seq1 = pF1KE0210.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KE0210/gi568815586f_4231280.tfa (gi568815586f:4231280_4452688), 221409 bp

>pF1KE0210 810
>gi568815586f:4231280_4452688 (Chr12)

1-32  (89993-90024)   100% ->
33-70  (100001-100038)   100% ->
71-192  (105760-105881)   100% ->
193-270  (118540-118617)   100% ->
271-381  (119988-120098)   100% ->
382-810  (120981-121409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGCTTCGCTCTGACTGTTGTCCGGCA         TGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  89993 ATGGCTCGCTTCGCTCTGACTGTTGTCCGGCAGTG...TAGTGGAGAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AAGATTTAACAAGGAGAAAATAATCCAAG         GACAAGGAGTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100010 AAGATTTAACAAGGAGAAAATAATCCAAGGTT...CAGGACAAGGAGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ATGAACCTCTTTCAGAAACTGGATTTAAACAAGCAGCAGCTGCTGGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105772 ATGAACCTCTTTCAGAAACTGGATTTAAACAAGCAGCAGCTGCTGGTATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTTCTGAATAATGTGAAGTTTACTCATGCTTTCTCCAGTGATCTCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105822 TTTCTGAATAATGTGAAGTTTACTCATGCTTTCTCCAGTGATCTCATGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACAAAGCAG         ACCATGCATGGAATTTTGGAGAGAAGCAAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105872 GACAAAGCAGGTA...CAGACCATGCATGGAATTTTGGAGAGAAGCAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTTGCAAAGATATGACGGTAAAGTATGACTCAAGACTTCGGGAAAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 118571 TTTGCAAAGATATGACGGTAAAGTATGACTCAAGACTTCGGGAAAGGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    271       AAATACGGGGTTGTAGAAGGCAAAGCGCTAAGTGAGCTGAGGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118621 ...CAGAAATACGGGGTTGTAGAAGGCAAAGCGCTAAGTGAGCTGAGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CATGGCCAAAGCAGCCAGGGAAGAGTGCCCTGTGTTTACACCGCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120032 CATGGCCAAAGCAGCCAGGGAAGAGTGCCCTGTGTTTACACCGCCCGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GAGAGACGCTGGACCAG         GTGAAAATGCGTGGAATAGACTTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 120082 GAGAGACGCTGGACCAGGTA...TAGGTGAAAATGCGTGGAATAGACTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTTGAATTTCTTTGTCAACTAATCCTGAAAGAAGCGGATCAAAAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121005 TTTGAATTTCTTTGTCAACTAATCCTGAAAGAAGCGGATCAAAAAGAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GTTTTCCCAAGGATCTCCAAGCAACTGTCTGGAAACTTCTTTGGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121055 GTTTTCCCAAGGATCTCCAAGCAACTGTCTGGAAACTTCTTTGGCAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TATTTCCTTTAGGAAAAAATCACAGCTCTAAAGTTAATTCAGACAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121105 TATTTCCTTTAGGAAAAAATCACAGCTCTAAAGTTAATTCAGACAGCGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATTCCAGGATTAGCAGCCAGTGTCTTAGTTGTGAGTCACGGTGCTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121155 ATTCCAGGATTAGCAGCCAGTGTCTTAGTTGTGAGTCACGGTGCTTACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAGAAGTCTGTTTGATTATTTTCTGACTGACCTTAAGTGTTCCTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121205 GAGAAGTCTGTTTGATTATTTTCTGACTGACCTTAAGTGTTCCTTACCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCACTCTGAGCAGATCTGAACTTATGTCAGTCACTCCCAATACAGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121255 CCACTCTGAGCAGATCTGAACTTATGTCAGTCACTCCCAATACAGGGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGTCTCTTTATCATAAACTTTGAGGAAGGAAGAGAAGTTAAACCAACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121305 AGTCTCTTTATCATAAACTTTGAGGAAGGAAGAGAAGTTAAACCAACGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCAGTGTATTTGTATGAACCTACAGGATCATCTAAATGGACTGACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121355 TCAGTGTATTTGTATGAACCTACAGGATCATCTAAATGGACTGACTGAAA

    850     .
    806 CTCGC
        |||||
 121405 CTCGC