seq1 = pF1KE0262.tfa, 453 bp
seq2 = pF1KE0262/gi568815597r_183527535.tfa (gi568815597r:183527535_183735659), 208125 bp

>pF1KE0262 453
>gi568815597r:183527535_183735659 (Chr1)

(complement)

1-145  (100001-100145)   99% ->
146-216  (102508-102578)   100% ->
217-393  (105023-105199)   100% ->
394-453  (108066-108125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAAGAACACAGTGTCGTCGGCCCGCTTCCGGAAGGTGGACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAAGAACACAGTGTCGTCGGCCCGCTTCCGGAAGGTGGACGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAATATGACGAGAACAAGTTCGTGGACGAAGAAGATGGGGGCGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAATATGACGAGAACAAGTTCGTGGACGAAGAAGATGGGGGCGACGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCGGGCCCGACGAGGGCGAGGTGGACTCCTGCCTGCGGCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| >>>..
 100101 AGGCCGGGCCCGACGAGGGCGAGGTGGACTCCTGCCTGCGGCAATATC..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GAAACATGACAGCTGCCCTACAGGCAGCTCTGAAGAACCCCCCTAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGGAAACATGACAGCTGCCCTACAGGCAGCTCTGAAGAACCCCCCTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACACCAAGAGTCAGGCAGTGAAG         GACCGGGCAGGCAGCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102554 CAACACCAAGAGTCAGGCAGTGAAGGTG...CAGGACCGGGCAGGCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCTTGAAGGTGCTCATCTCTTTTAAAGCTAATGATATAGAAAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105039 TTGTCTTGAAGGTGCTCATCTCTTTTAAAGCTAATGATATAGAAAAGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCAATCTCTGGACAAGAATGGTGTGGATCTCCTAATGAAGTATATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105089 GTTCAATCTCTGGACAAGAATGGTGTGGATCTCCTAATGAAGTATATTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAAGGATTTGAGAGCCCGTCTGACAATAGCAGTGCTATGTTACTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105139 TAAAGGATTTGAGAGCCCGTCTGACAATAGCAGTGCTATGTTACTGCAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCATGAAAAG         GCACTTGCTGCTGGAGGAGTAGGGTCCATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105189 GGCATGAAAAGGTA...TAGGCACTTGCTGCTGGAGGAGTAGGGTCCATT

    450     .    :    .    :    .    :
    424 GTTCGTGTCTTGACTGCAAGAAAAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 108096 GTTCGTGTCTTGACTGCAAGAAAAACTGTG