seq1 = pF1KE0219.tfa, 486 bp
seq2 = pF1KE0219/gi568815591f_116399782.tfa (gi568815591f:116399782_116606118), 206337 bp

>pF1KE0219 486
>gi568815591f:116399782_116606118 (Chr7)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-338  (100479-100666)   100% ->
339-486  (106190-106337)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGGAGACGGAGAAGGCGGACGTACAGCTCTTCATGGACGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTGGAGACGGAGAAGGCGGACGTACAGCTCTTCATGGACGACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTACAGCCACCACAGCGGCCTCGAGTACGCCGACCCCGAGAAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTACAGCCACCACAGCGGCCTCGAGTACGCCGACCCCGAGAAGTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACTCGGACCAGGACCGGGATCCCCACCGGCTCAACTCGCATCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACTCGGACCAGGACCGGGATCCCCACCGGCTCAACTCGCATCTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          CTGGGCTTCGAGGATGTGATCGCAGAGCCGGTGACTACGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTG...CAGCTGGGCTTCGAGGATGTGATCGCAGAGCCGGTGACTACGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCTTTGACAAAGTGTGGATCTGCAGCCATGCCCTCTTTGAAATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100520 CTCCTTTGACAAAGTGTGGATCTGCAGCCATGCCCTCTTTGAAATCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATACGTAATGTACAAGTTCCTGACGGTGTTCCTGGCCATTCCCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100570 AATACGTAATGTACAAGTTCCTGACGGTGTTCCTGGCCATTCCCCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCATTGCGGGAATTCTCTTTGCCACCCTCAGCTGTCTGCACATCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100620 TTCATTGCGGGAATTCTCTTTGCCACCCTCAGCTGTCTGCACATCTGGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    339       GATTTTAATGCCTTTTGTAAAGACCTGCCTAATGGTTCTGCCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100670 ...CAGGATTTTAATGCCTTTTGTAAAGACCTGCCTAATGGTTCTGCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGTGCAGACAATATGGAAGAGTGTGACAGATGTTATCATTGCTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106234 CAGTGCAGACAATATGGAAGAGTGTGACAGATGTTATCATTGCTCCATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGTACGAGCGTAGGACGATGCTTCTCTTCTGTCAGCCTGCAACTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106284 TGTACGAGCGTAGGACGATGCTTCTCTTCTGTCAGCCTGCAACTGAGCCA

    500 
    483 GGAT
        ||||
 106334 GGAT