seq1 = pF1KE0261.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KE0261/gi568815597r_156495216.tfa (gi568815597r:156495216_156699031), 203816 bp

>pF1KE0261 1125
>gi568815597r:156495216_156699031 (Chr1)

(complement)

1-31  (97593-97623)   100% ->
32-94  (100002-100064)   100% ->
95-168  (100538-100611)   100% ->
169-261  (100713-100805)   100% ->
262-348  (100911-100997)   100% ->
349-440  (102554-102645)   100% ->
441-491  (102901-102951)   100% ->
492-1125  (103183-103816)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCCGCGGAGCGGACCCAGCAATGACG         AGGTCAAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  97593 ATGTTTCCGCGGAGCGGACCCAGCAATGACGGTA...CAGAGGTCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCGTGGGATGAAGTTTGCTGAGGAGCAGCTGCTAAAGCATGGATGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TCGTGGGATGAAGTTTGCTGAGGAGCAGCTGCTAAAGCATGGATGGACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAG         GCAAAGGCCTCGGCCGGAAGGAGAATGGTATCACTCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 AAGGTG...CAGGCAAAGGCCTCGGCCGGAAGGAGAATGGTATCACTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCTCTCAGGGTGACACTGAAGCAAGACACTCATGGG         GTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100576 GCTCTCAGGGTGACACTGAAGCAAGACACTCATGGGGTA...CAGGTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 ACATGACCCTGCCAAGGAGTTCACAAACCACTGGTGGAATGAGCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100718 ACATGACCCTGCCAAGGAGTTCACAAACCACTGGTGGAATGAGCTCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACAAGACTGCGGCCAACTTGGTAGTGGAAACTGGGCAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100768 ACAAGACTGCGGCCAACTTGGTAGTGGAAACTGGGCAGGTA...CAGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GGAGTACAGATAAGGAGCCTTTCTAAGGAGACCACCCGTTATAATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100914 GGAGTACAGATAAGGAGCCTTTCTAAGGAGACCACCCGTTATAATCATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAAGCCCAACTTGCTGTATCAGAAGTTTGTGAAG         ATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100964 CAAGCCCAACTTGCTGTATCAGAAGTTTGTGAAGGTA...TAGATGGCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CATTGACTTCAGGTGGAGAGAAGCCAAACAAAGACTTGGAGAGCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102561 CATTGACTTCAGGTGGAGAGAAGCCAAACAAAGACTTGGAGAGCTGCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GATGACGACAACCAGGGGTCCAAGTCCCCAAAGAT         TCTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102611 GATGACGACAACCAGGGGTCCAAGTCCCCAAAGATGTG...CAGTCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGATGAGATGCTGCTCCAAGCCTGTGAGGGGCGAACAGCACACAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102907 TGATGAGATGCTGCTCCAAGCCTGTGAGGGGCGAACAGCACACAAGTA..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492     GGCTGCCCGTCTTGGGATCACAATGAAGGCCAAGCTTGCTCGCCTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102957 .CAGGGCTGCCCGTCTTGGGATCACAATGAAGGCCAAGCTTGCTCGCCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GAGGCCCAGGAGCAGGCCTTCCTGGCTCGTCTCAAAGGCCAGGACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103229 GAGGCCCAGGAGCAGGCCTTCCTGGCTCGTCTCAAAGGCCAGGACCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGCCCCTCAACTGCAGTCAGAGAGCAAGCCCCCCAAAAAAAAGAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103279 GGCCCCTCAACTGCAGTCAGAGAGCAAGCCCCCCAAAAAAAAGAAAAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AAAGGAGGCAGAAAGAGGAGGAAGAAGCTACAGCATCTGAAAGGAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103329 AAAGGAGGCAGAAAGAGGAGGAAGAAGCTACAGCATCTGAAAGGAATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCAGATGAGAAGCACCCAGAACATGCTGAGCAGAACATCAGAAAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 GCAGATGAGAAGCACCCAGAACATGCTGAGCAGAACATCAGAAAAAGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAGAAGAAAAGGCGACATCAAGAAGGAAAGGTCTCAGATGAAAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 GAAGAAGAAAAGGCGACATCAAGAAGGAAAGGTCTCAGATGAAAGAGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GTACAACTAAAGGGAATGAGAAGGAGGACGCTGCAGGAACAAGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103479 GTACAACTAAAGGGAATGAGAAGGAGGACGCTGCAGGAACAAGTGGGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGGGAATTGAATAGCAGAGAGCAAACCAATCAGTCCCTCAGGAAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103529 GGGGAATTGAATAGCAGAGAGCAAACCAATCAGTCCCTCAGGAAAGGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAAAAGAAGAGGTGGCACCATGAAGAGGAGAAGATGGGGGTCTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103579 GAAAAAGAAGAGGTGGCACCATGAAGAGGAGAAGATGGGGGTCTTGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGGAGGAAAAGGCAAGGAGGCTGCAGGCAGTGTCAGGACAGAGGAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103629 AAGGAGGAAAAGGCAAGGAGGCTGCAGGCAGTGTCAGGACAGAGGAGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGAGCAGGGCATATGCTGACCCATGCAGCCGAAGAAAGAAGAGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103679 GAGAGCAGGGCATATGCTGACCCATGCAGCCGAAGAAAGAAGAGGCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACAGGAGGAGGAGGACTTGAACCTAGAAGATAGAGGTGAGGAAACTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103729 ACAGGAGGAGGAGGACTTGAACCTAGAAGATAGAGGTGAGGAAACTTTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1088 GGTGGTGGAACCAGGGAAGCAGAGAGCAGAGCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103779 GGTGGTGGAACCAGGGAAGCAGAGAGCAGAGCATGCAG