seq1 = pF1KE0234.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KE0234/gi568815586f_103930779.tfa (gi568815586f:103930779_104131540), 200762 bp

>pF1KE0234 762
>gi568815586f:103930779_104131540 (Chr12)

1-762  (100001-100762)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCTACAAACTGGTGCTGATCCGGCACGGCGAGAGCACATGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100001 ATGGCCGCCTACAAACTGGTGCTGATCCGGCACGGCGAGAGCGCATGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGAGAACCGCTTCAGCTGCTGGTACGACGCCGATCTGAGCCCGGCGG
        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
 100051 CCTGGAGAACCGCTTCAGCGGCTGGTACGACGCCGACCTGAGCCCGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACGAGGAGGCGAAGCGCGGCGGGCAGGCGCTACGAGATGCTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACGAGGAGGCGAAGCGCGGCGGGCAGGCGCTACGAGATGCTGGCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTTTGACATCTGCCTCACCTCAGTGCAGAAGAGAGTGATCCGGACCCT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100151 GAGTTTGACATCTGCTTCACCTCAGTGCAGAAGAGAGCGATCCGGACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGACAGTGCTAGATGCCATTGATCAGATGTGGCTGCCAGTGGTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGACAGTGCTAGATGCCATTGATCAGATGTGGCTGCCAGTGGTGAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTGGCGCCTCAATGAGCGGCACTATGGGGGTCTAACCGGTCTCAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTGGCGCCTCAATGAGCGGCACTATGGGGGTCTAACCGGTCTCAATAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGAAACTGCTGCAAAGCATGGTGAGGCCCAGGTGAAGATCTGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAGAAACTGCTGCAAAGCATTGTGAGGCCCAGGTGAAGATCTGGAGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCTATGATGTCCCACCACCTCCGATGGAGCCCGACCATCCTTTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCTATGATGTCCCACCACCTCCGATGGAGCCCGACCATCCTTTCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAACATCAGTAAGGATCGCAGGTATGCAGACCTCACAGAAGATCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAACATCAGTAAGGATCGCAGGTATGCAGACCTCACAGAAGATCAGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCTCCTATGAGAGTCCGAAGGATACTATTGCCAGAGCTCTGCCCTTCTG
        ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCTCCTGTGAGAGTCTGAAGGATACTATTGCCAGAGCTCTGCCCTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATGAAGAAATAGTTCCCCAGATCAAGGAGGGGAAACGTGTACTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATGAAGAAATAGTTCCCCAGATCAAGGAGGGGAAACGTGTACTGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGCCCATGGCAACAGCCTCCAGGGCATTGCCAAGCATGTGGAGGGTCTC
        ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||
 100551 CAGCCCATGGCAACAGCCTCCGGGGCATTGTCAAGCATCTGGAGGGTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTGAAGAGGCTATCATGGAGCTGAACCTGCCGACTGGTATTCCCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100601 TCTGAAGAGGCTATCATGGAGCTGAACCTGCCGACTGGTATTCCCATTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGAATTGGACAAGAACTTGAAGCCTATCAAGCCCATGCAGTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGAATTGGACAAGAACTTGAAGCCTATCAAGCCCATGCAGTTTCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGATGAAGAGACGGTGTGCAAAGCCATAGAAGCTGTGGCTGCCCAGGGC
        ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
 100701 GGGATGAGGAGACGGTGCGCAAAGCCATGGAAGCTGTGGCTGCCCAGGGC

    750     .    :
    751 AAGGCCAAGAAG
        ||||||||||||
 100751 AAGGCCAAGAAG