seq1 = pF1KE0217.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KE0217/gi568815596f_64355343.tfa (gi568815596f:64355343_64558425), 203083 bp

>pF1KE0217 516
>gi568815596f:64355343_64558425 (Chr2)

1-36  (99204-99239)   100% ->
37-108  (100002-100073)   100% ->
109-197  (100247-100335)   100% ->
198-375  (100946-101123)   100% ->
376-516  (102943-103083)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGATCAGTGGCCGACAGCGATGCCGTGGTG         AAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  99204 ATGGCGGGATCAGTGGCCGACAGCGATGCCGTGGTGGTG...TAGAAACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGATGATGGCCATTTAAACAACTCTTTGAGCTCTCCAGTTCAAGCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 AGATGATGGCCATTTAAACAACTCTTTGAGCTCTCCAGTTCAAGCGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTACTTCCCACGACTG         ATAGTTCCATTTTGTGGGCACATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100057 TGTACTTCCCACGACTGGTA...CAGATAGTTCCATTTTGTGGGCACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAAGGTGGCATGAGACCAGGCAAGAAGGTGTTAGTGATGGGCATCGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100271 AAAGGTGGCATGAGACCAGGCAAGAAGGTGTTAGTGATGGGCATCGTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTCAACCCAGAGAG         CTTTGCAATCAGCTTGACCTGTGGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100321 CCTCAACCCAGAGAGGTA...CAGCTTTGCAATCAGCTTGACCTGTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACTCAGAAGACCCTCCTGCCGATGTGGCAATCGAACTCAAAGCTGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100972 ACTCAGAAGACCCTCCTGCCGATGTGGCAATCGAACTCAAAGCTGTGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACAGATCGGCAGCTACTCAGAAATTCTTGTATATCTGGGGAGAGGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101022 ACAGATCGGCAGCTACTCAGAAATTCTTGTATATCTGGGGAGAGGGGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAACAGTCAGCAATCCCTTACTTTCCATTCATTCCAGACCAGCCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101072 AGAACAGTCAGCAATCCCTTACTTTCCATTCATTCCAGACCAGCCATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GG         GTGGAAATTCTTTGTGAGCACCCACGTTTCCGAGTGTTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101122 GGGTG...CAGGTGGAAATTCTTTGTGAGCACCCACGTTTCCGAGTGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGATGGACACCAACTTTTTGATTTTTACCATCGCATTCAAACGTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102982 GTGGATGGACACCAACTTTTTGATTTTTACCATCGCATTCAAACGTTATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCAATTGACACCATAAAGATAAATGGAGACCTCCAGATCACCAAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103032 TGCAATTGACACCATAAAGATAAATGGAGACCTCCAGATCACCAAGCTTG

    550 
    515 GC
        ||
 103082 GC