seq1 = pF1KE0250.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KE0250/gi568815582f_23655050.tfa (gi568815582f:23655050_23857580), 202531 bp

>pF1KE0250 588
>gi568815582f:23655050_23857580 (Chr16)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-140  (100612-100684)   100% ->
141-221  (100798-100878)   100% ->
222-352  (101014-101144)   100% ->
353-414  (101339-101400)   100% ->
415-537  (102152-102274)   100% ->
538-588  (102481-102531)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTCGCGCAGCTCCCACGCCGCGGTCATTCCCGACGGGGACAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTCGCGCAGCTCCCACGCCGCGGTCATTCCCGACGGGGACAGTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGGCGAGAGACCGGCT         TCTCCCAAGCCAGCCTGCTCCGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGCGAGAGACCGGCTGTG...CAGTCTCCCAAGCCAGCCTGCTCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACCACCGGTTCCGGGCACTGGACAGGAATAAGAAGGGCTACCTGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100636 TGCACCACCGGTTCCGGGCACTGGACAGGAATAAGAAGGGCTACCTGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141         CCGCATGGATCTCCAGCAGATAGGGGCGCTCGCCGTGAACCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100686 TG...CAGCCGCATGGATCTCCAGCAGATAGGGGCGCTCGCCGTGAACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGGGAGACCGAATTATAGAAAGCTTCTTCCCCGATGG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100840 CCTGGGAGACCGAATTATAGAAAGCTTCTTCCCCGATGGGTG...CAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCAGCGAGTGGATTTCCCAGGCTTTGTCAGGGTCTTGGCTCATTTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101016 GCCAGCGAGTGGATTTCCCAGGCTTTGTCAGGGTCTTGGCTCATTTTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCTGTAGAAGATGAGGACACAGAAACCCAAGACCCCAAGAAACCTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101066 CCTGTAGAAGATGAGGACACAGAAACCCAAGACCCCAAGAAACCTGAACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTCAACAGCAGAAGGAACAAACTTCACT         ATGCATTTCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101116 TCTCAACAGCAGAAGGAACAAACTTCACTGTG...CAGATGCATTTCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCTATGACCTGGATCGCGATGGGAAGATCTCCAGGCATGAGATGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCTATGACCTGGATCGCGATGGGAAGATCTCCAGGCATGAGATGCTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415          GTTCTCCGTCTGATGGTTGGGGTACAGGTGACAGAAGAGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GTT...CAGGTTCTCCGTCTGATGGTTGGGGTACAGGTGACAGAAGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTGGAGAACATCGCTGACCGCACGGTGCAGGAGGCTGATGAAGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102193 GCTGGAGAACATCGCTGACCGCACGGTGCAGGAGGCTGATGAAGATGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATGGGGCTGTGTCCTTCGTGGAGTTCACCAAG         TCCTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102243 ATGGGGCTGTGTCCTTCGTGGAGTTCACCAAGGTC...CAGTCCTTAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAGATGGACGTTGAGCAAAAAATGAGCATCCGGATCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102490 AAGATGGACGTTGAGCAAAAAATGAGCATCCGGATCCTGAAG