seq1 = pF1KE0232.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0232/gi568815586f_55352214.tfa (gi568815586f:55352214_55553149), 200936 bp

>pF1KE0232 936
>gi568815586f:55352214_55553149 (Chr12)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAACCACACAGTAATAAGAACTTTTATCCTGCTGGGACTGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAAACCACACAGTAATAAGAACTTTTATCCTGCTGGGACTGACAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCCACACCTGCAAGTTCTGCTTTTTATCTTTCTATTTCTCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACCCACACCTGCAAGTTCTGCTTTTTATCTTTCTATTTCTCACCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTGAGTGTAACAGGGAACCTGACTATTATCACCCTCACATTGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTGAGTGTAACAGGGAACCTGACTATTATCACCCTCACATTGGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACCACCTTAAAACTCCTATGTACTTCTTTCTCAGAAATTTTTCCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACCACCTTAAAACTCCTATGTACTTCTTTCTCAGAAATTTTTCCTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAGTCTCATTTACTACAGTCTGCATTCCCAGATTCTTGTACAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAAGTCTCATTTACTACAGTCTGCATTCCCAGATTCTTGTACAATATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAATGGGGGACAATACCATTACCTACAATGCTTGTGCCAGTCAAATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAATGGGGGACAATACCATTACCTACAATGCTTGTGCCAGTCAAATATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTGTTATTCTCTTTGGAGCAACAGAATTTTTTCTCTTGGCAGCCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTGTTATTCTCTTTGGAGCAACAGAATTTTTTCTCTTGGCAGCCATGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGACCGCTATGTGGCCATCTGTAAACCCCTTCATTATGTGGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGACCGCTATGTGGCCATCTGTAAACCCCTTCATTATGTGGTCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAACAACAGGGTGTGTACCTTATTAGTTCTCTGCTGTTGGGTGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAACAACAGGGTGTGTACCTTATTAGTTCTCTGCTGTTGGGTGGCTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGATGATCATTGTTCCACCACTTAGCTTAGGCCTCCAGCTCGAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGATGATCATTGTTCCACCACTTAGCTTAGGCCTCCAGCTCGAATTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGACTCCAATGCCATTGATCATTTTAGCTGTGATGCAGGTCCTCTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGACTCCAATGCCATTGATCATTTTAGCTGTGATGCAGGTCCTCTCCTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATCTCATGCTCAGATACATGGGTAATAGAACAGATGGTTATACTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGATCTCATGCTCAGATACATGGGTAATAGAACAGATGGTTATACTTATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGTATTTGCACTCATTATCACCCTAGTTTGTGTGATTCTGTCCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGTATTTGCACTCATTATCACCCTAGTTTGTGTGATTCTGTCCTACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTACATAGTCAGAACAATTCTGAAGTTCCCTTCTGTTCAGCAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTACATAGTCAGAACAATTCTGAAGTTCCCTTCTGTTCAGCAAAGGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGCCTTTTCTACCTGTTCATCCCACATGATTGTGGTTTCCATTGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGCCTTTTCTACCTGTTCATCCCACATGATTGTGGTTTCCATTGCCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGAAGCTGCATCTTCATCTATATCAAGCCCTCTGCAAAAGATGAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGAAGCTGCATCTTCATCTATATCAAGCCCTCTGCAAAAGATGAGGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATAAATAAAGGAGTTTCAGTTCTTACTACTTCTGTCGCACCCTTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATAAATAAAGGAGTTTCAGTTCTTACTACTTCTGTCGCACCCTTGTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCCTTCATTTACACCTTGAGGAACAAGCAAGTGAAACAAGCTTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCCTTCATTTACACCTTGAGGAACAAGCAAGTGAAACAAGCTTTCAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GACTCTATAAAGAGGATTGCATTTCTCTCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GACTCTATAAAGAGGATTGCATTTCTCTCAAAGAAG