seq1 = pF1KE0284.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KE0284/gi568815597r_44121561.tfa (gi568815597r:44121561_44455026), 333466 bp

>pF1KE0284 1011
>gi568815597r:44121561_44455026 (Chr1)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-211  (102102-102177)   100% ->
212-489  (115705-115982)   100% ->
490-606  (135283-135399)   100% ->
607-666  (141799-141858)   100% ->
667-758  (146626-146717)   100% ->
759-831  (170120-170192)   100% ->
832-931  (206989-207088)   100% ->
932-1011  (233387-233466)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACAGCCTCTCCCGCTGCTGACGGGGGGCGGGGGCGGCCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACAGCCTCTCCCGCTGCTGACGGGGGGCGGGGGCGGCCCTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGAGGGCTGGTCTCCTGGCCCCCCGCCCCTCCCCTTACTCTCCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGAGGGCTGGTCTCCTGGCCCCCCGCCCCTCCCCTTACTCTCCCCTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTGGATGGGCCCGAGTTGGGGGCAACACCCCGGG         CATTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CTTGGATGGGCCCGAGTTGGGGGCAACACCCCGGGGTG...CAGCATTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTTTCCAGCTCTCACAGAACCTTCAGCATCCCCAGCTGCCGGTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102108 GGCTTTCCAGCTCTCACAGAACCTTCAGCATCCCCAGCTGCCGGTCTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCTTCGAAGTAAGGAGAG         TTTTAGATGCTTCTGGATGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102158 CATCTTCGAAGTAAGGAGAGGTG...AAGTTTTAGATGCTTCTGGATGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAATGCTAGCACCTTTACAGACTGGAGCAGCTCGATTTTCTTCGTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115726 CAATGCTAGCACCTTTACAGACTGGAGCAGCTCGATTTTCTTCGTATTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTTCAAGAGCAAGAAAAGTGCTGGGCTCCCACTTATTTTCTCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115776 CTTTCAAGAGCAAGAAAAGTGCTGGGCTCCCACTTATTTTCTCCCTGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTCCGGAGTTCTGCTCCATATCCACCAGAAAGCTGGCGGCCCACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115826 TGTTCCGGAGTTCTGCTCCATATCCACCAGAAAGCTGGCGGCCCACGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGGCGCATCCATGGCGGCAATGGTGTCCTTCCCTCCCCAGAGGTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115876 TTGGCGCATCCATGGCGGCAATGGTGTCCTTCCCTCCCCAGAGGTATCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TACTTTTTAGTGCTGGACTTTGAGGCCACGTGCGACAAGCCACAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115926 TACTTTTTAGTGCTGGACTTTGAGGCCACGTGCGACAAGCCACAGATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCCTCAG         GAAATCATCGAGTTCCCCATCCTAAAGCTAAATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115976 TCCTCAGGTA...CAGGAAATCATCGAGTTCCCCATCCTAAAGCTAAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCGGACCATGGAGATTGAGTCTACCTTTCACATGTATGTCCAGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135317 GCCGGACCATGGAGATTGAGTCTACCTTTCACATGTATGTCCAGCCTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCCATCCACAGCTTACCCCATTCTGTACAGAG         CTCACCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 135367 GTCCATCCACAGCTTACCCCATTCTGTACAGAGGTA...CAGCTCACCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATTATTCAAGCCATGGTGGATGGTCAGCCAAGCCTGCAGCAAGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141807 GATTATTCAAGCCATGGTGGATGGTCAGCCAAGCCTGCAGCAAGTGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AG         AGGGTCGATGAATGGATGGCGAAGGAAGGCCTCTTAGAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141857 AGGTA...CAGAGGGTCGATGAATGGATGGCGAAGGAAGGCCTCTTAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCAAACGTCAAGTCAATTTTTGTCACCTGTGGAGACTGGGACTTAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146665 CCAAACGTCAAGTCAATTTTTGTCACCTGTGGAGACTGGGACTTAAAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAT         GCTCCCAGGCCAGTGCCAGTACTTGGGCTTGCCAGTGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146715 CATGTG...TAGGCTCCCAGGCCAGTGCCAGTACTTGGGCTTGCCAGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGGATTACTTCAAGCAGTGGATTAATCTGAAAAAG         GCTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 170158 CGGATTACTTCAAGCAGTGGATTAATCTGAAAAAGGTA...CAGGCTTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGCTTCGCCATGGGCTGCTGGCCCAAGAATGGACTTCTAGACATGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206995 AGCTTCGCCATGGGCTGCTGGCCCAAGAATGGACTTCTAGACATGAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGCCTCAGCCTGCAACACATAGGCCGGCCCCACAGCGGCATTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 207045 GGGCCTCAGCCTGCAACACATAGGCCGGCCCCACAGCGGCATTGGTC...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932    ACGACTGCAAGAACATTGCCAACATCATGAAGACACTCGCCTATCGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233384 TAGACGACTGCAAGAACATTGCCAACATCATGAAGACACTCGCCTATCGA

   1050     .    :    .    :    .    :
    979 GGCTTCATCTTCAAGCAGACATCGAAGCCGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 233434 GGCTTCATCTTCAAGCAGACATCGAAGCCGTTC