Result of SIM4 for
pF1KE0199
seq1 = pF1KE0199.tfa, 3318 bp
seq2 = pF1KE0199/gi568815586f_57363692.tfa (gi568815586f:57363692_57572058), 208367 bp
>pF1KE0199 3318
>gi568815586f:57363692_57572058 (Chr12)
1-100 (100001-100100) 100% ->
101-193 (100308-100400) 100% ->
194-389 (100982-101177) 100% ->
390-534 (101420-101564) 100% ->
535-624 (101916-102005) 100% ->
625-762 (102097-102234) 100% ->
763-912 (102549-102698) 100% ->
913-1077 (103642-103806) 100% ->
1078-1308 (104303-104533) 100% ->
1309-1576 (105740-106007) 100% ->
1577-3318 (106626-108367) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTTCAACTCGATGACCCCACCACCAATCAGTAGCTATGGCGAGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTTCAACTCGATGACCCCACCACCAATCAGTAGCTATGGCGAGCCCTG
50 . : . : . : . : . :
51 CTGTCTCCGGCCCCTCCCCAGTCAGGGGGCCCCCAGTGTGGGGACAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTGTCTCCGGCCCCTCCCCAGTCAGGGGGCCCCCAGTGTGGGGACAGAAG
100 . : . : . : . : . :
101 GACTGTCTGGCCCGCCCTTCTGCCACCAAGCTAACCTCATG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GTC...TAGGACTGTCTGGCCCGCCCTTCTGCCACCAAGCTAACCTCATG
150 . : . : . : . : . :
142 TCCGGCCCCCACAGTTATGGGCCAGCCAGAGAGACCAACAGCTGCACCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100349 TCCGGCCCCCACAGTTATGGGCCAGCCAGAGAGACCAACAGCTGCACCGA
200 . : . : . : . : . :
192 GG GCCCACTCTTTTCTTCTCCCCGGAGTGCAGTCAAGTTGA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100399 GGGTG...CAGGCCCACTCTTTTCTTCTCCCCGGAGTGCAGTCAAGTTGA
250 . : . : . : . : . :
233 CCAAGAAGCGGGCACTGTCCATCTCACCTCTGTCGGATGCCAGCCTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101021 CCAAGAAGCGGGCACTGTCCATCTCACCTCTGTCGGATGCCAGCCTGGAC
300 . : . : . : . : . :
283 CTGCAGACGGTTATCCGCACCTCACCCAGCTCCCTCGTAGCTTTCATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101071 CTGCAGACGGTTATCCGCACCTCACCCAGCTCCCTCGTAGCTTTCATCAA
350 . : . : . : . : . :
333 CTCGCGATGCACATCTCCAGGAGGCTCCTACGGTCATCTCTCCATTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101121 CTCGCGATGCACATCTCCAGGAGGCTCCTACGGTCATCTCTCCATTGGCA
400 . : . : . : . : . :
383 CCATGAG CCCATCTCTGGGATTCCCAGCCCAGATGAATCAC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
101171 CCATGAGGTG...CAGCCCATCTCTGGGATTCCCAGCCCAGATGAATCAC
450 . : . : . : . : . :
424 CAAAAAGGGCCCTCGCCTTCCTTTGGGGTCCAGCCTTGTGGTCCCCATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101454 CAAAAAGGGCCCTCGCCTTCCTTTGGGGTCCAGCCTTGTGGTCCCCATGA
500 . : . : . : . : . :
474 CTCTGCCCGGGGTGGGATGATCCCACATCCTCAGTCCCGGGGACCCTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101504 CTCTGCCCGGGGTGGGATGATCCCACATCCTCAGTCCCGGGGACCCTTCC
550 . : . : . : . : . :
524 CAACTTGCCAG CTGAAGTCTGAGCTGGACATGCTGGTTGGC
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
101554 CAACTTGCCAGGTG...AAGCTGAAGTCTGAGCTGGACATGCTGGTTGGC
600 . : . : . : . : . :
565 AAGTGCCGGGAGGAACCCTTGGAAGGTGATATGTCCAGCCCCAACTCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101946 AAGTGCCGGGAGGAACCCTTGGAAGGTGATATGTCCAGCCCCAACTCCAC
650 . : . : . : . : . :
615 AGGCATACAG GATCCCCTGTTGGGGATGCTGGATGGGCGGG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
101996 AGGCATACAGGTA...TAGGATCCCCTGTTGGGGATGCTGGATGGGCGGG
700 . : . : . : . : . :
656 AGGACCTCGAGAGAGAGGAGAAGCGTGAGCCTGAATCTGTGTATGAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102128 AGGACCTCGAGAGAGAGGAGAAGCGTGAGCCTGAATCTGTGTATGAAACT
