seq1 = pF1KE0245.tfa, 720 bp
seq2 = pF1KE0245/gi568815579r_6564929.tfa (gi568815579r:6564929_6770069), 205141 bp

>pF1KE0245 720
>gi568815579r:6564929_6770069 (Chr19)

(complement)

1-219  (100001-100219)   100% ->
220-256  (102621-102657)   100% ->
257-298  (102916-102957)   100% ->
299-720  (104720-105141)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGAGTGTCGTACGGCCCTCAGTGTTTGTGGTGGATGGACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGAGTGTCGTACGGCCCTCAGTGTTTGTGGTGGATGGACAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACATCCCATTCACGAGGCTGGGACGAAGCCACCGGAGACAGTCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACATCCCATTCACGAGGCTGGGACGAAGCCACCGGAGACAGTCGTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGTGGCCCGGGTGGGTCTGGGTCTCTTGCTGTTGCTGATGGGGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGTGGCCCGGGTGGGTCTGGGTCTCTTGCTGTTGCTGATGGGGGCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCGTCCAAGGCTGGTTCCTCCTGCAGCTGCACTGGCGTCTAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCCGTCCAAGGCTGGTTCCTCCTGCAGCTGCACTGGCGTCTAGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGGTCACCCGCCTGCCT         GACGGACCTGCAGGCTCCTGGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100201 GATGGTCACCCGCCTGCCTGTG...CAGGACGGACCTGCAGGCTCCTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCAGCTGATACAAG         AGCGAAGGTCTCACGAGGTCAACCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102643 AGCAGCTGATACAAGGTG...CAGAGCGAAGGTCTCACGAGGTCAACCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGCGCATCTCACAG         GGGCCAACTCCAGCTTGACCGGCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102942 GCAGCGCATCTCACAGGTG...CAGGGGCCAACTCCAGCTTGACCGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGGGGGGCCGCTGTTATGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104745 CGGGGGGCCGCTGTTATGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTCAGCTACCACGATGGGGCCCTTGTGGTCACCAAAGCTGGCTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104795 GCCTCAGCTACCACGATGGGGCCCTTGTGGTCACCAAAGCTGGCTACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGTGTGGGCTGCCCGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104845 TACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGTGTGGGCTGCCCGCTGGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCCAGCACCATCACCCACGGCCTCTACAAGCGCACACCCCGCTACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104895 GGCCAGCACCATCACCCACGGCCTCTACAAGCGCACACCCCGCTACCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGCTGGAGCTGTTGGTCAGCCAGCAGTCACCCTGCGGACGGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 AGGAGCTGGAGCTGTTGGTCAGCCAGCAGTCACCCTGCGGACGGGCCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGCAGCTCCCGGGTCTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGTGGTGTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104995 AGCAGCTCCCGGGTCTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGTGGTGTGGTACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTGGAGGCTGGGGAGAAGGTGGTCGTCCGTGTGCTGGATGAACGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105045 CCTGGAGGCTGGGGAGAAGGTGGTCGTCCGTGTGCTGGATGAACGCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    674 TTCGACTGCGTGATGGTACCCGGTCTTACTTCGGGGCTTTCATGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105095 TTCGACTGCGTGATGGTACCCGGTCTTACTTCGGGGCTTTCATGGTG