seq1 = pF1KE0237.tfa, 474 bp
seq2 = pF1KE0237/gi568815596r_9958856.tfa (gi568815596r:9958856_10180223), 221368 bp

>pF1KE0237 474
>gi568815596r:9958856_10180223 (Chr2)

(complement)

1-318  (100001-100318)   100% ->
319-371  (114268-114320)   100% ->
372-474  (121266-121368)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCGGCAGCAGCCGGAGCAGCCGGACTCTGAGGCGGCGGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCGGCAGCAGCCGGAGCAGCCGGACTCTGAGGCGGCGGCGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGAGAGCCTCCCCGCGGGGCCCGGAGCGGCAGCCCTGGAGGGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGAGAGCCTCCCCGCGGGGCCCGGAGCGGCAGCCCTGGAGGGCGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGCCGGCGGGTGCCGGTGGCGGCGGCCGAGGTCCCGGGGGCAGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGCCGGCGGGTGCCGGTGGCGGCGGCCGAGGTCCCGGGGGCAGCCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGGCGCCCGGCCGCGACCCCAGCCCCGTGGCGCCCCCCGACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGGCGCCCGGCCGCGACCCCAGCCCCGTGGCGCCCCCCGACGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACGAGACGCTGCGCCTGCTGGACGAGCTGCTGGCCGAGTCGGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACGAGACGCTGCGCCTGCTGGACGAGCTGCTGGCCGAGTCGGCGGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGGCCCCCCGGAGCCCGCCCCGCGCCGCCCAGCCCGGCTCCGACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGGCCCCCCGGAGCCCGCCCCGCGCCGCCCAGCCCGGCTCCGACCCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGTCGCGGGGAGCGCG         GTGTGCGCAGAGCAGAGCACAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGTCGCGGGGAGCGCGGTG...AAGGTGTGCGCAGAGCAGAGCACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGCCACCCGGGGAGCGGCAATGTCTCTGA         AGCCCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 114291 GGGCCACCCGGGGAGCGGCAATGTCTCTGAGTA...CAGAGCCCCAGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGGTCGCAAGAAGCCCGAGAGGCCGGCAGCCATCTCCTACGACCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121277 GCGGTCGCAAGAAGCCCGAGAGGCCGGCAGCCATCTCCTACGACCACTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAGGGGCTGATGGCGAGCATCGAGCGGGAGTACTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121327 GAAGAGGGGCTGATGGCGAGCATCGAGCGGGAGTACTGCCGC