750 . : . : . : . : . :
706 GACTGCCGTTGGGATGGCTGCAGCCAGGAATTTGACTCCCAAGAGCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102178 GACTGCCGTTGGGATGGCTGCAGCCAGGAATTTGACTCCCAAGAGCAGCT
800 . : . : . : . : . :
756 GGTGCAC CACATCAACAGCGAGCACATCCACGGGGAGCGGA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
102228 GGTGCACGTG...CAGCACATCAACAGCGAGCACATCCACGGGGAGCGGA
850 . : . : . : . : . :
797 AGGAGTTCGTGTGCCACTGGGGGGGCTGCTCCAGGGAGCTGAGGCCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102583 AGGAGTTCGTGTGCCACTGGGGGGGCTGCTCCAGGGAGCTGAGGCCCTTC
900 . : . : . : . : . :
847 AAAGCCCAGTACATGCTGGTGGTTCACATGCGCAGACACACTGGCGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102633 AAAGCCCAGTACATGCTGGTGGTTCACATGCGCAGACACACTGGCGAGAA
950 . : . : . : . : . :
897 GCCACACAAGTGCACG TTTGAAGGGTGCCGGAAGTCATACT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
102683 GCCACACAAGTGCACGGTG...CAGTTTGAAGGGTGCCGGAAGTCATACT
1000 . : . : . : . : . :
938 CACGCCTCGAAAACCTGAAGACGCACCTGCGGTCACACACGGGTGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103667 CACGCCTCGAAAACCTGAAGACGCACCTGCGGTCACACACGGGTGAGAAG
1050 . : . : . : . : . :
988 CCATACATGTGTGAGCACGAGGGCTGCAGTAAAGCCTTCAGCAATGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103717 CCATACATGTGTGAGCACGAGGGCTGCAGTAAAGCCTTCAGCAATGCCAG
1100 . : . : . : . : . :
1038 TGACCGAGCCAAGCACCAGAATCGGACCCATTCCAATGAG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
103767 TGACCGAGCCAAGCACCAGAATCGGACCCATTCCAATGAGGTG...CAGA
1150 . : . : . : . : . :
1079 AGCCGTATGTATGTAAGCTCCCTGGCTGCACCAAACGCTATACAGATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104304 AGCCGTATGTATGTAAGCTCCCTGGCTGCACCAAACGCTATACAGATCCT
1200 . : . : . : . : . :
1129 AGCTCGCTGCGAAAACATGTCAAGACAGTGCATGGTCCTGACGCCCATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104354 AGCTCGCTGCGAAAACATGTCAAGACAGTGCATGGTCCTGACGCCCATGT
1250 . : . : . : . : . :
1179 GACCAAACGGCACCGTGGGGATGGCCCCCTGCCTCGGGCACCATCCATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104404 GACCAAACGGCACCGTGGGGATGGCCCCCTGCCTCGGGCACCATCCATTT
1300 . : . : . : . : . :
1229 CTACAGTGGAGCCCAAGAGGGAGCGGGAAGGAGGTCCCATCAGGGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104454 CTACAGTGGAGCCCAAGAGGGAGCGGGAAGGAGGTCCCATCAGGGAGGAA
1350 . : . : . : . : . :
1279 AGCAGACTGACTGTGCCAGAGGGTGCCATG AAGCCACAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
104504 AGCAGACTGACTGTGCCAGAGGGTGCCATGGTG...CAGAAGCCACAGCC
1400 . : . : . : . : . :
1320 AAGCCCTGGGGCCCAGTCATCCTGCAGCAGTGACCACTCCCCGGCAGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105751 AAGCCCTGGGGCCCAGTCATCCTGCAGCAGTGACCACTCCCCGGCAGGGA
1450 . : . : . : . : . :
1370 GTGCAGCCAATACAGACAGTGGTGTGGAAATGACTGGCAATGCAGGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105801 GTGCAGCCAATACAGACAGTGGTGTGGAAATGACTGGCAATGCAGGGGGC
1500 . : . : . : . : . :
1420 AGCACTGAAGACCTCTCCAGCTTGGACGAGGGACCTTGCATTGCTGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105851 AGCACTGAAGACCTCTCCAGCTTGGACGAGGGACCTTGCATTGCTGGCAC
1550 . : . : . : . : . :
1470 TGGTCTGTCCACTCTTCGCCGCCTTGAGAACCTCAGGCTGGACCAGCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105901 TGGTCTGTCCACTCTTCGCCGCCTTGAGAACCTCAGGCTGGACCAGCTAC
1600 . : . : . : . : . :
1520 ATCAACTCCGGCCAATAGGGACCCGGGGTCTCAAACTGCCCAGCTTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105951 ATCAACTCCGGCCAATAGGGACCCGGGGTCTCAAACTGCCCAGCTTGTCC
