seq1 = pF1KE0274.tfa, 327 bp
seq2 = pF1KE0274/gi568815591f_5780890.tfa (gi568815591f:5780890_5983999), 203110 bp

>pF1KE0274 327
>gi568815591f:5780890_5983999 (Chr7)

1-61  (100001-100061)   96% ->
62-194  (101604-101736)   97% ->
195-304  (103001-103110)   100% ->
305-327  (105175-105197)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCATCACGGACGTGCTCAGTGCTGATGACATTGCAGCAGCGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCATCACGGACGTGCTCAGTGCTGACGACATTGCAGCAGCGCTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAATGCCAAG         ACCCAGACACTTTTGAACCCCAAAAATTCT
        |||||||| ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAATGCCGAGGTA...CAGACCCAGACACTTTTGAACCCCAAAAATTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCAGACGTCAGGCCTCTCCAAGATGTCAGCCAGTCAGGTGAAGGATGTT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 101634 TCCAGACATCAGGCCTCTCCAAGATGTCAGCCAATCAGGTGAAGGATGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCCGGTTCATAGACAACGACCAGAGCGGGTATCTGGATGAAGAAGAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101684 TTCCGGTTCATAGACAACGACCAGAGCGGGTACCTGGATGAAGAAGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAA         GTTTTTCCTCCAGAAGTTTGAGAGTGGTGCCAGAGAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101734 TAAGTA...TAGGTTTTTCCTCCAGAAGTTTGAGAGTGGTGCCAGAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGACCGAGTCAGAAACCAAGTCCTTGATGGCTGCGGCGGATAATGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103039 TGACCGAGTCAGAAACCAAGTCCTTGATGGCTGCGGCGGATAATGATGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGGGAAAATTGGAGCAGAGG         AATTCCAGGAAATGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103089 GATGGGAAAATTGGAGCAGAGGGTA...TAGAATTCCAGGAAATGGTGCA

    350 
    324 TTCT
        ||||
 105194 TTCT