGCCGAGCTGCGGCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGTGCCCGCCTGCCCCGGGACACTGTCTGCCTGGACACGCTGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGTGCCCGCCTGCCCCGGGACACTGTCTGCCTGGACACGCTGCCGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCGGGGCCTGGACCGCGCCCACAGCCACGGCACCCGGGCCCGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCGGGGCCTGGACCGCGCCCACAGCCACGGCACCCGGGCCCGGGGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGGGTTACAGCCTCGGCAGCCTCTTCCACCGCTACTTCCGGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGGGTTACAGCCTCGGCAGCCTCTTCCACCGCTACTTCCGGGCAGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAAGCGCAGCCCACTCAGCCGAGGGCGACGTGCACACCCTGCTCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAAGCGCAGCCCACTCAGCCGAGGGCGACGTGCACACCCTGCTCCTGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCTGCACCGCGCCGCAGAGCTGCTCGCCTGGGCCGATGAGCAGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCTGCACCGCGCCGCAGAGCTGCTCGCCTGGGCCGATGAGCAGGCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGGTGGGCCCACATCGAGCCCATGTACTTGCCGCCTGATGACCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGGTGGGCCCACATCGAGCCCATGTACTTGCCGCCTGATGACCCCAGCC

    700     .
    701 TGGAGGCC
        ||||||||
 100701 TGGAGGCC