seq1 = pF1KE0266.tfa, 1350 bp
seq2 = pF1KE0266/gi568815587r_3566110.tfa (gi568815587r:3566110_3771312), 205203 bp

>pF1KE0266 1350
>gi568815587r:3566110_3771312 (Chr11)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-207  (101372-101517)   100% ->
208-362  (101963-102117)   100% ->
363-895  (103549-104081)   99% ->
896-1350  (104749-105203)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTCCGGAGCCACCACCTCAGCCTGGGCCTTCTGCTTCTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTCCGGAGCCACCACCTCAGCCTGGGCCTTCTGCTTCTGTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCCCTGCAG         AGTGCCTGGGAGCTGAGGGCCGGCTGGCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTCCCTGCAGGTA...CAGAGTGCCTGGGAGCTGAGGGCCGGCTGGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAAGCTGTTCCGTGACCTCTTTGCCAACTACACAAGTGCCCTGAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101402 TCAAGCTGTTCCGTGACCTCTTTGCCAACTACACAAGTGCCCTGAGACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGCAGACACAGACCAGACTCTGAATGTGACCCTGGAGGTGACACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 GTGGCAGACACAGACCAGACTCTGAATGTGACCCTGGAGGTGACACTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGATCATCGACATG         GATGAACGGAACCAGGTGCTGACCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101502 CCAGATCATCGACATGGTG...TAGGATGAACGGAACCAGGTGCTGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTATCTGTGGATACGGCAGGAGTGGACAGATGCCTACCTACGATGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101988 TGTATCTGTGGATACGGCAGGAGTGGACAGATGCCTACCTACGATGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCCAATGCCTATGGTGGCCTGGATGCCATCCGCATCCCCAGCAGTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102038 CCCAATGCCTATGGTGGCCTGGATGCCATCCGCATCCCCAGCAGTCTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGGCGGCCAGACATCGTACTCTATAACAA         AGCCGACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102088 GTGGCGGCCAGACATCGTACTCTATAACAAGTA...CAGAGCCGACGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCTCCAGGTTCCGCCAGCACCAACGTGGTCCTGCGCCACGATGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103560 AGCCTCCAGGTTCCGCCAGCACCAACGTGGTCCTGCGCCACGATGGCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGCGCTGGGACGCGCCGGCCATCACGCGCAGCTCGTGCCGCGTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103610 GTGCGCTGGGACGCGCCGGCCATCACGCGCAGCTCGTGCCGCGTGGATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCAGCCTTCCCGTTCGACGCCCAGCACTGCGGCCTGACGTTCGGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103660 AGCAGCCTTCCCGTTCGACGCCCAGCACTGCGGCCTGACGTTCGGCTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGACTCACGGCGGGCACCAACTGGATGTGCGGCCGCGCGGCGCTGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103710 GGACTCACGGCGGGCACCAACTGGATGTGCGGCCGCGCGGCGCTGCAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCCTGGCGGACTTCGTGGAGAACGTGGAGTGGCGCGTGCTGGGCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103760 AGCCTGGCGGACTTCGTGGAGAACGTGGAGTGGCGCGTGCTGGGCATGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGCGCGGCGGCGCGTGCTCACCTACGGCTGCTGCTCCGAGCCCTACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103810 GGCGCGGCGGCGCGTGCTCACCTACGGCTGCTGCTCCGAGCCCTACCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACGTCACCTTCACGCTGCTGTTGCGCCGCCGCGCCGCCGCCTACGTGTGC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 103860 ACGTCACCTTCACGCTGCTGCTGCGCCGCCGCGCCGCCGCCTACGTGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACCTGCTGCTGCCCTGCGTGCTCATCTCGCTGCTTGCGCCGCTCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103910 AACCTGCTGCTGCCCTGCGTGCTCATCTCGCTGCTTGCGCCGCTCGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCACCTGCCTGCCGACTCAGGCGAGAAGGTGTCGCTGGGCGTCACCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103960 CCACCTGCCTGCCGACTCAGGCGAGAAGGTGTCGCTGGGCGTCACCGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCTGGCGCTCACCGTCTTCCAGTTGCTGCTGGCCGAGAGCATGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104010 TGCTGGCGCTCACCGTCTTCCAGTTGCTGCTGGCCGAGAGCATGCCACCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCCGAGAGCGTGCCGCTCATCG         GGAAGTACTACATGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104060 GCCGAGAGCGTGCCGCTCATCGGTG...CAGGGAAGTACTACATGGCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TATGACCATGGTCACATTCTCAACAGCACTCACCATCCTTATCATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104768 TATGACCATGGTCACATTCTCAACAGCACTCACCATCCTTATCATGAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGCATTACTGTGGTCCCAGTGTCCGCCCAGTGCCAGCCTGGGCTAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104818 TGCATTACTGTGGTCCCAGTGTCCGCCCAGTGCCAGCCTGGGCTAGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTCCTGCTGGGACACCTGGCACGGGGCCTGTGCGTGCGGGAAAGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104868 CTCCTGCTGGGACACCTGGCACGGGGCCTGTGCGTGCGGGAAAGAGGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCCCTGTGGGCAGTCCAGGCCACCTGAGTTATCTCCTAGCCCCCAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104918 GCCCTGTGGGCAGTCCAGGCCACCTGAGTTATCTCCTAGCCCCCAGTCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CTGAAGGAGGGGCTGGCCCCCCAGCGGGCCCTTGCCACGAGCCACGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104968 CTGAAGGAGGGGCTGGCCCCCCAGCGGGCCCTTGCCACGAGCCACGATGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGTGCCGCCAGGAAGCCCTACTGCACCACGTAGCCACCATTGCCAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105018 CTGTGCCGCCAGGAAGCCCTACTGCACCACGTAGCCACCATTGCCAATAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CTTCCGCAGCCACCGAGCTGCCCAGCGCTGCCATGAGGACTGGAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105068 CTTCCGCAGCCACCGAGCTGCCCAGCGCTGCCATGAGGACTGGAAGCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGGCCCGTGTGATGGACCGCTTCTTCCTGGCCATCTTCTTCTCCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105118 TGGCCCGTGTGATGGACCGCTTCTTCCTGGCCATCTTCTTCTCCATGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1315 CTGGTCATGAGCCTCCTGGTGCTGGTGCAGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105168 CTGGTCATGAGCCTCCTGGTGCTGGTGCAGGCCCTG