1650 . : . : . : . : . :
1570 CACACCG GTACCACTGTGTCCCGCCGCGTGGGCCCCCCAGT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
106001 CACACCGGTG...CAGGTACCACTGTGTCCCGCCGCGTGGGCCCCCCAGT
1700 . : . : . : . : . :
1611 CTCTCTTGAACGCCGCAGCAGCAGCTCCAGCAGCATCAGCTCTGCCTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106660 CTCTCTTGAACGCCGCAGCAGCAGCTCCAGCAGCATCAGCTCTGCCTATA
1750 . : . : . : . : . :
1661 CTGTCAGCCGCCGCTCCTCCCTGGCCTCTCCTTTCCCCCCTGGCTCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106710 CTGTCAGCCGCCGCTCCTCCCTGGCCTCTCCTTTCCCCCCTGGCTCCCCA
1800 . : . : . : . : . :
1711 CCAGAGAATGGAGCATCCTCCCTGCCTGGCCTTATGCCTGCCCAGCACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106760 CCAGAGAATGGAGCATCCTCCCTGCCTGGCCTTATGCCTGCCCAGCACTA
1850 . : . : . : . : . :
1761 CCTGCTTCGGGCAAGATATGCTTCAGCCAGAGGGGGTGGTACTTCGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106810 CCTGCTTCGGGCAAGATATGCTTCAGCCAGAGGGGGTGGTACTTCGCCCA
1900 . : . : . : . : . :
1811 CTGCAGCATCCAGCCTGGATCGGATAGGTGGTCTTCCCATGCCTCCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106860 CTGCAGCATCCAGCCTGGATCGGATAGGTGGTCTTCCCATGCCTCCTTGG
1950 . : . : . : . : . :
1861 AGAAGCCGAGCCGAGTATCCAGGATACAACCCCAATGCAGGGGTCACCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106910 AGAAGCCGAGCCGAGTATCCAGGATACAACCCCAATGCAGGGGTCACCCG
2000 . : . : . : . : . :
1911 GAGGGCCAGTGACCCAGCCCAGGCTGCTGACCGTCCTGCTCCAGCTAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106960 GAGGGCCAGTGACCCAGCCCAGGCTGCTGACCGTCCTGCTCCAGCTAGAG
2050 . : . : . : . : . :
1961 TCCAGAGGTTCAAGAGCCTGGGCTGTGTCCATACCCCACCCACTGTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107010 TCCAGAGGTTCAAGAGCCTGGGCTGTGTCCATACCCCACCCACTGTGGCA
2100 . : . : . : . : . :
2011 GGGGGAGGACAGAACTTTGATCCTTACCTCCCAACCTCTGTCTACTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107060 GGGGGAGGACAGAACTTTGATCCTTACCTCCCAACCTCTGTCTACTCACC
2150 . : . : . : . : . :
2061 ACAGCCCCCCAGCATCACTGAGAATGCTGCCATGGATGCTAGAGGGCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107110 ACAGCCCCCCAGCATCACTGAGAATGCTGCCATGGATGCTAGAGGGCTAC
2200 . : . : . : . : . :
2111 AGGAAGAGCCAGAAGTTGGGACCTCCATGGTGGGCAGTGGTCTGAACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107160 AGGAAGAGCCAGAAGTTGGGACCTCCATGGTGGGCAGTGGTCTGAACCCC
2250 . : . : . : . : . :
2161 TATATGGACTTCCCACCTACTGATACTCTGGGATATGGGGGACCTGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107210 TATATGGACTTCCCACCTACTGATACTCTGGGATATGGGGGACCTGAAGG
2300 . : . : . : . : . :
2211 GGCAGCAGCTGAGCCTTATGGAGCGAGGGGTCCAGGCTCTCTGCCTCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107260 GGCAGCAGCTGAGCCTTATGGAGCGAGGGGTCCAGGCTCTCTGCCTCTTG
2350 . : . : . : . : . :
2261 GGCCTGGTCCACCCACCAACTATGGCCCCAACCCCTGTCCCCAGCAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107310 GGCCTGGTCCACCCACCAACTATGGCCCCAACCCCTGTCCCCAGCAGGCC
2400 . : . : . : . : . :
2311 TCATATCCTGACCCCACCCAAGAAACATGGGGTGAGTTCCCTTCCCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107360 TCATATCCTGACCCCACCCAAGAAACATGGGGTGAGTTCCCTTCCCACTC
2450 . : . : . : . : . :
2361 TGGGCTGTACCCAGGCCCCAAGGCTCTAGGTGGAACCTACAGCCAGTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107410 TGGGCTGTACCCAGGCCCCAAGGCTCTAGGTGGAACCTACAGCCAGTGTC
2500 . : . : . : . : . :
