seq1 = pF1KE0224.tfa, 267 bp
seq2 = pF1KE0224/gi568815586f_21273352.tfa (gi568815586f:21273352_21478423), 205072 bp

>pF1KE0224 267
>gi568815586f:21273352_21478423 (Chr12)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-267  (104886-105072)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCATCCTGAAGCTGCAAGTATTTCTCATTGTGCTCTCTGTTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCATCCTGAAGCTGCAAGTATTTCTCATTGTGCTCTCTGTTGCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCATCTGAAAGCTACACCCATTGAAAG         TCATCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100051 GAACCATCTGAAAGCTACACCCATTGAAAGGTT...CAGTCATCAGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAGCGGAAATGCAACACTGCCACATGTGCAACGCAGCGCCTGGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104897 AAAAGCGGAAATGCAACACTGCCACATGTGCAACGCAGCGCCTGGCAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTTTAGTTCATTCCAGCAACAACTTTGGTGCCATTCTCTCATCTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104947 TTTTTAGTTCATTCCAGCAACAACTTTGGTGCCATTCTCTCATCTACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGGGATCCAATACATATGGCAAGAGGAATGCAGTAGAGGTTTTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104997 CGTGGGATCCAATACATATGGCAAGAGGAATGCAGTAGAGGTTTTAAAGA

    250     .    :    .    :    .
    242 GAGAGCCACTGAATTACTTGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||
 105047 GAGAGCCACTGAATTACTTGCCCCTT