seq1 = pF1KE0289.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0289/gi568815587f_56076618.tfa (gi568815587f:56076618_56277553), 200936 bp

>pF1KE0289 936
>gi568815587f:56076618_56277553 (Chr11)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGATGATAATTTTACAGTTGTCACTGAGTTTATTCTTTTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGATGATAATTTTACAGTTGTCACTGAGTTTATTCTTTTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAGATCATGCTGAACTAAAAGCTGTGCTTTTTGTGGTGTTCCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAGATCATGCTGAACTAAAAGCTGTGCTTTTTGTGGTGTTCCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACGCCATTACCTTGTTGAGGAATCTGGGCATGATCCTCTTAATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACGCCATTACCTTGTTGAGGAATCTGGGCATGATCCTCTTAATCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCACCTCCAAACTCCACACACCCATGTACTTTTTACTCAGCTGTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCACCTCCAAACTCCACACACCCATGTACTTTTTACTCAGCTGTCTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTTGTGGATGCCTGCTATTCATCTGCAATTGCACCCAAAATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTTGTGGATGCCTGCTATTCATCTGCAATTGCACCCAAAATGCTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCCTGGTTGTGAAGGCAACAATTTCTTTCTCTGCTTGCATGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCCTGGTTGTGAAGGCAACAATTTCTTTCTCTGCTTGCATGGTACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATTTGTGTTTCGGAGTGTTCATCACCACAGAAGGCTTCTTACTGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATTTGTGTTTCGGAGTGTTCATCACCACAGAAGGCTTCTTACTGTCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATTGTGAGTCCCTTGCTTTACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATTGTGAGTCCCTTGCTTTACACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGCCATGTCTGATAGAAAGTGTGTGGAGCTTGTCACAGGATCATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGCCATGTCTGATAGAAAGTGTGTGGAGCTTGTCACAGGATCATGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTGGAATAGTTAACACATTAATCCACACAATCAGCTTGAGGAGACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTGGAATAGTTAACACATTAATCCACACAATCAGCTTGAGGAGACTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTTTGTAGGCTAAATGCTGTCAGCCACTTCTTCTGTGACATTCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTTTGTAGGCTAAATGCTGTCAGCCACTTCTTCTGTGACATTCCTTCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTAAAGCTGTCATGTTCTGACACCTCCATGAATGAGTTGTTGCTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTAAAGCTGTCATGTTCTGACACCTCCATGAATGAGTTGTTGCTGTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCTTCTCCGGAGTCATTGCCATGGCCACCTTCTTGACTGTGATCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCTTCTCCGGAGTCATTGCCATGGCCACCTTCTTGACTGTGATCATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACATCTTCATTGCTTTTGCTAGCCTAAGGATCCACTCAGCATCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACATCTTCATTGCTTTTGCTAGCCTAAGGATCCACTCAGCATCAGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACAGCAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTCACCTGACTGCTGTGACCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GACAGCAAGCCTTCTCCACCTGTGCCTCTCACCTGACTGCTGTGACCATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGTACCTTAATCTTTAGCTACATTCAGCCAAGCTCCCAGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGTACCTTAATCTTTAGCTACATTCAGCCAAGCTCCCAGTATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGGAACAAGAGAAAGTGGTTTCTATGTTCTATACGCTAGGGATTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGGAACAAGAGAAAGTGGTTTCTATGTTCTATACGCTAGGGATTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTAAACCTGTTGATACACAGTTTGAGAAACAAGGACGTAAAGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTAAACCTGTTGATACACAGTTTGAGAAACAAGGACGTAAAGGAGGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GTGAAAAGGGCCATAGAAATGAAACATTTCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGAAAAGGGCCATAGAAATGAAACATTTCCTCTGT