2411 CTCGACTTGAACATTATGGACAAGTGCAAGTCAAGCCAGAACAGGGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107460 CTCGACTTGAACATTATGGACAAGTGCAAGTCAAGCCAGAACAGGGGTGC
2550 . : . : . : . : . :
2461 CCAGTGGGGTCTGACTCCACAGGACTGGCACCCTGCCTCAATGCCCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107510 CCAGTGGGGTCTGACTCCACAGGACTGGCACCCTGCCTCAATGCCCACCC
2600 . : . : . : . : . :
2511 CAGTGAGGGGCCCCCACATCCACAGCCTCTCTTTTCCCATTACCCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107560 CAGTGAGGGGCCCCCACATCCACAGCCTCTCTTTTCCCATTACCCCCAGC
2650 . : . : . : . : . :
2561 CCTCTCCTCCCCAATATCTCCAGTCAGGCCCCTATACCCAGCCACCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107610 CCTCTCCTCCCCAATATCTCCAGTCAGGCCCCTATACCCAGCCACCCCCT
2700 . : . : . : . : . :
2611 GATTATCTTCCTTCAGAACCCAGGCCTTGCCTGGACTTTGATTCCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107660 GATTATCTTCCTTCAGAACCCAGGCCTTGCCTGGACTTTGATTCCCCCAC
2750 . : . : . : . : . :
2661 CCATTCCACAGGGCAGCTCAAGGCTCAGCTTGTGTGTAATTATGTTCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107710 CCATTCCACAGGGCAGCTCAAGGCTCAGCTTGTGTGTAATTATGTTCAAT
2800 . : . : . : . : . :
2711 CTCAACAGGAGCTACTGTGGGAGGGTGGGGGCAGGGAAGATGCCCCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107760 CTCAACAGGAGCTACTGTGGGAGGGTGGGGGCAGGGAAGATGCCCCCGCC
2850 . : . : . : . : . :
2761 CAGGAACCTTCCTACCAGAGTCCCAAGTTTCTGGGGGGTTCCCAGGTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107810 CAGGAACCTTCCTACCAGAGTCCCAAGTTTCTGGGGGGTTCCCAGGTTAG
2900 . : . : . : . : . :
2811 CCCAAGCCGTGCTAAAGCTCCAGTGAACACATATGGACCTGGCTTTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107860 CCCAAGCCGTGCTAAAGCTCCAGTGAACACATATGGACCTGGCTTTGGAC
2950 . : . : . : . : . :
2861 CCAACTTGCCCAATCACAAGTCAGGTTCCTATCCCACCCCTTCACCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107910 CCAACTTGCCCAATCACAAGTCAGGTTCCTATCCCACCCCTTCACCATGC
3000 . : . : . : . : . :
2911 CATGAAAATTTTGTAGTGGGGGCAAATAGGGCTTCACATAGGGCAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107960 CATGAAAATTTTGTAGTGGGGGCAAATAGGGCTTCACATAGGGCAGCAGC
3050 . : . : . : . : . :
2961 ACCACCTCGACTTCTGCCCCCATTGCCCACTTGCTATGGGCCTCTCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108010 ACCACCTCGACTTCTGCCCCCATTGCCCACTTGCTATGGGCCTCTCAAAG
3100 . : . : . : . : . :
3011 TGGGAGGCACAAACCCCAGCTGTGGTCATCCTGAGGTGGGCAGGCTAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108060 TGGGAGGCACAAACCCCAGCTGTGGTCATCCTGAGGTGGGCAGGCTAGGA
3150 . : . : . : . : . :
3061 GGGGGTCCTGCCTTGTACCCTCCTCCCGAAGGACAGGTATGTAACCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108110 GGGGGTCCTGCCTTGTACCCTCCTCCCGAAGGACAGGTATGTAACCCCCT
3200 . : . : . : . : . :
3111 GGACTCTCTTGATCTTGACAACACTCAGCTGGACTTTGTGGCTATTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108160 GGACTCTCTTGATCTTGACAACACTCAGCTGGACTTTGTGGCTATTCTGG
3250 . : . : . : . : . :
3161 ATGAGCCCCAGGGGCTGAGTCCTCCTCCTTCCCATGATCAGCGGGGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108210 ATGAGCCCCAGGGGCTGAGTCCTCCTCCTTCCCATGATCAGCGGGGCAGC
3300 . : . : . : . : . :
3211 TCTGGACATACCCCACCTCCCTCTGGGCCCCCCAACATGGCTGTGGGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108260 TCTGGACATACCCCACCTCCCTCTGGGCCCCCCAACATGGCTGTGGGCAA
3350 . : . : . : . : . :
3261 CATGAGTGTCTTACTGAGATCCCTACCTGGGGAAACAGAATTCCTCAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108310 CATGAGTGTCTTACTGAGATCCCTACCTGGGGAAACAGAATTCCTCAACT
3400 .
3311 CTAGTGCC
||||||||
108360 CTAGTGCC