seq1 = pF1KE0244.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE0244/gi568815591r_75188120.tfa (gi568815591r:75188120_75316047), 127928 bp

>pF1KE0244 402
>gi568815591r:75188120_75316047 (Chr7)

(complement)

1-35  (18340-18374)   100% ->
36-219  (19922-20107)   98% ->
220-308  (23158-23246)   98% ->
309-402  (27835-27928)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA         TGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  18340 ATGTGGGGTAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAAGTA...CAGTGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
  19928 CACCATTTCTACCTGCCACGTATCGGCGAAGGTTGGGACTCGACTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 TTT GATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA
        |||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19978 TTTTGATCACGATGGGAAAATCATCCAGAAAACCCCCTACCCCCACCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20028 GAGGGACCACAGTCAGCGTGAAGCAGTTATTTTCTACGCTACCTGTGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAG         AAACGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  20078 CATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAAGAAGGTA...CAGAAACGTGCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    231 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTCCTTGAGGGCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  23169 CTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTTCTTGAGGGCTCCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACT         GACTCCTAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  23219 CCATGCTTCCTGTACAGCCTGCAAAACTGTG...AAGGACTCCTAGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  27848 ACCCCACCCCACCCCTGCTCCTTGGAGGACAACGTGATCACTGTATTCAG

    400     .    :    .    :    .    :
    372 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
  27898 CTCTGTCAAGAATGGTCCAGGTTCTTCTAGA