seq1 = pF1KE0221.tfa, 288 bp
seq2 = pF1KE0221/gi568815581r_34260562.tfa (gi568815581r:34260562_34463161), 202600 bp

>pF1KE0221 288
>gi568815581r:34260562_34463161 (Chr17)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-188  (101266-101377)   100% ->
189-288  (102501-102600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGATCATCACCACAGCCCTGGTGTGCTTGCTGCTAGCTGGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGATCATCACCACAGCCCTGGTGTGCTTGCTGCTAGCTGGGATGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGAAGATGTGGACAGCAAGAGCA         TGCAGGTACCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GCCGGAAGATGTGGACAGCAAGAGCAGTG...TAGTGCAGGTACCCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAGATGTTGCTTCTCATTTGCGGAGCAAGAGATTCCCCTGAGGGCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101281 CCAGATGTTGCTTCTCATTTGCGGAGCAAGAGATTCCCCTGAGGGCAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTGTTACAGAAATACCAGCTCCATCTGCTCCAATGAGGGCTTAAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101331 CTGTGTTACAGAAATACCAGCTCCATCTGCTCCAATGAGGGCTTAATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       ATTCAAGCTGAAGAGAGGCAAAGAGGCCTGCGCCTTGGACACAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101381 ...CAGATTCAAGCTGAAGAGAGGCAAAGAGGCCTGCGCCTTGGACACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGGATGGGTTCAGAGGCACAGAAAAATGCTGAGGCACTGCCCGTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102545 TTGGATGGGTTCAGAGGCACAGAAAAATGCTGAGGCACTGCCCGTCAAAA

    300     .
    283 AGAAAA
        ||||||
 102595 AGAAAA