seq1 = pF1KE0240.tfa, 1470 bp
seq2 = pF1KE0240/gi568815591r_144298949.tfa (gi568815591r:144298949_144510227), 211279 bp

>pF1KE0240 1470
>gi568815591r:144298949_144510227 (Chr7)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-210  (105548-105672)   100% ->
211-292  (108278-108359)   100% ->
293-844  (108631-109182)   100% ->
845-1047  (109916-110118)   100% ->
1048-1154  (110365-110471)   100% ->
1155-1240  (110746-110831)   100% ->
1241-1470  (111050-111279)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTCCTTTTGACACTAACATCACCAGACCTGGAGGGTACCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCTCCTTTTGACACTAACATCACCAGACCTGGAGGGTACCTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAGAGACAAGGATGGCTTCAAAGCCCAGGAGG         GGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 CACCAGAGACAAGGATGGCTTCAAAGCCCAGGAGGGTG...CAGGGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCTGGCTGTACCTGAATTTCCTGTGTGTGGACTGTACCGGATCTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105554 CCCTGGCTGTACCTGAATTTCCTGTGTGTGGACTGTACCGGATCTACGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCTGTGGCTCTTTCAGCTCCTTCTTCATCATCCGGTGCAGCCTTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105604 GTCTGTGGCTCTTTCAGCTCCTTCTTCATCATCCGGTGCAGCCTTTGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGGAGACCCTCAAATCA         CCCCAACATGATCCCTTAGAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105654 TCTGGAGACCCTCAAATCAGTA...CAGCCCCAACATGATCCCTTAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TACCTGAACAGTCCCTCAAACTCATACCCCTGGTGTCTGGGAAAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108300 TACCTGAACAGTCCCTCAAACTCATACCCCTGGTGTCTGGGAAAAGGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCACAAGGG         GCCAGAAAGCTGGAGAGAAGCCCCTGGCTGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 108350 CTCACAAGGGGTG...CAGGCCAGAAAGCTGGAGAGAAGCCCCTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGACCCGGGGAGGAGGAACTGCTCCGGGGCTCAGCCCCTCATGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108662 AGGACCCGGGGAGGAGGAACTGCTCCGGGGCTCAGCCCCTCATGCTCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACACTCAGAGTGAGGAACTGCCACCCTCCTGCACCATCTCAGGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108712 ACACTCAGAGTGAGGAACTGCCACCCTCCTGCACCATCTCAGGAGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCCGCCAGCAGTCTCTGGAGAAGCCACCGGGGCTGATGCTGGGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108762 AAGCCGCCAGCAGTCTCTGGAGAAGCCACCGGGGCTGATGCTGGGAGACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGCCCGCCCCCCCGCTCCAGGGCTCCCCACAAAGACAGAACTCTAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108812 GTGCCCGCCCCCCCGCTCCAGGGCTCCCCACAAAGACAGAACTCTAGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTCCAGGCCCCAGACTCAGGGGGAAGATTGTTCCCTCCCAGTGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108862 GCTCCAGGCCCCAGACTCAGGGGGAAGATTGTTCCCTCCCAGTGGGAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTGAAGATAGGAAAGAGGTCCTATTCTCCAGCCCCCGGGAAGCAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108912 GTGAAGATAGGAAAGAGGTCCTATTCTCCAGCCCCCGGGAAGCAGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCCTAATGCCATGGGTCTGGCCCCAACATCATCTCCGGGTGCCCCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108962 GCCTAATGCCATGGGTCTGGCCCCAACATCATCTCCGGGTGCCCCTAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGCCCGTGCCACACACAACCCAGTGCCCTGTGGGTCAGGCCGGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109012 CAGCCCGTGCCACACACAACCCAGTGCCCTGTGGGTCAGGCCGGGGGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGCCACCTGGCCAATCTCCTCAGTACATTGGCGCAGAGCAACCAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109062 TGCCACCTGGCCAATCTCCTCAGTACATTGGCGCAGAGCAACCAAAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGACCACAAGCAGGGGCCCCCGGAAGTGACCTGCCAAATTAGGAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109112 AGACCACAAGCAGGGGCCCCCGGAAGTGACCTGCCAAATTAGGAAAAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CACGAACCCTATACCGCTCAG         ATCAGCTGGAGGAGCTAGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109162 CACGAACCCTATACCGCTCAGGTA...CAGATCAGCTGGAGGAGCTAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAGATATTCCAAGAAGACCACTATCCTGACAGTGATAAACGCCGAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109936 AAGATATTCCAAGAAGACCACTATCCTGACAGTGATAAACGCCGAGAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGCCCAGACGGTGGGGGTGACCCCCCAGCGCATCATGGTAAAGGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109986 TGCCCAGACGGTGGGGGTGACCCCCCAGCGCATCATGGTAAAGGGGGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCTCACTGGTGGCAGGGTGGAGTGGCGGAGGGCCCACCATTGAAACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110036 GCTCACTGGTGGCAGGGTGGAGTGGCGGAGGGCCCACCATTGAAACACTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAATTGCAGAGTGAGCGCTCAGCGGTAGCCTGG         GTGTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110086 GAATTGCAGAGTGAGCGCTCAGCGGTAGCCTGGGTA...TAGGTGTGGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCAGAATCGCCGGGCCAAGTGGCGAAAAATGGAGAAACTGAATGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110373 CCAGAATCGCCGGGCCAAGTGGCGAAAAATGGAGAAACTGAATGGGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AAAGCAAGGACAATCCTGCAGCCCCTGGCCCTGCCAGCAGTCAATGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 110423 AAAGCAAGGACAATCCTGCAGCCCCTGGCCCTGCCAGCAGTCAATGCAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1155         CTCTGCAGCTGAGATCCTACCTGCTGTGCCCATGGAGCCAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110473 TC...CAGCTCTGCAGCTGAGATCCTACCTGCTGTGCCCATGGAGCCAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCCTGACCCTTTCCCTCAGGAGTCCCCTCTGGATACCTTTCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110788 GCCTGACCCTTTCCCTCAGGAGTCCCCTCTGGATACCTTTCCAGGTG...

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1241    AGCCCCCCATGCTGCTGACTTCTGACCAGACTTTGGCCCCCACCCAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111047 TAGAGCCCCCCATGCTGCTGACTTCTGACCAGACTTTGGCCCCCACCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCCAGTGAGGGTGCTCAGAGGGTGGTGACCCCCCCACTCTTCAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111097 CCCAGTGAGGGTGCTCAGAGGGTGGTGACCCCCCCACTCTTCAGCCCCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 ACCTGTGCGAAGGGCCGATCTTCCTTTCCCCCTTGGCCCTGTCCACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111147 ACCTGTGCGAAGGGCCGATCTTCCTTTCCCCCTTGGCCCTGTCCACACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCCAACTGATGCCACTGCTGATGGATGTTGCTGGCAGTGACAGCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111197 CCCAACTGATGCCACTGCTGATGGATGTTGCTGGCAGTGACAGCAGCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :
   1438 AAGGACGGCCCCTGTGGGTCCTGGGGGACAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 111247 AAGGACGGCCCCTGTGGGTCCTGGGGGACAAGG