seq1 = pF1KE0216.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KE0216/gi568815586f_48084123.tfa (gi568815586f:48084123_48284704), 200582 bp

>pF1KE0216 582
>gi568815586f:48084123_48284704 (Chr12)

1-582  (100001-100582)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGGTCTGCTGGAGATCATGACCAAGGACGGCGGCGACATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGACGGTCTGCTGGAGATCATGACCAAGGACGGCGGCGACATGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCCCCTGGAGGTGTCCACCGTGCCGGCAGTGGGGGACGTGATCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCCCCTGGAGGTGTCCACCGTGCCGGCAGTGGGGGACGTGATCTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGTACAACGGCGGCATGAAGGAACTGATGGAGCACCTGAAAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGTACAACGGCGGCATGAAGGAACTGATGGAGCACCTGAAAGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCAAGCCCTGTTTGAGGACGTGAGGGCCATGAGGGGGGCCCTGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCAAGCCCTGTTTGAGGACGTGAGGGCCATGAGGGGGGCCCTGGACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGGCCTCGCACATCCAGGTGCTCTCGGACGACGTGTGCGCCAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGGCCTCGCACATCCAGGTGCTCTCGGACGACGTGTGCGCCAACCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGCCATCGTCTCCATGTGCCAGATTATGACCACTGCGCCCCGCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGCCATCGTCTCCATGTGCCAGATTATGACCACTGCGCCCCGCCAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTTGGGCGTGGTCGGCGGCAAGGGGAGCTTCCAGAGCGACCCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTTGGGCGTGGTCGGCGGCAAGGGGAGCTTCCAGAGCGACCCCCAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGGAGACTCCTTCGCCTGGGATCGGGGACAGCGGCTTGCTGGGTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGGAGACTCCTTCGCCTGGGATCGGGGACAGCGGCTTGCTGGGTCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCCCGAGGACGAGGAGGACGAGGAAGAAGAGAAGGAGATGCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCCCGAGGACGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAGAAGGAGATGCCCAGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCACACCCTCCAGTCACTGTGAGCGCCCCGAAAGCCCCTGTGCTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCACACCCTCCAGTCACTGTGAGCGCCCCGAAAGCCCCTGTGCTGGTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTTGGGGGGGACGGGCCACTTGTGGAGCCCCTCGATATGCCCGACATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100501 CCTTGGGGGGGACGGGCCACTTGTGGAGCCCCTCGACATGCCCGACATTA

    550     .    :    .    :    .    :
    551 CCCTGCTGCAACTGGAGGGCGAGGCCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTGCTGCAACTGGAGGGCGAGGCCTCCCTG