seq1 = pF1KE0187.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KE0187/gi568815596f_32178156.tfa (gi568815596f:32178156_32405623), 227468 bp

>pF1KE0187 732
>gi568815596f:32178156_32405623 (Chr2)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-233  (112328-112481)   100% ->
234-405  (114022-114193)   100% ->
406-483  (120079-120156)   100% ->
484-597  (123227-123340)   100% ->
598-732  (127334-127468)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCCTCCGGGCCCGCCCCCGGCCTATGCCCCCACTAACGGGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCCTCCGGGCCCGCCCCCGGCCTATGCCCCCACTAACGGGGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCTTTGTCTCCTCAGCAGACGCGGAAG         ATCTCAGTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CACCTTTGTCTCCTCAGCAGACGCGGAAGGTG...AAGATCTCAGTGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAATAGCATCCCCAGATGTCAAATTAAATCTTGGTGGAGATTTTATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112340 CAATAGCATCCCCAGATGTCAAATTAAATCTTGGTGGAGATTTTATCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATCTACAGCTACTACATTTCTGAGACAAAGAGGTTATGGCTGGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112390 GAATCTACAGCTACTACATTTCTGAGACAAAGAGGTTATGGCTGGCTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGTTGAAGATGATGATCCTGAAGATAACAAGCCACTCTT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 112440 GGAAGTTGAAGATGATGATCCTGAAGATAACAAGCCACTCTTGTA...TA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    234  GGAAGAATTGGACATTGATCTAAAGGATATTTACTACAAAATCCGATGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114021 GGGAAGAATTGGACATTGATCTAAAGGATATTTACTACAAAATCCGATGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTTTGATGCCAATGCCATCACTTGGTTTTAATAGACAAGTGGTGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114071 GTTTTGATGCCAATGCCATCACTTGGTTTTAATAGACAAGTGGTGAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAATCCTGACTTTTGGGGTCCTCTGGCTGTTGTTCTTTTCTTTTCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114121 CAATCCTGACTTTTGGGGTCCTCTGGCTGTTGTTCTTTTCTTTTCCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TATCATTATATGGACAGTTTAGG         GTGGTCTCATGGATTATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 114171 TATCATTATATGGACAGTTTAGGGTA...AAGGTGGTCTCATGGATTATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCATTTGGATATTTGGTTCACTAACAATTTTCTTACTGGCCAGAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120097 ACCATTTGGATATTTGGTTCACTAACAATTTTCTTACTGGCCAGAGTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGTGGAGAA         GTTGCATATGGCCAAGTCCTTGGAGTTATAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120147 TGGTGGAGAAGTA...CAGGTTGCATATGGCCAAGTCCTTGGAGTTATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GATATTCATTACTTCCTCTCATTGTAATAGCCCCTGTACTTTTGGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123258 GATATTCATTACTTCCTCTCATTGTAATAGCCCCTGTACTTTTGGTGGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGATCATTTGAAGTGGTGTCTACACTTATAAAA         CTGTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123308 GGATCATTTGAAGTGGTGTCTACACTTATAAAAGTA...AAGCTGTTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGTTTTGGGCTGCCTACAGTGCTGCTTCATTGTTAGTGGGTGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127342 TGTGTTTTGGGCTGCCTACAGTGCTGCTTCATTGTTAGTGGGTGAAGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAAGACCAAAAAGCCTCTTCTGATTTATCCAATCTTTTTATTATACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127392 TCAAGACCAAAAAGCCTCTTCTGATTTATCCAATCTTTTTATTATACATT

    750     .    :    .    :    .
    706 TATTTTTTGTCGTTATATACTGGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 127442 TATTTTTTGTCGTTATATACTGGTGTG